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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌分类
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biocontrol

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】细菌分类

最近从土壤中分离了100株细菌(可能很多是一样的），想在作下一步试验前初步确定一下，剔除一样的细菌。除了测定序列外，有没有其它好的方法，进行分类和初步鉴定。先感谢一下。
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裸奔进行时...
1楼 2009-12-16 01:18:58
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xuyy1

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢 12-16 11:33
biocontrol(金币+1,VIP+0): 12-16 19:14
可以提取总基因组 酶切一下 条带相同的就可以归为一类了
赞一下(11人) 回复此楼
每次心情跌到谷底,就对自己说:休息一下再重新开始吧
2楼2009-12-16 08:14:12
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一只鱼ddtt

银虫 (小有名气)
★ ★
1949stone(金币+1,VIP+0):谢谢 12-16 11:33
biocontrol(金币+1,VIP+0): 12-16 19:14
做一下生理生化实验，不过可能有点麻烦。
赞一下(11人) 回复此楼
做个有风度的人
3楼2009-12-16 10:32:21
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
★
amisking(金币+1,VIP+0): 12-16 12:29
引用回帖:
Originally posted by xuyy1 at 2009-12-16 08:14:
可以提取总基因组 酶切一下 条带相同的就可以归为一类了

好办法！
我们以前只想到把16s扩出来切一下呢
赞一下(20人) 回复此楼
小木虫之有关部门负责人
4楼2009-12-16 11:59:34
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)
拿什么酶切比较合适？
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5楼2009-12-16 18:37:50
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hudong

金虫 (小有名气)
可以先单向测序，再聚一下，相同的话可以不测
不同的再测另外一向
这样节省不少成本
酶切的误差较大
具体要根据你的实验要求了
供你参考
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6楼2009-12-17 10:09:20
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xiaochongzii

铁虫 (初入文坛)
先RAPD，再进行特定引物的多重PCR
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7楼2009-12-17 12:24:39
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xuyy1

木虫 (正式写手)
我说的那个提取基因组酶切有点麻烦 因为你样品太多 对于这种情况 我们实验室就用菌液PCR 扩增后进行酶切
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每次心情跌到谷底,就对自己说:休息一下再重新开始吧
8楼2009-12-18 19:14:56
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走向明天

铁虫 (初入文坛)

回复最近从土壤中分离了100株细菌(可能很多是一样的

先用稀释分离法分离，然后显微镜电镜观察形态特征，试一下，比较麻烦……
赞一下 回复此楼
9楼2009-12-19 16:51:56
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unameder

木虫 (小有名气)
同意8楼的
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10楼2009-12-20 08:55:01
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