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daifeng

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】基因组DNA电泳条带呈月牙形的原因

各位虫友,本人在用试剂盒提完基因组DNA后,跑0.8%的琼脂糖电泳(70V,50mA),结果两次都呈月牙型,不知原因为何,很是苦恼。烦请各位高手帮帮忙,帮我分析一下原因,万分感谢(电泳图在附件中)
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
盐浓度太大,或者是TBE太久了
不过反正无所谓啦,普通做做PCR没问题的
2楼2009-12-15 23:36:19
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
胶浓度高点,然后电压再稍微低点试试看
不孝有三,读博为大!
3楼2009-12-16 00:09:02
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士

用2.0的胶试试看,电压设60,多跑一会
不孝有三,读博为大!
4楼2009-12-16 00:09:57
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daifeng

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yidaqunyan at 2009-12-16 00:09:
胶浓度高点,然后电压再稍微低点试试看

我提的是基因组DNA,用2%浓度会不会太大了?另,不知道是不是DNA降解了,才会这样子?
5楼2009-12-16 00:26:31
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daifeng

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by daifeng at 2009-12-15 23:30:
各位虫友,本人在用试剂盒提完基因组DNA后,跑0.8%的琼脂糖电泳(70V,50mA),结果两次都呈月牙型,不知原因为何,很是苦恼。烦请各位高手帮帮忙,帮我分析一下原因,万分感谢(电泳图在附件中)

嗯……我用的是TAE,而且是新配的。有可能盐浓度高了,下次我用75%乙醇洗三遍试试,谢谢啦
6楼2009-12-16 00:29:28
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xuyy1

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我们提取总基因组时 都用1.0的胶 TBE缓冲液 23kbmarker  跑带时没有出现这样的情况
每次心情跌到谷底,就对自己说:休息一下再重新开始吧
7楼2009-12-16 08:27:16
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axiaoru


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
个人觉得是梳子不平整,或者拔梳子太早,造成点样孔不平整的原因
8楼2009-12-16 08:34:12
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yeyw04

新虫 (小有名气)

会不会是污染了啊,要不是缓冲液出了问题!
9楼2009-12-25 12:55:05
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dy_414

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我感觉可能是胶的密度(0.8)太低~我跑SDS-PAGE的时候出现过类似问题,把浓度弄高一些就好了。
我坚信,rp是攒出来的
10楼2009-12-25 13:45:30
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