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汕头大学海洋科学接受调剂
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zplipeng

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】提取RNA质量检测

示图为鄙人提取的RNA电泳结果,
咨询下各位高人,
图中红色箭头所示的为基因组DNA污染吗?还是其他???
感谢!
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加油哦↖(^ω^)↗,O(∩_∩)O哈哈~
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won7

金虫 (小有名气)


zplipeng(金币+1,VIP+0):很感谢!!! 12-15 12:53
不一定是DNA污染。RNA降解有时也出现这种情况,用DNA酶消化后就可以证明。此外你的RNA也可能存在较多的蛋白质。从结果上看,除了右2外,你的几个样都还算好,可以做下一步实验。
2楼2009-12-14 22:09:59
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割麦者

木虫 (正式写手)


zplipeng(金币+1,VIP+0):谢谢!请高人指明怎样看RNA降解与否? 12-15 12:57
有可能吧
你的RNA降解也挺厉害的
试试把枪头,离心管什么的用DEPC处理处理
严格控制RNA酶的污染
3楼2009-12-15 09:13:46
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wwyy0818

新虫 (小有名气)


zplipeng(金币+1,VIP+0):十分详细!多谢!!! 12-15 12:57
红色箭头所指是基因组DNA污染,不是RNA降解,RNA降解了不可能比28s RNA分子量还要大。
另外,你的1,2,3,6 line RNA降解严重,建议不要进一步做下去
4,7 line可以用DNA酶处理一下,效果会好很多
4楼2009-12-15 11:22:19
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wwyy0818

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
对于RNA降解的判断方法,一般是28SRNA 和18S RNA的亮度比为2:1,至少是28s RNA要比18s RNA的条带要亮。
5楼2009-12-15 13:21:33
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liyong1981

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看我很久很久以前的图,纯手工自己提取,
6楼2009-12-15 13:22:05
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wwyy0818

新虫 (小有名气)

再加一点,电泳跑出来的RNA条带,如果没有降解,只有明显的2条带:28s 和 18s,亮度比约为1.5-2.5:1
7楼2009-12-15 13:23:42
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wwyy0818

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主若需要详细讲解,可以加我QQ925356623,我做RNA比较多,也许能帮你分析些问题
8楼2009-12-15 13:28:42
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lzhwin

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主,你跑电泳时间太久了吧?不是变性胶就算提出来没降解跑这么久也没了
9楼2009-12-15 19:38:01
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