24小时热门版块排行榜    

查看: 834  |  回复: 8
当前主题已经存档。

yuyin

金虫 (小有名气)

[交流] 80金币求拟南芥所有的cDNA序列和基因序列(包括注释)

现在需要做一个cDNA和对应的基因组序列比对的分析,原来是在NCBI上找一个cDNA序列,并找到对应的基因组序列,然后用DNASTAR比对,这样一个个找感觉实在是太慢了,一个月才找了一千个,有哪位高手能否能将整个拟南芥基因全部下下来,这样我就不用每天一个个的下了。
    我现在只能把所有的mRNA名字下下来。
回复此楼
黑暗给了我黑色的眼睛,我却用来寻找光明
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qixingliu

木虫 (著名写手)

科学巨匠


yuyin(金币+1,VIP+0):谢谢关心 12-24 15:30
不清楚哦,我非专业人士
灵感很重要
2楼2009-12-22 18:23:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzhwin

木虫 (正式写手)


yuyin(金币+1,VIP+0):最近被这个困扰太久了,只求get a good ideal,我相信这个问题会解决的。 12-24 15:32
这个需要用程序来实现,需要找生物信息方面的人吧?而且感觉不是很简单的事情。
建议你找你们老板,让他帮你联系人帮你做事情。这种事情个人觉得在论坛里得到帮助的可能性不大
3楼2009-12-23 16:21:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuyin

金虫 (小有名气)

如果做基因注释方面的,这个数据库是最基本的东西,应该会有的,
黑暗给了我黑色的眼睛,我却用来寻找光明
4楼2009-12-24 15:13:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skyfish1

木虫 (正式写手)

帮你顶下吧,换者换版发发,在专业版里!
哲人无忧、智者常乐。
5楼2009-12-25 16:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daqwu

木虫 (小有名气)

★ ★
yuyin(金币+2,VIP+0):有点不太明白,愿闻其详! 12-26 15:00
楼主,可以直接将你的所有cDNA序列和基因组序列比对,加m 8,可以得到一个列表结果,再不加m 8得到一个序列比对的结果,这样比较着看就方便多了
6楼2009-12-26 13:00:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thinka

铜虫 (著名写手)

楼主去NCBI批量下载就行了
7楼2009-12-26 23:16:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thinka

铜虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
yuyin(金币+60,VIP+0):太感谢你了 12-28 10:44
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/genomes/

下边有ftp downloads

自己下吧
8楼2009-12-26 23:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thinka

铜虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yuyin(金币+10,VIP+0):你一定是这方面的高手,请问怎么联系? 12-28 10:45
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/

79G多,我就不帮你下了
9楼2009-12-26 23:39:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuyin 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +15 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 16/800 2026-08-13 17:45 by mhIP3HAX38ZI
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +5 医学老男孩 2026-08-13 12/600 2026-08-13 17:30 by Tide man
[基金申请] 静等基金结果 +6 gjjjzhong 2026-08-10 19/950 2026-08-13 17:28 by Tide man
[文学芳草园] 阿姨 +3 汪汪锅 2026-08-09 3/150 2026-08-13 16:56 by 410610288
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +9 家与远方 2026-08-10 14/700 2026-08-13 09:41 by 臭臭不臭01
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见