24小时热门版块排行榜    

查看: 259  |  回复: 2
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 minmin_0082003 的 14 个金币

minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁

[交流] 【求助】固定不了结构,错误为ERROR: sorry, constraint type Position not impleme 已有1人参与

输入文件的固定部分为
AtomicCoordinatesFormat Ang

%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  0.003996234   -0.002307227    0.999989353 1
  0.003996234   -0.002307227    8.063812162 1
  1.445893027    0.830172274    5.709204559 1
  0.003996234    1.662651776    3.354596956 1
  2.887789820   -0.002307227    0.999989353 1
  2.887789820   -0.002307227    8.063812162 1
  4.329686613    0.830172274    5.709204559 1
  2.887789820    1.662651776    3.354596956 1
  5.771583406   -0.002307227    0.999989353 1
  5.771583406   -0.002307227    8.063812162 1
  7.213480199    0.830172274    5.709204559 1
  5.771583406    1.662651776    3.354596956 1
-1.437900558    2.495131277    0.999989353 1
-1.437900558    2.495131277    8.063812162 1
  0.003996234    3.327610779    5.709204559 1
-1.437900558    4.160090280    3.354596956 1
  1.445893027    2.495131277    0.999989353 1
  1.445893027    2.495131277    8.063812162 1
  2.887789820    3.327610779    5.709204559 1
  1.445893027    4.160090280    3.354596956 1
  4.329686613    2.495131277    0.999989353 1
  4.329686613    2.495131277    8.063812162 1
  5.771583406    3.327610779    5.709204559 1
  4.329686613    4.160090280    3.354596956 1
-2.879797351    4.992569782    0.999989353 1
-2.879797351    4.992569782    8.063812162 1
-1.437900558    5.825049283    5.709204559 1
-2.879797351    6.657528785    3.354596956 1
  0.003996234    4.992569782    0.999989353 1
  0.003996234    4.992569782    8.063812162 1
  1.445893027    5.825049283    5.709204559 1
  0.003996234    6.657528785    3.354596956 1
  2.887789820    4.992569782    0.999989353 1
  2.887789820    4.992569782    8.063812162 1
  4.329686613    5.825049283    5.709204559 1
  2.887789820    6.657528785    3.354596956 1
  6.863709387   -2.478773934   14.378322217 3
  5.668403242   -2.531756860   15.098161834 3
  6.840822784   -2.522024426   12.982851457 3
  7.770774051   -2.480803597   12.422813565 2
  4.450208749   -2.627990414   14.422529723 3
  5.622628292   -2.618257980   12.307219345 3
  3.520257482   -2.669211244   14.982567615 2
  4.427322146   -2.671240905   13.027058962 3
  3.479564859   -2.746110766   12.501416086 2
  7.811466674   -2.403904073   14.903965093 2
  5.597387816   -2.665958556   10.768165229 4
  5.578320785   -2.701992284    9.605540764 3
  5.692496422   -2.486224492   16.567258945 4
  5.469941897   -1.404116075   17.109479974 5
  5.933793082   -3.532913187   17.167851556 5
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

%block GeometryConstraints
Position 1
position from 3 to 5
position from 5 to 9
position from 11 to 13
position from 15 to 17
position from 19 to 21
position from 23 to 25
position from 27 to 29
position from 31 to 33
position from 35 to 36
center
%endblock GeometryConstraints
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anhui_dali

金虫 (小有名气)

帮你顶一下,期待高手!
2楼2010-01-19 15:22:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
qasd(金币+3):谢谢 2010-04-05 09:10
minmin_0082003(金币+1):谢谢,我把大写P改成小写就好了 2010-04-05 10:44
使用zmtrix,如下:
%block Zmatrix                                                               
cartesian                                                                     
4     0.832500     1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     0.832500     4.325700     0.070000    0    0    0                       
4     0.832500     7.209500     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     0.000000     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     2.883800     0.070000    0    0    0                       
4     3.329900     5.767600     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400    -1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400     1.441900     0.070000    0    0    0                       
4     5.827400     4.325700     0.070000    0    0    0                       
1     3.602290     1.731278     6.212320    1    1    1                     
1     3.319832     2.314888     7.483680    1    1    1                       
1     2.095981     1.995008     8.160953    1    1    1                       
1     1.179880     1.055287     7.579063    1    1    1                       
1     1.463109     0.470284     6.307043    1    1    1                       
1     2.686364     0.792157     5.629784    1    1    1                       
2     4.560824     2.006388     5.644557    1    1    1                       
2     4.060912     3.044923     7.962504    1    1    1                       
2     0.218799     0.778868     8.141618    1    1    1                       
2     0.720051    -0.260182     5.831012    1    1    1                       
2     2.264637     3.524194     9.544223    1    1    1                       
2     0.774280     2.665518     9.602215    1    1    1                       
2     4.021096     0.084236     4.221899    1    1    1                       
2     2.491712    -0.710195     4.216641    1    1    1                       
3     1.840356     2.531978     9.498710    0    0    1                       
3     2.958183     0.262423     4.292613    0    0    1                     
4     2.438337     1.576108     2.385995    0    0    1                       
4     2.578104     1.329674    11.405459    0    0    1                       
4     1.665000     0.000000    13.722500    0    0    0                     
4     1.665000     2.883800    13.722500    0    0    0                       
4     1.665000     5.767600    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400    -1.441900    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400     1.441900    13.722500    0    0    0                     
4     4.162400     4.325700    13.722500    0    0    0                       
4     6.659800    -2.883800    13.722500    0    0    0                     
4     6.659800     0.000000    13.722500    0    0    0                       
4     6.659800     2.883800    13.722500    0    0    0                       
%endblock Zmatrix            
第一列是元素序号,后面三列是相应的原子的cartesian坐标,后面的0表示固定相应的自由度,1表示放开相应的自由度!这个你可以从手册找到!我用过这种固定方法,并且,还可以加限制!
弘德明志博学笃行
3楼2010-04-05 00:05:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 minmin_0082003 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见