24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 941  |  回复: 9
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 qiangwxr 的 4 个金币

qiangwxr

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】DMol3结构优化时能量发生突变,最终也能收敛

初始结构应该是比较合理的(用分子力学优化过),用DMol3结构优化(高精度),开始30-50步能量一直在单调降低,然后突然增加,再慢慢降低,有的结构会多次突然增加。最终得到能量与最初的能量差不多,甚至更高,但优化成功结束。从结构上看,键角或空间位置有不合理之处。

     不知道有没有人碰到过类似的情况。我的体系包含如下元素:Mg, Cl, C, H, O, Si。优化时的能量渐变图见附件(1是正常收敛的,2、3不正常)。

     正在尝试两个方法:
1. 对结构优化后的结构再优化一次。

2. 对原结构重新进行优化,取中等精度。

[ Last edited by qiangwxr on 2009-12-16 at 11:25 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

没看见附件。。。。
2楼2009-12-16 11:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


qiangwxr(金币+1,VIP+0):谢谢关注。放了一个正常的图和两个感觉不对劲的图对比。 12-16 11:26
现在看见了,好像还是单调降低的啊。
3楼2009-12-16 11:20:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2009-12-16 11:19:
没看见附件。。。。

你的动作太快了,呵呵,我第一次发图片附件,不太熟练。
4楼2009-12-16 11:22:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-16 13:18
这个情况倒是没遇到过。
不知道最终构型和初始构型相比 是否有很大的变化。
5楼2009-12-16 11:26:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)


如果收敛出现突变的话,最终结构往往有不合理之处(如键角和空间位置)。
顺便问一下,能否对特定结构进行频率分析?正在尝试对最终和最初结构分别用DMol3进行单点能量计算,勾选Frequency。不过好像很费时间。
6楼2009-12-16 11:30:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cmwangdft

木虫 (小有名气)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来交流讨论 12-18 00:16
看能量变化大的前后两个结构区别,可能能够发现点东西
妙不可言
7楼2009-12-16 14:01:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

嗯,算频率是个不错的想法。
突变后的构型如果出现虚频,就说明不是真正的极小点
8楼2009-12-16 14:47:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)


看结构和计算吸附能,应该能确定不是最稳定的结构。问题是如何解决这个问题,为什么能量下降了一会又突然升高,是结构优化时步长太大,还是程序算法上的缺陷?以前很多包含金属的体系也碰到过这种问题,当时没深入研究,只计算了吸附能。
9楼2009-12-16 17:00:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenzhao6239

木虫 (正式写手)

★ ★
ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 20:56
qiangwxr(金币+1,VIP+0):谢谢。我也收敛成功,但结构不合理,能量也与初始结构差不多。你觉得优化的结构合理吗? 12-18 08:30
我遇到的情况与你的类似,只是在中间的步骤会凸出一个或者几个小山包,但是最后也是收敛成功了。
10楼2009-12-16 17:08:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qiangwxr 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 304求调剂 +7 castLight 2026-04-16 7/350 2026-04-17 20:05 by 关一盏灯cd
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +11 刘墨墨 2026-04-13 11/550 2026-04-17 15:35 by wanganpin
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 335求调剂 +20 想上岸呀!! 2026-04-12 23/1150 2026-04-17 10:50 by cuisz
[考研] 22408 312求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-14 25/1250 2026-04-16 21:21 by Art1977
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 7/350 2026-04-16 14:31 by zhouxiaoyu
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
信息提示
请填处理意见