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aicoral

荣誉版主 (知名作家)

小木虫至尊宝-步入青椒

[交流] 【求助】求助分析版的专家关于多肽测序的问题

本人纯化的小分子肽,经LC-MS之后:
一峰信息:M+1(或M+23)=397
另一峰信息:M+1(或M+23)=453

请教各位:

1,这么判定是"M+1"还是"M+23"?

2,  为何有的正离子有信息,负离子却没有信息?

3,  获得分子量后,在不做氨基酸序列分析或MS/MS条件下,如何利用NCBI搜索其序列?

本人首次做MS鉴定试验,还请各位了解的指点一二,谢谢!
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威之以法,法行则知恩,限之以爵,爵加则知荣。荣恩并济,上下有节。有一种鸟是永远也关不住的,因为它的每片羽翼上都粘满了自由的光辉。
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qingdao-16

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aicoral(金币+10,VIP+0):非常感谢! 12-11 11:27
建议你还是先找本专业书看。

1. 判定是"M+1"还是"M+23"? 首先电脑计算出C、H、O、S、P等有机物中的主要元素可能的原子个数,排列组合后,计算是"M+1"还是"M+23"更符合,电脑自动计算,然后得出参考答案。
2. 做MS时,收集的要么是正离子,要么是负离子。如果测试的是正离子,负离子已经被清除出去了。
3. 关于NCBI,你需要仔细阅读使用说明。输入分子量后,还需输入一些限制条件,如物种等等。
我读书时只测过一次,意见仅供参考。
2楼2009-12-11 08:24:51
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zxz.1982

至尊木虫 (职业作家)

Charles911

★ ★ ★ ★ ★
aicoral(金币+5,VIP+0):非常感谢版主! 12-11 11:27
补充一点
关于第二个问题,我个人觉得楼主的意思是为什么有的化合物在正离子模式下有峰,负离子模式下无峰,相反亦有此情况,这主要与化合物的性质有关,有的化合物只适合正离子模式能电离,有的只适合负离子模式
爱生活爱分析,向植物学习每天成长一点点!欢迎常来基金申请分析版,闲暇之余希望多多逛逛,小木虫的客户有更多优惠
3楼2009-12-11 09:42:41
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aicoral

荣誉版主 (知名作家)

小木虫至尊宝-步入青椒

关于NCBI搜索序列没有了解的吗?
威之以法,法行则知恩,限之以爵,爵加则知荣。荣恩并济,上下有节。有一种鸟是永远也关不住的,因为它的每片羽翼上都粘满了自由的光辉。
4楼2009-12-11 11:27:54
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qingdao-16

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
aicoral(金币+5,VIP+0):再次对您热心的帮助表示感谢! 12-12 15:08
连接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein
在上端protein 处输入分子量,确定。
在Origin处列出了氨基酸的序列。
你试试吧。
5楼2009-12-12 08:26:44
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