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内开展十分必要。
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电子信息杂交策略是依据比较基因组定位结果,充分利用猪EST(expressed sequence tag, EST)数据库的信息资源,借助计算机辅助进行基因的克隆,又称为“silicon cloning”。其基本原理是利用研究深入、标记稠密的哺乳动物基因组保守功能基因的编码区序列(CDS)作为信息探针,在猪EST数据库筛选同源EST(s)(标准:长度≥100bp,同源性75%~95%) ,排除已克隆EST(s)后进行拼接,设计引物获取基因(cDNA) 全长(Altschul 等,1990;Mao等,1998;A田芳等,2000;Cirera 等,2000)。该方法的特点是:(1)是建立在生物信息学分析的基础上,进行同源性比较和计算机辅助克隆新基因,具有快速、简便、直接等优点;(2) 因为该方法在选择候选基因时有很强的目的性,是一种与定位克隆、定位候选克隆策略并列的比较候选基因法;(3)由于该方法是利用的是EST即cDNA部分序列信息,因而能够获得基因(cDNA) 全长(Liang等,2000)。 利用电子信息杂交策略在分离猪基因中的应用才刚起步(Cirera 等,2000),但该方法在人及其它动物基因分离中已经有广泛的应用(Mao等,1998;Bolognese, 等,2000;毕安定等,2000;范玉新等,1999),由此可见,利用电子信息杂交策略分离猪基因将具有良好的应用前景,在国内开展十分必要。 |
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