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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 80金币求拟南芥所有的cDNA序列和基因序列（包括注释）
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yuyin

金虫 (小有名气)

[交流] 80金币求拟南芥所有的cDNA序列和基因序列（包括注释）

现在需要做一个cDNA和对应的基因组序列比对的分析，原来是在NCBI上找一个cDNA序列，并找到对应的基因组序列，然后用DNASTAR比对，这样一个个找感觉实在是太慢了，一个月才找了一千个，有哪位高手能否能将整个拟南芥基因全部下下来，这样我就不用每天一个个的下了。
    我现在只能把所有的mRNA名字下下来。
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黑暗给了我黑色的眼睛，我却用来寻找光明
1楼 2009-12-20 11:53:04
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qixingliu

木虫 (著名写手)

科学巨匠
★
yuyin(金币+1,VIP+0):谢谢关心 12-24 15:30
不清楚哦，我非专业人士
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灵感很重要
2楼2009-12-22 18:23:32
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lzhwin

木虫 (正式写手)
★
yuyin(金币+1,VIP+0):最近被这个困扰太久了，只求get a good ideal，我相信这个问题会解决的。 12-24 15:32
这个需要用程序来实现，需要找生物信息方面的人吧？而且感觉不是很简单的事情。
建议你找你们老板，让他帮你联系人帮你做事情。这种事情个人觉得在论坛里得到帮助的可能性不大
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3楼2009-12-23 16:21:42
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yuyin

金虫 (小有名气)
如果做基因注释方面的，这个数据库是最基本的东西，应该会有的，
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黑暗给了我黑色的眼睛，我却用来寻找光明
4楼2009-12-24 15:13:59
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skyfish1

木虫 (正式写手)
帮你顶下吧，换者换版发发，在专业版里！
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哲人无忧、智者常乐。
5楼2009-12-25 16:52:13
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daqwu

木虫 (小有名气)
★ ★
yuyin(金币+2,VIP+0):有点不太明白，愿闻其详！ 12-26 15:00
楼主，可以直接将你的所有cDNA序列和基因组序列比对，加m 8,可以得到一个列表结果，再不加m 8得到一个序列比对的结果，这样比较着看就方便多了
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6楼2009-12-26 13:00:18
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thinka

铜虫 (著名写手)
楼主去NCBI批量下载就行了
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7楼2009-12-26 23:16:28
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thinka

铜虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
yuyin(金币+60,VIP+0):太感谢你了 12-28 10:44
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/genomes/

下边有ftp downloads

自己下吧
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8楼2009-12-26 23:19:26
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thinka

铜虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuyin(金币+10,VIP+0):你一定是这方面的高手，请问怎么联系？ 12-28 10:45
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/

79G多,我就不帮你下了
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9楼2009-12-26 23:39:18
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