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lbambool木虫 (著名写手)
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[交流]
【求助】MS在LINUX下的安装问题 已有3人参与
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手边有四台四核8G内存的 PC，操作系统是centos 4.7,update后版本为4.8，RSH和SSH免认证登录配置没有问题。 该 组机器用于MS的并行计算，用了大概4年左右，以前使用一直没有什么问题，前段发现并行有问题，想重新配置一下，顺便升级一下版本。先试了一下MS4.4，按帮助里说的先加上了glibc-2.3.4-2.41 (32-bit and 64-bit)、hpmpi-2.02.05.01-20070708r.x86_64、libgcc-3.4.6-10 (32-bit and 64-bit)、compat-libstdc++-33-3.2.3-47.3 (32-bit and 64-bit)等补丁和HPMPI，然后切换到msi用户.Install --type cluster，安装路径为/home/msi/ms44,所有模块全部安装，临时文件夹设在用户目录下的tmp里，tmp文件夹各机独立，使用命令mount -o sync,hard 主节点:/home/msi/ms44 /home/msi/ms44将MS44共享给其他计算节点。修改machines.LINUX,加上其他计算节点名和CPU数，修改Gateway/root_default/dsd/conf/gw-info.sbd和gwparams.cfg中CPU总数，安装licenses，启动网关，所有安装过程都正常，未有出错提示，但提交任务时发现单机可以四核计算，并行总是出错，提示网关超时，原因未明。 更换4.2和4.0的版本也是一样的问题，提交多机并行任务就提示网关超时后退出。 今天把原来所以安装全清理后重新安装MS4.0，发现了一个新的问题，用dmol3可以多机并行计算，没有任何错误，但用castep却无法计算，提交任务就失败退出，出错信息如下，请帮忙分析一下原因。 Label "calculate_ELF" not in keyword list Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting... Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting... Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting... expr: syntax error expr: syntax error /home/msi/ms40/Gateway/root_default/dsd/../../../share/bin/create_appfile.sh: line 74: [: =: unary operator expected expr: syntax error expr: syntax error MPI Application rank 0 exited before MPI_Finalize() with status 1 |
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lbambool
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ice_rain(金币+2,VIP+0):奖励讨论 1-20 22:47
ice_rain(金币+2,VIP+0):奖励讨论 1-20 22:47
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问题解决了！ 错在这里，在mount 的时候，我从帮助文件里直接复制了 mount -o sync,hard 节点名:/home/msi/Accelrys /home/msi/Accelrys 而我在翻以前的笔记时发现我用的是 mount -t nfs 主节点名:/home/msi/Accelrys /home/msi/Accelrys 参数不一样，按以前的操作方法做一下后发现问题解决，可以并行计算了。 查了一下 -t 指定档案系统的型态，通常不必指定。mount 会自动选择正确的型态。 -o sync 在同步模式下执行。 -o async 打开非同步模式，所有的档案读写动作都会用非同步模式执行。 不知道我出错是因为-t 和-o参数的不同引起的，还是命令里少了NFS引起的，以后再试一下看到底是哪的错。 感谢前面几位朋友的关注。 [ Last edited by lbambool on 2010-1-20 at 18:57 ] |
16楼2010-01-20 18:55:56
lbambool
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fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 1-17 17:57
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现在怀疑几个方面的问题： １.ｌｉｃｅｎｓｅｓ的问题，但换过几个都没有解决问题，相同的ｌｉｃ在ｗｉｎｄｏｗｓ下可用。 2.网络问题，交换机，网线都更换过，网卡和网卡驱动未换 3.操作系统版本问题，MS４４里写明支持Red Hat Enterprise Linux AS, ES, and WS - 4.6 and 4.7、Red Hat Enterprise Linux - 5.1 and 5.2，我用的是CENTOS4.7和RHEL的4.7应该是一样的，但更新后变成4.8，会不会是这个问题？更换MS版本后与MS支持列表里的操作系统也不完全相符，这可能是一个原因。 大家觉得还有什么可能的原因帮我想一想啦，金币不够我再追加。 |
2楼2010-01-15 13:58:26
lbambool
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3楼2010-01-15 18:16:47
lbambool
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4楼2010-01-15 22:05:24