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oilseed6059

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】甲基化敏感的扩增片断多态性(MASP)

请问哪位虫友有甲基化敏感的扩增片断多态性(methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)标记的完整方法,能不能传一下,相关文献也可以的,mhb828@163.com 谢谢
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chenlimei

银虫 (小有名气)

★ ★
oilseed6059(金币+2,VIP+0):xia xie 12-30 01:12
sorry,不了解,帮不上忙,顶一下
2楼2009-12-29 18:45:03
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
oilseed6059(金币+3,VIP+0):主要考虑成本和时间 12-30 01:13
--b
介个方法很不靠谱
建议用通量低但是可以精确到单核苷酸BSP
或者用溶解曲线法之类的
比MSP好很多
3楼2009-12-29 19:13:32
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

那我还是建议用高分辨率融解曲线法,因为MSP的引物设计非常困难,位点也并不一定适合设计。有些强大的Taq酶,就算有错配照样帮你扩出来。这样做出来的实验结果假阳性和假阴性都很高,几乎是要被抛弃的方法了。
如果你的做高分辨率融解曲线法,如果不需要精确到碱基位点,那么判断曲线峰型就可以了,如果做出来峰型有变,同样的产物可以做T克隆测序精确定位。
时间也是成本,你可得纳入考虑范围
4楼2009-12-30 09:38:22
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