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touchlightly

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】使用远程主机上的VASP进行计算


本人以前是用的CASTEP进行的计算。现在为了计算扩散能垒改用VASP,只是以前从没涉及过,可以说是一头雾水,加上还要把文件传到远程主机上去进行计算,更加茫然。

最近自己找了些SSH,UNIX,VASP的命令和教程在看,但是很迷茫,请教各位高手以下几个问题:

1。怎么根据自己的超胞构型来编译VASP里面的INCAR,KPOINTS等文件?需要用什么编辑工具吗?
2。用SSH怎么样登陆远程主机和上传下载任务阿?
3。听说得先学会UNIX的命令,不知道这个具体用在哪个方面?编辑VASP文件还是用在SSH里面。

谢谢大家。比较着急!
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qli0218

木虫 (小有名气)

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wuli8(金币+3,VIP+0):3ks 1-8 12:59
我就是用远程计算的,也是从头自己弄的
1.我是先用MS建模,然后写道linux上的,用linux自带的vi编辑器就行
2.用SSH Secure Shell远程登录就可以了,这个软件有两个界面,一个是命令提示符的界面用于提交命令,一个是像win里的资源管理器一样,用于传输文件的,很方便的。
3.知道一些基本命令就可以了,找一本工具书,边用就边学了,不是很难的。
希望一起学习,多加讨论。

[ Last edited by qli0218 on 2010-1-8 at 09:56 ]
4楼2010-01-08 09:55:19
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普通回帖

acridine

木虫 (正式写手)

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zxzj05(金币+3,VIP+0):给个红包,谢谢回帖交流 1-12 20:38
VASP没有用过,但一般软件的操作应该都类似。
1. 这些是输入文件吧,用一般的文本工具就可以编辑。
2. 一般的linux直接在终端输入ssh命令就可以登陆了,上传下载可以用scp命令; 估计楼主使用的是win,需要下载ssh插件http://www.openssh.com/windows.html
3. 形象点说ssh连接之后就相当于你在远程使用linux操作主机,因此掌握一些常用的linux命令是必须的, 如一些简单的文件操作等命令, 以及最重要的提交任务的命令等等。如果主机上没有安装好vasp,还要自行编译软件,就更麻烦了。
2楼2010-01-08 02:21:54
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yuxiao_zihan

新虫 (初入文坛)

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wuchenwf(金币+3,VIP+0):谢谢 1-9 21:57
基本的命令就可以了 比如vi用来编辑输入文件,还有一些如scp之类的用来拷贝、压缩、删除文件 登陆远程主机的方法一般主机都应有说明,ssh XXX, telnet XXX之类的,提交任务的方式因机而异
3楼2010-01-08 08:24:32
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touchlightly

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by yuxiao_zihan at 2010-1-8 08:24:
基本的命令就可以了 比如vi用来编辑输入文件,还有一些如scp之类的用来拷贝、压缩、删除文件 登陆远程主机的方法一般主机都应有说明,ssh XXX, telnet XXX之类的,提交任务的方式因机而异

嗯,谢谢你,我会试试看
5楼2010-01-12 18:36:51
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touchlightly

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by yuxiao_zihan at 2010-1-8 08:24:
基本的命令就可以了 比如vi用来编辑输入文件,还有一些如scp之类的用来拷贝、压缩、删除文件 登陆远程主机的方法一般主机都应有说明,ssh XXX, telnet XXX之类的,提交任务的方式因机而异

谢谢了,受教~~ 呵呵
6楼2010-01-12 18:37:11
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幽雅百合

银虫 (小有名气)

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zxzj05(金币+2):谢谢回帖交流 2010-01-27 22:24
aylayl08(金币+1):谢谢解答 2010-01-31 21:43
我用的主要是vnc和ssh,ssh传输文件的时候有个窗口界面,左面是本地,右面是远程机,想要上传或下载直接从左边窗口拖到右边窗口或者右边拖到左边就行,vncviewer登录进去后,就相当于你现在坐在远程机子前面操作,下端有个命令行,也就是shell脚本,常用的Linux命令有cp ,cd,pwd,ls,cd .. ,vi, mkdir,rm, rmdir,
这些命令你就边学边用吧,这样记得比较快,呵呵,用到什么命令就Google一下。我也才开始学,一起哦
7楼2010-01-27 20:14:31
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wjhwoods

铜虫 (正式写手)

这个一定要顶

这个一定要顶
8楼2010-02-05 04:12:07
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wangqin003007

木虫 (小有名气)

我也来学习
9楼2010-03-17 22:14:59
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g_xq96

银虫 (小有名气)

兄弟我们能交流一下吗?


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引用回帖:
Originally posted by qli0218 at 2010-01-08 09:55:19:
我就是用远程计算的,也是从头自己弄的
1.我是先用MS建模,然后写道linux上的,用linux自带的vi编辑器就行
2.用SSH Secure Shell远程登录就可以了,这个软件有两个界面,一个是命令提示符的界面用于提交命令, ...

我想在集群上算碳纳米管的能带,建好模型后,我不知道怎样把模型挂到集群上去跑。兄弟你能给我交流一下吗?我的QQ:705357207
山路十八弯http://blog.sina.com.cn/u/1589327057
10楼2010-03-30 15:28:18
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