24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1661  |  回复: 12
【奖励】 本帖被评价5次,作者ice_rain增加金币 3.75
当前主题已经存档。

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


[资源] 【讨论】vasp计算中如何指定结构的对称性

一般我们做优化的时候,好像建好模型,比如,bulk,surface, 一般不会考虑对称性。有时在INCAR文件用了ISYMM=0,打破对称性优化,但是,虽然这个关键词是在不保持对称性的前提下优化,但是可能还是以前的对称性,或许最终的能量最低的结构是一个对称性降低的结构,这种情况在dope中常常遇到,而Jahn-Teller 效应或许直接影响到体系的性质。所以面临的问题就是如果真正打破这种对称性。
  这种优化不能找到最低能量的原因:主要可能是在保持对称前提下找到了一个local 能量最小点,而非全局的最小点。
  我能想到的方法:通过原子的位置来改变对称性。这种方法的问题怎样移动原子才能使体系优化到你想要的对称性,或者让vasp能优化出最低能量结构。(NB:在ADF计算分子团簇时候,是可以指定对称性的,不知道vasp能行不,我没有找到)
  当然对于IBRION的设置可能也会影响到计算的结构。详细的情况可以参看vasp说明书。
   我能想到的就这么多,希望大家针对结构优化进行相应的讨论。分享你的经验。
谢谢大家

[ Last edited by ice_rain on 2009-12-22 at 19:22 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习一下
2楼2009-12-22 19:28:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-22 23:29
正确的寻找极小值是一个很难的数值计算问题,即使在保持对称性之下也不一定能找到最小值。
结构的最优化只能在一个小范围里面调整,无法大范围调整,就像给一个金刚石结构的C,自由弛豫很难变成石墨结构的C
3楼2009-12-22 19:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


是这么回事,所以怎么才能找到合适的结构是要解决的问题。谢谢讨论,
4楼2009-12-22 19:39:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)


自己顶一下,哈哈,还没有解决呢。
5楼2009-12-23 16:23:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

freshgirl

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

支持讨论~
6楼2009-12-23 22:54:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calos818

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

这个问题有意思,取消对称性后好像能去掉一些报错信息
7楼2009-12-27 20:50:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stractor

金虫 (著名写手)


★ 一星级,一般

ISYMM=0是打破空间结构的对称性吗?

[ Last edited by stractor on 2009-12-28 at 19:03 ]
9楼2009-12-28 19:00:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ice_rain

铁杆木虫 (正式写手)



aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢指点 1-4 10:50
引用回帖:
Originally posted by stractor at 2009-12-28 19:00:
ISYMM=0是打破空间结构的对称性吗?

[ Last edited by stractor on 2009-12-28 at 19:03 ]

ISYMM=0 是打破对称性优化的。是不保持对称性的优化。
10楼2009-12-28 19:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

漂泊四方

金虫 (小有名气)


★ ★ ★
ice_rain(金币+3,VIP+0):谢谢交流指导。 12-28 22:52
关于结构对称性,在周期性体系里面去讨论比在团簇中要复杂很多,空间群,K点的对称性都需要考虑。如果只从团簇角度上去理解对称性问题则容易些。通常保持对称性遇到的问题是电子结构的不稳定性。这样一个不稳定性表现在团簇具有虚频,这个也是通常团簇优化后需要去掉对称性做频率和优化来验证的原因。而这样一些电子不稳定性一般可以通过与声子耦合来得到稳定,这个就是J-T效应(团簇)和peries相变(bulk)。团簇里面一般可以通过沿虚频简正模式方向优化消除虚频来得到一个合理的结构。处理团簇为主的程序(gaussian,dmol,adf)都可以指定对称性,从而直接降低对称性到需要的对称性来处理。如果降低对称性优化正好是对着一个无垒过程,那么应该能得到一个局域最小。

对VASP处理类似问题,我以前处理过一个需要保持局域C3对称性的表面结构问题。我的做法是以初始结构比较随机,优化得到初步结果后通过严格调整原子坐标来保持对称性作为起始结构做进一步优化,最后优化的结果基本严格保持C3对称性。先把结构调整到C1,然后提高对称性,选择这种从下而上的做法跟我的初始结构不确定有关系。

另外不知道在VASP中,是否也能够像团簇那样让优化沿着虚频的方向。感觉实现起来是比较困难的。声子部分虽然可以用插件来实现,但是计算量还是不小,特别是引入K点的情况下。
11楼2009-12-28 22:45:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happyjwx

木虫 (小有名气)



aylayl08(金币+1,VIP+0):感谢讨论 1-4 10:51
IBRION=5的时候能算能量的二阶导数,这个能理解为频率值吧?
12楼2010-01-04 10:11:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjhwoods

铜虫 (正式写手)


en, 学习了。

en, 学习了。
13楼2010-02-05 04:34:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
zdhlover8楼
2009-12-28 18:27   回复  
 
相关版块跳转 我要订阅楼主 ice_rain 的主题更新
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见