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汕头大学海洋科学接受调剂
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qiangwxr

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】DMol3结构优化时能量发生突变,最终也能收敛

初始结构应该是比较合理的(用分子力学优化过),用DMol3结构优化(高精度),开始30-50步能量一直在单调降低,然后突然增加,再慢慢降低,有的结构会多次突然增加。最终得到能量与最初的能量差不多,甚至更高,但优化成功结束。从结构上看,键角或空间位置有不合理之处。

     不知道有没有人碰到过类似的情况。我的体系包含如下元素:Mg, Cl, C, H, O, Si。优化时的能量渐变图见附件(1是正常收敛的,2、3不正常)。

     正在尝试两个方法:
1. 对结构优化后的结构再优化一次。

2. 对原结构重新进行优化,取中等精度。

[ Last edited by qiangwxr on 2009-12-16 at 11:25 ]
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

没看见附件。。。。
2楼2009-12-16 11:19:26
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


qiangwxr(金币+1,VIP+0):谢谢关注。放了一个正常的图和两个感觉不对劲的图对比。 12-16 11:26
现在看见了,好像还是单调降低的啊。
3楼2009-12-16 11:20:16
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qiangwxr

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2009-12-16 11:19:
没看见附件。。。。

你的动作太快了,呵呵,我第一次发图片附件,不太熟练。
4楼2009-12-16 11:22:30
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)


ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢交流 12-16 13:18
这个情况倒是没遇到过。
不知道最终构型和初始构型相比 是否有很大的变化。
5楼2009-12-16 11:26:15
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qiangwxr

木虫 (小有名气)


如果收敛出现突变的话,最终结构往往有不合理之处(如键角和空间位置)。
顺便问一下,能否对特定结构进行频率分析?正在尝试对最终和最初结构分别用DMol3进行单点能量计算,勾选Frequency。不过好像很费时间。
6楼2009-12-16 11:30:46
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cmwangdft

木虫 (小有名气)


zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来交流讨论 12-18 00:16
看能量变化大的前后两个结构区别,可能能够发现点东西
妙不可言
7楼2009-12-16 14:01:17
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

嗯,算频率是个不错的想法。
突变后的构型如果出现虚频,就说明不是真正的极小点
8楼2009-12-16 14:47:45
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qiangwxr

木虫 (小有名气)


看结构和计算吸附能,应该能确定不是最稳定的结构。问题是如何解决这个问题,为什么能量下降了一会又突然升高,是结构优化时步长太大,还是程序算法上的缺陷?以前很多包含金属的体系也碰到过这种问题,当时没深入研究,只计算了吸附能。
9楼2009-12-16 17:00:06
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chenzhao6239

木虫 (正式写手)

★ ★
ice_rain(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 20:56
qiangwxr(金币+1,VIP+0):谢谢。我也收敛成功,但结构不合理,能量也与初始结构差不多。你觉得优化的结构合理吗? 12-18 08:30
我遇到的情况与你的类似,只是在中间的步骤会凸出一个或者几个小山包,但是最后也是收敛成功了。
10楼2009-12-16 17:08:14
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