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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】甲基化敏感的扩增片断多态性（MASP）
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oilseed6059

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】甲基化敏感的扩增片断多态性（MASP）

请问哪位虫友有甲基化敏感的扩增片断多态性(methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)标记的完整方法，能不能传一下，相关文献也可以的，mhb828@163.com 谢谢
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1楼 2009-12-18 15:12:54
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chenlimei

银虫 (小有名气)
★ ★
oilseed6059(金币+2,VIP+0):xia xie 12-30 01:12
sorry，不了解，帮不上忙，顶一下
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2楼2009-12-29 18:45:03
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★
oilseed6059(金币+3,VIP+0):主要考虑成本和时间 12-30 01:13
－－b
介个方法很不靠谱
建议用通量低但是可以精确到单核苷酸BSP
或者用溶解曲线法之类的
比MSP好很多
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3楼2009-12-29 19:13:32
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
那我还是建议用高分辨率融解曲线法，因为MSP的引物设计非常困难，位点也并不一定适合设计。有些强大的Taq酶，就算有错配照样帮你扩出来。这样做出来的实验结果假阳性和假阴性都很高，几乎是要被抛弃的方法了。
如果你的做高分辨率融解曲线法，如果不需要精确到碱基位点，那么判断曲线峰型就可以了，如果做出来峰型有变，同样的产物可以做T克隆测序精确定位。
时间也是成本，你可得纳入考虑范围
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4楼2009-12-30 09:38:22
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