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gleerat

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[交流] 【求助】安装VASP，找不到数学库中的一些文件

我今天安装VASP，数学库设置了之后，进行编译。问题（这是错误的一部分，都是这个类型的，为了节省空间就贴了一部分）：

CODE:

/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32/libmkl_lapack.so: undefined reference to `mkl_pds_blkslv_unsym_pardiso'

/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32/libmkl_lapack.so: undefined reference to `mkl_lapack_cgbtrf'

/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32/libmkl_p4.so: undefined reference to `mkl_pdepl_s_lu_3d_dn'

/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32/libmkl_lapack.so: undefined reference to `mkl_pds_blkldl_omp_pardiso'

/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32/libmkl_lapack.so: undefined reference to `mkl_pds_sp_blklu_unsym_omp_pardiso'

collect2: ld returned 1 exit status

make: *** [vasp] Error 1

我在intel的目录下找不到上述文件，是哪里设置错了呢？
这是我的makefile文件中数学库的设置：

CODE:

#-----------------------------------------------------------------------

# Atlas based libraries

#ATLASHOME= /usr/lib/blas/threaded-atlas

#BLAS=   -L/usr/lib/blas/atlas -lblas

#BLAS=   -L$(ATLASHOME)  -lf77blas -latlas

# use specific libraries (default library path points to other libraries)

#BLAS= $(ATLASHOME)/libf77blas.a $(ATLASHOME)/libatlas.a

# use the mkl Intel libraries for p4 (www.intel.com)

BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_p4  -lpthread

# LAPACK, simplest use vasp.4.lib/lapack_double

#LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_double.o

# use atlas optimized part of lapack

#LAPACK= ../vasp.4.lib/lapack_atlas.o  -llapack -lblas

# use the mkl Intel lapack

LAPACK= -lmkl_lapack

#LAPACK= -L/usr/lib/lapack/atlas -llapack

#-----------------------------------------------------------------------

另外，附上我的makefile文件和出错信息。

[ Last edited by TIGERYZZ on 2009-12-17 at 18:47 ]

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1楼 2009-12-17 18:34:17

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aylayl08(金币+3,VIP+0):感谢解答 12-17 18:54

对于mkl10，根据官方的建议，你可以采用如下设置试一下：
BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread
LAPACK=-L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread
来源：
http://software.intel.com/en-us/ ... -intel-mkl-in-vasp/

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2楼2009-12-17 18:41:17

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gleerat

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引用回帖:

Originally posted by TIGERYZZ at 2009-12-17 18:41:
对于mkl10，根据官方的建议，你可以采用如下设置试一下：
BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread
LAPACK=-L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_ ...

按照你的提示，我修改了数学库部分：

CODE:

# use the mkl Intel libraries for p4 (www.intel.com) 

BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lpthread -lmkl_sequential -lmkl_core

# use the mkl Intel lapack 

LAPACK= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lmkl_lapack -lmkl_sequential -lmkl_core

结果出现下列提示：

CODE:

makefile.linux_gfortran:333: warning: overriding commands for target `xcgrad.o' makefile.linux_gfortran:280: warning: ignoring old commands for target `xcgrad.o'

rm -f vasp

gfortran -o vasp  main.o  base.o     mpi.o      smart_allocate.o      xml.o constant.o jacobi.o   main_mpi.o  scala.o asa.o      lattice.o  poscar.o   ini.o      setex.o     radial.o pseudo.o   mgrid.o    mkpoints.o wave.o      wave_mpi.o  symmetry.o symlib.o   lattlib.o  random.o    nonl.o     nonlr.o    dfast.o    choleski2.o mix.o      charge.o   xcgrad.o   xcspin.o    potex1.o   potex2.o metagga.o  constrmag.o pot.o      cl_shift.o force.o    dos.o      elf.o tet.o      hamil.o    steep.o chain.o    dyna.o     relativistic.o LDApU.o sphpro.o  paw.o   us.o ebs.o      wavpre.o   wavpre_noio.o broyden.o dynbr.o    rmm-diis.o reader.o   writer.o   tutor.o xml_writer.o brent.o    stufak.o   fileio.o   opergrid.o stepver.o dipol.o    xclib.o    chgloc.o   subrot.o   optreal.o   davidson.o edtest.o   electron.o shm.o      pardens.o  paircorrection.o optics.o   constr_cell_relax.o   stm.o    finite_diff.o elpol.o    setlocalpp.o aedens.o    fft3dfurth.o fft3dlib.o -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lmkl_lapack -lmkl_sequential -lmkl_core -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lpthread -lmkl_sequential -lmkl_core 

请问这是怎么回事，怎么解决啊？谢谢了

[ Last edited by gleerat on 2009-12-17 at 19:08 ]

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明察、慎思、笃行

3楼2009-12-17 19:05:46

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calos818

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢参与 12-17 19:55

引用回帖:

Originally posted by gleerat at 2009-12-17 19:05:

按照你的提示，我修改了数学库部分：[code]# use the mkl Intel libraries for p4 (www.intel.com)
BLAS= -L/opt/intel/mkl/10.2.2.025/lib/32 -lmkl_intel -lpthread -lmkl_sequential -lmkl_core
# use th ...

换个编译器看看，这个VASP确实很烦人，耐心些，我自己搞了18天才编译成功的，加油！

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4楼2009-12-17 19:36:04

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