应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】liux安装已编译好的gaussian
71/1返回列表
查看: 782  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] 【求助】liux安装已编译好的gaussian

高斯版本已经编译好了的，有exe文件。解压到root文件下，保存在root\g03 下
liux下安装高斯改环境变量的时候提示找不到login文件？
键入source $g03root/g03bsd/g03.login
提示没有该文件


我是按照这个方法来的
1，在终端窗口键入csh,然后回车。
2，再键入setenv g03root /gaussian   这是假定你的g03可执行程序在/gaussian/g03目录中。
3，再键入source $g03root/g03 d/g03.login
4，最后就可以键入g03 输入文件.com& 进行计算了
csh 比bash执行效率好（呵呵，个人认为），但你每新开一个窗口执行一回计算就要重复一次步骤2，3，4；因此
建议你将步骤2，3加入csh.cshrc文件的最后(该文件在/ect目录下);另外，为了提高执行效率，你可以在
/gaussian/g03目录下建立一个名为Defult.Route(注意D，R大写)的空文件并在里面加入
  -p- 2  (处理器数目2)
  -m- 256mw(内存使用2048MB)等等。
回复此楼

» 猜你喜欢
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼 2009-12-28 10:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★
yyx19840628(金币+1,VIP+0):我不知道你在说什么啊？我好像没有问什么执行效率的问题啊！就是按照别人的指示一步步输入，到键入“source $g03root/g03bsd/g03.login”的时候提示找不到文件。 12-28 13:49
csh  比　bash执行效率高，是说脚本的执行效率。
你只使用一个指令 提交一次运算 ，那里能涉及到执行效率问题

高斯是编译好的二进制文件，执行问题于shell解释器有什么关系？
赞一下(1人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2009-12-28 11:56:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
我不知道你在说什么啊？
我好像没有问什么执行效率的问题啊！
就是按照别人的指示一步步输入，
到键入“source $g03root/g03bsd/g03.login”的时候提示找不到文件。
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-12-28 13:49:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★ ★ ★
yyx19840628(金币+4,VIP+0):老师说改环境变量就可以运算了，但我不知道怎么改。你说的那个不是很懂。能不能一步步把命令写下来啊？还有实际进行运算的时候怎么弄？ 12-29 09:43
你找的参考  前提是系统安张了csh  用户默认使用csh
一般而言 Linux默认使用bash 除非你指定， UNIX 比如IBM的使用ksh

你默认的shell是bash 系统会查找.bashrc文件等。怎么会去读你的csh.cshrc (我没有见过这个文档，也不清楚在csh下可以这样使用这个文档，应该是放到/etc/profile吧？）

提供你一个更简单的方法。
什么都不用修改
比如你的g03解压在/root/下 （其实我实在不清楚，没事干，你使用root干什么.?）
一路cd  知道你进入到g03目录
比如这样的目录：/opt/chem/Gaussian/EM64L-G03RevE.01/g03e01/g03
而且你应该能看到很多文件名是*.exe的文件
当然也有这么一个
[abbott@master g03]$ ll g03
-rwxr-x--- 1 root chemical 278K Nov 20  2008 g03
确认建立一个目录
指令：
mkdir -p /root/bin
cd /root/bin
ln -s /opt/chem/Gaussian/EM64L-G03RevE.01/g03e01/g03/g03 .
请注意这里的路径是怎么来的。
然手你单独使用g03就能工作了。
但是也有问题，临时文件比较麻烦！

更好的处理方案高斯的主页上说的很明白的。
注意把setenv更换为 exprot XXXX=YYY
赞一下(1人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2009-12-28 18:21:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
找了一个安装命令，如下：


tar xjvf g09.tar.bz2



export g09root=$PWD



cd $g09root/g09



chmod +x bsd/install



bsd/install



vi ~/.bashrc



加入如下三行：



export g09root=$HOME



export GAUSS_SCRDIR=/tmp



. $g09root/g09/bsd/g09.profile


保存退出
然后 source ~/.bashrc即可


请问vi ~/.bashrc里的~是什么意思？我安装这个命令输入进去，键盘输入不了任何字母，打个字电脑就叫一声。
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-12-29 10:14:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问vi ~/.bashrc里的~是什么意思？我安装这个命令输入进去，键盘输入不了任何字母，打个字电脑就叫一声


请看书！

请仔细看你的键盘....
赞一下(1人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
6楼2009-12-29 10:41:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
有人告诉我了，但目前还是装不上啊。
输入source .bashrc时提示no command

我按照这个做的：用root权限，安装在/home/hgxy/g03文件夹

在/root/.bashrc里面加
export g03root=/home/hgxy
export GAUSS_SCRDIR=/home/hgxy/g03/scratch
source /home/hgxy/g03/bsd/g03.profile
PATH=$PATH:/home/hgxy/g03

然后保存
在/home/hgxy/g03里面建立scratch文件夹
最后在终端中输入source .bashrc或者bash使上述内容生效

你方面的话加我一下，2150308.我用红帽子的
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
7楼2009-12-29 13:36:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyx19840628 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭