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littledwarf铜虫 (小有名气)
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[交流]
【讨论】不对反应物和产物进行预优化有什么后果？(Dmol3的LST/QST)
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| 利用DMol3的LST/QST找有机反应的过渡态，对于双分子反应，对反应复合物前体进行几何结构优化，可能会致使参与反应的两个分子从反应位点跑开，不利于进行后面的preview。如果不对反应物和产物的几何结构进行预优化，直接preview然后再用TS search，这样会有什么后果？ |
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littledwarf
铜虫 (小有名气)
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aylayl08(金币+3,VIP+0):感谢讨论 12-31 13:50
aylayl08(金币+3,VIP+0):感谢讨论 12-31 13:50
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etree的主意不错，可行，我怎么没想到呢，呵呵，试试先！ 几何结构优化计算只会找按分子相互作用最大的方向走，分子间作用可能包括氢键、pi-pi、静电、偶?常技⒎兜禄龋谢锛涞姆从Υ蠖嗍榭鱿虏换崾悄母鲎饔昧Υ缶驮谀母鑫坏惴从Φ摹４蛹扑憬嵌壤此担裰桓龇从Φ哪芾荩紫仁且玫焦商慕峁购途阅芰浚琩mol3的LST/QST法找过渡态就需要从复合物前体和产物的几何结构出发做插值来找的，所以需要一个合理的复合物前体结构，但并不需要对应的就是全局能量最低点。等找到过渡态，最终要获取合理的能垒可以再对算E(过渡态）-E(全局最优点）来获取精确的Ea.个人觉得应该是这样地  [ Last edited by littledwarf on 2009-12-31 at 10:59 ] |
4楼2009-12-31 10:57:19