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bigcity

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】linux菜鸟求助

准备上centos5.4装Gaussian做计算,有i386版本,有x86-64位版本的,不知道那个更好一些.64位系统计算性能是要好一些,但不知道gaussian软件64位的下不下的到,而且一些常用的软件64位的是不是也不太好找。32位的系统跟它比起来差距到底有多大,本人做有机小分子催化的,计算的原子数不会很多,也就一般的最优构象,反应过渡态的东西。希望大家给个建议。

另外就是Linux分区的问题,我机器的配置是双xeon5404,八核,8g内存,scsi硬盘上有50g左右的空间做系统(有另外的数据硬盘),安装linux的时候,boot,swap,和根分区分别设置多大合适。多谢!
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+5,VIP+0):thank you very much! 12-19 06:55
fegg7502(金币+0,VIP+0):朋友,来我们版做专家吧?行不?我看你经常来逛啊, 12-19 06:56
bigcity(金币+1,VIP+0): 12-19 09:47
bigcity(金币+9,VIP+0): 12-19 09:48
系统分区设定!
现给定swap 16GiB  或者8GiB
然后 根分区 /   ext3    16~20GiB   如果你不会通过连接方式处理(或者根本不明白这句话,可以分派 25GiB, 选择全部安装! )  注意指定是主分区, 不是逻辑分区

不需要/boot分区,  如果你非要按照书上写的, 给200MB

余下的空间, 分给/home  
然后把你机器上的其他磁盘,选择挂载就行!

还有一个方案, 适合比较熟悉系统  有一定使用经验的人!

swap  8GiB ~ 16GiB
然后50G中余下的 都是/

并注意挂在你的数据磁盘!

如果没有用过! 选择安装所有的软件包!

我的机器上 只用64bit软件。 其他不清楚
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2009-12-18 18:53:51
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bigcity

金虫 (正式写手)

晕,评分点错了,
还是很谢谢你的建议
3楼2009-12-19 09:48:37
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tjyl

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
fegg7502(金币+5,VIP+0):thank you very much! 12-21 01:14
linux下64位的软件基本比较全吧。即便有的软件只有32位的,比如QQ for linux等等,可以装好32位的库就能运行。
分区方面。
swap要根据你实际的内存大小,运行时内存的使用情况来决定。
如果内存足够,象征性分配一点给swap就可以了。如果到时觉得内存不够,可能需要加大swap,可以使用文件来作为swap
详见:
http://blog.mypapit.net/2007/07/ ... swap-partition.html
对于你来说可以不单独分/boot分区。
一般/boot分区占用的比较少,几十MB吧,自己多装内核的话占用会增加。所以一般书上都是说100MB,或者200MB。
/分区下分10-15G足够了吧。一般安装系统后用3-5G左右(具体要根据安装的软件来定)。
建议单独分一个/var分区 1-2g左右吧。
其他的分给/home.
引用回帖:
Originally posted by bigcity at 2009-12-18 17:25:
准备上centos5.4装Gaussian做计算,有i386版本,有x86-64位版本的,不知道那个更好一些.64位系统计算性能是要好一些,但不知道gaussian软件64位的下不下的到,而且一些常用的软件64位的是不是也不太好找。32位的系 ...

4楼2009-12-19 12:58:59
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tjyl

金虫 (正式写手)


fegg7502(金币+1,VIP+0):您好朋友,有没有兴趣做计算基础版的专家? 12-21 01:14
如果装intel的64位的编译器等等,也是需要32位的库的。
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2009-12-18 18:53:
系统分区设定!
现给定swap 16GiB  或者8GiB
然后 根分区 /   ext3    16~20GiB   如果你不会通过连接方式处理(或者根本不明白这句话,可以分派 25GiB, 选择全部安装! )  注意指定是主分区, 不是逻辑分区
...

5楼2009-12-19 12:59:43
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bigcity

金虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流2 12-22 00:50
多谢大家的建议。
操作系统解决了,上了centos5.4-x86-64。
不过新问题是gaussian软件的版本呢?现在gaussian都出到09了,倒是也下到了一份。不过想还是先玩转03吧,上网查了一下,03版本也挺多,b,c,d,e系列都代表什么呢?就是一般软件x.x版本号的更新吗?
手头上就有个g03d02em64t的安装文件,就知道是64位,不知道适不适合我的系统。
请行家们多多指点,多谢多谢!

[ Last edited by bigcity on 2009-12-22 at 10:47 ]
6楼2009-12-21 21:00:21
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