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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【讨论】判断是否是同一个异构体
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徐亮8090

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】判断是否是同一个异构体

请问一下，如果用dmol3优化各种异构体，结构相似，结合能相差多少kcal/mol
可以看成同一个结构
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1楼 2009-12-18 20:06:03
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★ ★
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TIGERYZZ(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-20 21:04
结构相似是怎么个概念呢？
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
2楼2009-12-20 20:21:26
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徐亮8090

金虫 (正式写手)
从表面上形状相近
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3楼2009-12-20 21:25:34
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goodtimega

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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TIGERYZZ(金币+2,VIP+0):谢谢交流 12-20 22:00
优化后能量一样，就是同一个结构
否则就不是
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4楼2009-12-20 21:32:37
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢解答 12-21 11:38
楼主应该说的是考虑多种原子组合方式，也就是构成结构的原子数目 一样多，种类相同。要找最低能量结构。如果能量差在毫电子伏特量级可认为没有区别，因为毫电子伏特对应温度大约是几十K. 若能量相差在零点几个电子伏特或者 更大，可认为有明显差别
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我的计算我做主
5楼2009-12-21 10:45:52
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2,VIP+0):感谢提示 12-21 11:37
严格来说，这个应该看你的收敛标准。比如说你的收敛标准能量是10{-4}，那么小数点第4位以后都没有什么意义了。由此而产生的能量差可以忽略不计。当然这种做法是比较严格的。
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6楼2009-12-21 10:54:04
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