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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 【求助】GV对成功优化后的大分子模型，无法显示
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liujodan

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】GV对成功优化后的大分子模型，无法显示

小弟经过一个月的研究，终于用ONIOM计算出了一个大模型。好不容易做出来，包括其结构优化，到频率计算。但是问题来了，当我用GV打开时，就出来了一系列问题。请高手调拨~~具体问题如下：
   1. CConnection GLOG: arse_GLOG()
          Failer reading vibrational data

          Last line read=30383
                        (OK)

(当我点击OK 的时候结构是出来了，但是我没有得到红外振动)
     
     2. Unresolvable inconsistency between charge and multiplicity and orbital occupacies. Orbital data will be ignored.
         我点击OK
之后又来了
     CConnection GLOG: arse_GLOG()
          Failer reading vibrational data

          Last line read=30383
                        (OK)
我又点了OK ，出来了一个结构。但是我估计是错误的。

   鉴于以上两个问题。我自己有一点看法，第一个问题，我估计是不是由于我的模型太大，导致无法读取我的振动数据。 第二个问题，是不是我的模型在自旋多重度和电荷上存在问题。
   请高手给予帮助，小弟不甚感激。~
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1楼 2010-01-09 16:00:07
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
你是gaussian 09计算的吧，用旧版本的gaussview打开的？的确会出现这样的错误，关于这点，你可以搜下本版的帖子，有人讨论过旧版本的gaussview打不开gaussian 09的频率的原因和应对方法。
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2楼2010-01-09 20:42:55
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
我google了一下，
From CCL maillist

Dear CCL members,

I want to share a very useful trick I have
discovered recently : if you want to visualize
the frequencies from a Gaussian 09 calculation
with Gaussview 3, you need to replace each
"Atom  AN" in the .out file by "Atom AN". It
looks like the same but there are TWO spaces
between "Atom" and "AN" in the first and ONE in
the second. It is the only thing to do and you
will be able to still use your old Gaussview 3,
at least if you only need to assign vibrational frequencies, as I do...

Hope it will help,

Jean-Christophe Poully
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3楼2010-01-09 20:45:10
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liujodan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 冬天里的骄阳 at 2010-1-9 07:42:
你是gaussian 09计算的吧，用旧版本的gaussview打开的？的确会出现这样的错误，关于这点，你可以搜下本版的帖子，有人讨论过旧版本的gaussview打不开gaussian 09的频率的原因和应对方法。

不是啊，我用的03版的，GV3.07
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4楼2010-01-09 21:23:32
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liujodan

木虫 (正式写手)
我的计算时在LINUX下计算出来的，输出文件是.LOG
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5楼2010-01-09 21:27:03
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
liujodan(金币+5,VIP+0): 1-10 06:07
g03的问题的话就很简单了，从你的提示中明显是频率计算没有完成，建议你单独拿出来做频率计算，这个没完成就无法进行后续的频率分析
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6楼2010-01-10 01:52:21
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