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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】特异性基因怎么找？
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】特异性基因怎么找？

要建立一种菌的检测方法，怎么找它的特异性基因？
如果手头上有一段基因，怎么知道这段基因是不是它的特异性基因？
请大家指教！
谢谢！
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1楼 2009-12-27 16:59:46
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
菌鉴定很多文献的，都有特定的方法
你手里的基因，很难是特异基因，还应该从文献上记载的常规方法入手
不过你可以到网上Blast比对一下现在的基因，看看有什么结果
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3楼2010-01-21 21:52:01
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-21 21:52:
菌鉴定很多文献的，都有特定的方法
你手里的基因，很难是特异基因，还应该从文献上记载的常规方法入手
不过你可以到网上Blast比对一下现在的基因，看看有什么结果

谢谢！
我BLAST过了，是特异性的，但是设计出的引物还是能把别的菌扩出来了...
请问可能是什么原因？
另外，以常见基因设计特异性引物应该怎么去做？是要把目的菌的这段基因跟其它菌一一比对，然后找出差异最大的区域设计引物吗？
感谢您的回帖！
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4楼2010-01-22 11:28:29
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amilie030312

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
先Blash该基因，找到一些同源性比较高的基因出来，然后用软件找到特意片段，在这些特异性的片段上设计引物，最后把设计好的引物在Blash一下，就基本OK了。
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5楼2010-01-22 15:14:10
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小虫之老虫

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by amilie030312 at 2010-01-22 15:14:10:
先Blash该基因，找到一些同源性比较高的基因出来，然后用软件找到特意片段，在这些特异性的片段上设计引物，最后把设计好的引物在Blash一下，就基本OK了。

我也是这么做的，可还是把目的菌和非目的菌都扩出来了，...难道这就是传说中的人品...
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6楼2010-01-25 10:35:38
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