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lilonghelang铜虫 (初入文坛)
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[交流]
【求助/交流】生物信息学
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一、 某一GenBank数据库记录（记录Y17186） 1）这是否为一条编码蛋白质的序列？如果是，该序列编码什么蛋白？ 2）该序列分离自何种生物体？ 3）对该序列进行BLASTN搜索：返回多少序列？ 4）对该序列进行BLASTX搜索，并与BLASTN的搜索结果进行比较：两者有何差别？为什么？ 5）对该序列进行PSIBLAST搜索：搜索结果与上面的BLAST搜索结果有何差异？ 6）应根据何种情况来采用这三种不同的搜索策略？ 二、 某天，Prof. Gene在小鼠(Mus musculus)中又发现了一个与有丝分裂相关的基因,通过DNA测序，得到部分序列： GATGAGCTGCTTATCCTACAACGAGAAGTCGGACATCTGGTCCTTGGGCTGCCTGCTGTATGAGCTGTGTGCACTAATGCCTCCCTTTACAGCTTTCAACCAAAAAGAGCTAGCTGGGAAAATCAGGGAAGGGAGGTTCAGGCGCATCCCCTACCGCTACTCTGATGGCTTGAATGACCTCATCACTCGGATGCTGAATTTAAAGGACTACCATCGACCTTCAGTGGAAGAAATTCTGGAGAGCCCTTTGATAGCAGACTTGGTTGCAGAAGAGCAAAGGAGAAATCTGGAGAGGAGAGGACGGCGCTCAGGCGAGCCTTCGAAGCTGCCGGACTCCAGCCCTGTGCTGAGCGAGCTCAAGTTGAAGGAAAGGCAACTGCAGGATCGAGAGCAAGCACTCAGAGCTCGGGAGGACATCCT 1. 这个基因在小鼠中是哪个基因？基因的标识符是什么？这个基因的在基因组上的定位是怎样的？ 2. 这个基因在人中的同源物是哪一个？标识符是什么？ 3. 在人中，这个基因标码的蛋白质是什么？具有什么样的功能？细胞亚定位在何处？这个基因是一个酶吗，什么酶？具有什么样的功能结构域？ 4. 这个基因在酵母中保守吗？如果保守，哪个基因是人中的同源物？ 5. 这个基因在人中的同源物，编码的蛋白质有3级结构的信息吗？如果有，给出在PDB中的标识符。 6. 对该序列编码的氨基酸序列进行BLASTp搜索, 选择8个有代表性的序列构建进化树 |
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liuxiaohui0908
禁言 (正式写手)
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4楼2010-01-14 08:24:08
lilonghelang
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 在线: 26分钟
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- 注册: 2009-12-29
- 性别: GG
- 专业: 基础兽医学
3楼2010-01-14 08:18:57
50