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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请教设计全长引物
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001erbao

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请教设计全长引物

请教：
  现在我要设计全长引物，P一个将近2kb的基因的全长（全长序列已知，是做RACE后拼接的，但无全长引物）。
问题是5′端ATG前只有13bp，用软件设计不出来引物。不知道该怎么设计好，请指教！
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1楼 2010-01-11 17:15:28
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001erbao

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 187320891 at 2010-1-14 15:30:
你说的全长产物是包括5‘UTR区吗？如果你要把utr区扩出来的话，可以用5’race的引物啊。
如果你不用要UTR区的话，直接以ATG开始选引物不可以吗？
个人浅见

我找过基因的全长的5’race的引物不在ATG前；
以ATG开头往后数了20bp做为引物正在尝试，可是不确定
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5楼2010-01-16 22:58:32
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yzhang1986

铁杆木虫 (文坛精英)

优秀版主
★
amisking(金币+1,VIP+0): 1-11 22:41
加接头
个人认为
得到全长了，还要干嘛呢
只有把邻居序列测出来

[ Last edited by yzhang1986 on 2010-1-11 at 22:12 ]
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2楼2010-01-11 22:10:31
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001erbao

铜虫 (小有名气)
★
amisking(金币+1,VIP+0): 1-11 22:41
全长是有了（别人做的），但没有全长产物，我要做的是用全长产物做下面关于基因功能的工作。
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3楼2010-01-11 22:35:51
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匿名

用户注销 (初入文坛)
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4楼2010-01-14 15:30:32
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