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snowmami

新虫 (正式写手)

[交流] 【求助】各位高手帮忙看看这样输入坐标对不对?

我想用wien2k算ZnO。
a=b=3.2497;c=5.2054
90,90,120
在StructGenTM里要输入Inequivalent Atoms:
我的问题是:
(1)Inequivalent Atoms一共有几个,有文献说是四个Zn1(0.3333,0.6667,0); Zn2(0.6667,0.3333,0.5);O1(0.3333,0.3333,0.3826);O2(0.6667,0.3333,0.8826)
我按照这种坐标输入计算,也能进行完SCF,但是通过XcrysDen看ZnO结构,一点也不像!不知这样计算对么?
(2)查资料知道ZnO属于P63mc空间群。wien2k自带的有Wyckoff Positions of Group 表。通过该表 如何写出Zn和O原子的坐标?请说的详细具体一点,我是新手,呵呵!
下面就是wien2k自带的Wyckoff Positions of Group 186 (P63mc)。
Multiplicity         Wyckoffletter         Sitesymmetry         Coordinates
12         d        1       
(x,y,z)         (-y,x-y,z)         (-x+y,-x,z)         (-x,-y,z+1/2)
(y,-x+y,z+1/2)         (x-y,x,z+1/2)         (-y,-x,z)         (-x+y,y,z)
(x,x-y,z)         (y,x,z+1/2)         (x-y,-y,z+1/2)         (-x,-x+y,z+1/2)
6        c        .m.       
(x,-x,z)         (x,2x,z)         (-2x,-x,z)         (-x,x,z+1/2)
(-x,-2x,z+1/2)         (2x,x,z+1/2)
2        b        3m.       
(1/3,2/3,z)         (2/3,1/3,z+1/2)
2        a        3m.       
(0,0,z)         (0,0,z+1/2)
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ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
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wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢 12-27 01:05
我没有用过wien2k,但是我觉得,你可以在xcrysden 中打开晶体文件,然后把它保存为wien2k文件。这样我觉得不会用问题吧。现在的问题是吧晶体文件转化成xcrysden 能认识的文件。
3楼2009-12-26 22:02:11
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anin

木虫 (著名写手)

如来的神掌

★ ★
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ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-26 21:57
wien2k用的是primitive cell,和平时我们用的conventional cell不一样的。
问君能有几多愁,恰似一群太监上青楼~
2楼2009-12-26 21:32:35
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fansw1129

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
TIGERYZZ(金币+3,VIP+0):谢谢回帖交流 12-27 11:58
如果你在输入坐标的时候
选择的p63mc(186号群)
你只需要输入
O(0.33333,0.6667,0.3826)
Zn(0.33333,0.666667,0)
看产生的原子坐标锌和氧的下面是否还有一行坐标
如果有的话,上面的是正确的
如果没有的话,把锌的原子坐标改为(0.6667,0.3333,0.5)

如果你选择P1群的话
应该把你上面所列的两个氧和锌都输入即可
你试试
两者情况下计算得到的结果应该没有太多的差别
但是第一种方法计算的会快些
4楼2009-12-27 09:31:41
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snowmami

新虫 (正式写手)

谢谢fansw1129,金虫,SCF计算出错,再帮忙看看吧!先谢了!

谢谢fansw1129,金虫的提示,但是
输入
O(0.33333,0.6667,0.3826)
Zn(0.33333,0.666667,0)生成了六组位置坐标
Zn:     Pos 1: x=0.3333 y=0.6667 z=0        
            Pos 2: x=0.6666 y=0.3333 z=0.5
            Pos 3: x=0.6667 y=0.3333 z=0.5
            Pos 4: x=0.3333 y=0.6666 z=0
            Pos 5: x=0.3334 y=0.6667 z=0
            Pos 6: x=0.6667 y=0.3334 z=0.5

O:     Pos 1: x=0.3333 y=0.6667 z=0.3826   
        Pos 2: x=0.6666 y=0.3333 z=0.8826
       Pos 3: x=0.6667 y=0.3333 z=0.8826
       Pos 4: x=0.3333 y=0.6666 z=0.3826
       Pos 5: x= 0.3334y=0.6667 z=0.3826
       Pos 6: x=0.6667 y=0.3334 z=0.8826
其中,Pos1,4,5基本相同,Pos2,4,6基本相同
这是什么意思,为什么会生成这么多位置的坐标,而且按照这样输入计算的话,在[SCF]环节会出错,出错提示:
stop error: the required input file ZnO.in0 for the next step could not be found
请再帮忙看看,是什么原因出错?
5楼2009-12-28 09:51:06
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