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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】linux菜鸟求助
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bigcity

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】linux菜鸟求助

准备上centos5.4装Gaussian做计算，有i386版本，有x86-64位版本的，不知道那个更好一些.64位系统计算性能是要好一些，但不知道gaussian软件64位的下不下的到，而且一些常用的软件64位的是不是也不太好找。32位的系统跟它比起来差距到底有多大，本人做有机小分子催化的，计算的原子数不会很多，也就一般的最优构象，反应过渡态的东西。希望大家给个建议。

另外就是Linux分区的问题，我机器的配置是双xeon5404，八核，8g内存，scsi硬盘上有50g左右的空间做系统（有另外的数据硬盘），安装linux的时候，boot，swap，和根分区分别设置多大合适。多谢！
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1楼2009-12-18 17:25:58
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+5,VIP+0):thank you very much! 12-19 06:55
fegg7502(金币+0,VIP+0):朋友，来我们版做专家吧？行不？我看你经常来逛啊， 12-19 06:56
bigcity(金币+1,VIP+0): 12-19 09:47
bigcity(金币+9,VIP+0): 12-19 09:48
系统分区设定！
现给定swap 16GiB  或者8GiB
然后 根分区 /   ext3    16~20GiB   如果你不会通过连接方式处理（或者根本不明白这句话，可以分派 25GiB， 选择全部安装！ )  注意指定是主分区， 不是逻辑分区

不需要/boot分区，  如果你非要按照书上写的， 给200MB

余下的空间, 分给/home  
然后把你机器上的其他磁盘，选择挂载就行！

还有一个方案， 适合比较熟悉系统  有一定使用经验的人！

swap  8GiB ~ 16GiB
然后50G中余下的 都是/

并注意挂在你的数据磁盘！

如果没有用过！ 选择安装所有的软件包！

我的机器上 只用64bit软件。 其他不清楚
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2009-12-18 18:53:51
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bigcity

金虫 (正式写手)
晕，评分点错了，
还是很谢谢你的建议
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3楼2009-12-19 09:48:37
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tjyl

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
fegg7502(金币+5,VIP+0):thank you very much! 12-21 01:14
linux下64位的软件基本比较全吧。即便有的软件只有32位的，比如QQ for linux等等，可以装好32位的库就能运行。
分区方面。
swap要根据你实际的内存大小，运行时内存的使用情况来决定。
如果内存足够，象征性分配一点给swap就可以了。如果到时觉得内存不够，可能需要加大swap，可以使用文件来作为swap
详见：
http://blog.mypapit.net/2007/07/ ... swap-partition.html
对于你来说可以不单独分/boot分区。
一般/boot分区占用的比较少，几十MB吧，自己多装内核的话占用会增加。所以一般书上都是说100MB,或者200MB。
/分区下分10-15G足够了吧。一般安装系统后用3-5G左右（具体要根据安装的软件来定）。
建议单独分一个/var分区 1-2g左右吧。
其他的分给/home.
引用回帖:
Originally posted by bigcity at 2009-12-18 17:25:
准备上centos5.4装Gaussian做计算，有i386版本，有x86-64位版本的，不知道那个更好一些.64位系统计算性能是要好一些，但不知道gaussian软件64位的下不下的到，而且一些常用的软件64位的是不是也不太好找。32位的系 ...

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4楼2009-12-19 12:58:59
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tjyl

金虫 (正式写手)
★
fegg7502(金币+1,VIP+0):您好朋友，有没有兴趣做计算基础版的专家？ 12-21 01:14
如果装intel的64位的编译器等等，也是需要32位的库的。
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2009-12-18 18:53:
系统分区设定！
现给定swap 16GiB  或者8GiB
然后 根分区 /   ext3    16~20GiB   如果你不会通过连接方式处理（或者根本不明白这句话，可以分派 25GiB， 选择全部安装！ )  注意指定是主分区， 不是逻辑分区
...

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5楼2009-12-19 12:59:43
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bigcity

金虫 (正式写手)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流2 12-22 00:50
多谢大家的建议。
操作系统解决了，上了centos5.4-x86-64。
不过新问题是gaussian软件的版本呢？现在gaussian都出到09了，倒是也下到了一份。不过想还是先玩转03吧，上网查了一下，03版本也挺多，b，c，d，e系列都代表什么呢？就是一般软件x.x版本号的更新吗？
手头上就有个g03d02em64t的安装文件，就知道是64位，不知道适不适合我的系统。
请行家们多多指点，多谢多谢！

[ Last edited by bigcity on 2009-12-22 at 10:47 ]
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6楼2009-12-21 21:00:21
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