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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】genebank中序列比对后怎么选择下载序列？
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feng509

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】genebank中序列比对后怎么选择下载序列？

经测序得到了一些序列，是200bp左右的
blast之后出现了很多相似的序列，但是怎么选择下载哪些序列啊？求高人指教。
还有就是我们测得的是200bp的，但是相似的序列大多都是500bp左右的，这个又怎么选择，谢谢O(∩_∩)O谢谢

[ Last edited by amisking on 2009-12-28 at 20:48 ]
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爱，起于微笑，浓于亲吻，逝于泪水
1楼 2009-12-28 20:02:34
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feng509

金虫 (小有名气)
自己先顶一个，求高人指教，有红包 呵呵
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爱，起于微笑，浓于亲吻，逝于泪水
2楼2009-12-28 20:39:00
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qqsvery

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
就是你比对的基因序列比你自己的长一些，你要找Sbjct（电脑查询出来的）的位置，再看那个e值，越小越好！我现在电脑中毒了~资料在我笔记本里~等我修好后给你发一份专门讲比对的资料给你ba~
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谎言和真实在河边洗澡，谎言先洗好，穿走了真实的衣服，真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言，却很难接受赤裸裸的真实。
3楼2009-12-28 22:14:18
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
★
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请楼上的这位虫友给我推荐一些做系统树好一点的软件，十分感谢！
关于下载序列，不知道楼主有没有DNASTAR这个软件，序列比对后会显示很多相似序列，你说你的序列要比别人的短一些，可能他们还带有其他的区段，你就比你需要的这一部分就可以了，下载序列是直接点creat document，选择你所需要的下载就行了
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4楼2009-12-29 10:10:35
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feng509

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 欣晴5832 at 2009-12-29 10:10:
请楼上的这位虫友给我推荐一些做系统树好一点的软件，十分感谢！
关于下载序列，不知道楼主有没有DNASTAR这个软件，序列比对后会显示很多相似序列，你说你的序列要比别人的短一些，可能他们还带有其他的区段，你 ...

楼上的能不能在讲的详细一些啊  比如说对比出来别人的一共500bp，而我的只有200bp，怎么下载  谢谢了
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爱，起于微笑，浓于亲吻，逝于泪水
5楼2009-12-29 12:40:24
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yj-lzx

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫生化熊

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 欣晴5832 at 2009-12-29 10:10:
请楼上的这位虫友给我推荐一些做系统树好一点的软件，十分感谢！
关于下载序列，不知道楼主有没有DNASTAR这个软件，序列比对后会显示很多相似序列，你说你的序列要比别人的短一些，可能他们还带有其他的区段，你 ...

我们刚刚实习了做系统树~~~~呵呵
附件是我们实习的时候用的
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曾经的你/以为只要带着那把青春的长剑和赤子的良心就可以说服自己不出卖理想的灵魂/在最寂寞和不得不流泪的晚上/即使连自己都在笑自己傻/依然拔出怀中的长剑~~~
6楼2009-12-29 12:49:32
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
还请楼上的虫友给我推荐一些具体的软件，呵呵，谢谢！
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7楼2009-12-29 19:15:58
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