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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】提取RNA质量检测
汕头大学海洋科学接受调剂
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zplipeng

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】提取RNA质量检测

示图为鄙人提取的RNA电泳结果，
咨询下各位高人，
图中红色箭头所示的为基因组DNA污染吗？还是其他？？？
感谢！
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加油哦↖(^ω^)↗，O(∩_∩)O哈哈~
1楼 2009-12-14 21:40:18
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won7

金虫 (小有名气)
★
zplipeng(金币+1,VIP+0):很感谢！！！ 12-15 12:53
不一定是DNA污染。RNA降解有时也出现这种情况，用DNA酶消化后就可以证明。此外你的RNA也可能存在较多的蛋白质。从结果上看，除了右2外，你的几个样都还算好，可以做下一步实验。
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2楼2009-12-14 22:09:59
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割麦者

木虫 (正式写手)
★
zplipeng(金币+1,VIP+0):谢谢！请高人指明怎样看RNA降解与否？ 12-15 12:57
有可能吧
你的RNA降解也挺厉害的
试试把枪头，离心管什么的用DEPC处理处理
严格控制RNA酶的污染
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3楼2009-12-15 09:13:46
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wwyy0818

新虫 (小有名气)
★
zplipeng(金币+1,VIP+0):十分详细！多谢！！！ 12-15 12:57
红色箭头所指是基因组DNA污染，不是RNA降解，RNA降解了不可能比28s RNA分子量还要大。
另外，你的1，2，3，6 line RNA降解严重，建议不要进一步做下去
4，7 line可以用DNA酶处理一下，效果会好很多
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4楼2009-12-15 11:22:19
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wwyy0818

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
对于RNA降解的判断方法，一般是28SRNA 和18S RNA的亮度比为2：1，至少是28s RNA要比18s RNA的条带要亮。
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5楼2009-12-15 13:21:33
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liyong1981

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看我很久很久以前的图，纯手工自己提取，，
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6楼2009-12-15 13:22:05
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wwyy0818

新虫 (小有名气)
再加一点，电泳跑出来的RNA条带，如果没有降解，只有明显的2条带：28s 和 18s，亮度比约为1.5-2.5：1
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7楼2009-12-15 13:23:42
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wwyy0818

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主若需要详细讲解，可以加我QQ925356623，我做RNA比较多，也许能帮你分析些问题
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8楼2009-12-15 13:28:42
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lzhwin

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主，你跑电泳时间太久了吧？不是变性胶就算提出来没降解跑这么久也没了
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9楼2009-12-15 19:38:01
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