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經天

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】蛋白质空间结构研究方法【还原真实的生物体内发生的本质】

现在正在研究一些关于神经受体方面的东西,在文献中经常能够看到一些预测的空间结构图,很多的亚基组合在一起,形成一个离子通道,然后在生物的某个部位发生作用,现在的课题想朝这方面发展,看能不能还原我现在研究的生物一个真实的现象,如过想进行这方面的研究应该从哪里入手,一想到那些空间结构觉得好深奥哦,现在只是拿到了相关的基因,除此之外什么也么有,没有涉及过蛋白水平的研究,怎么样才能够预测那些蛋白的空间结构以及在生物膜上的位置和功能?????????????
有做过的请赐教啊,必有重谢啊!!
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一种与世无争的上进,内在的坚毅和质朴无华的大度!【穷吾一生而追求之!】
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anquren

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 12-10 21:39
經天(金币+1,VIP+0): 12-10 22:30
这个好做,先预测受体的空间结构,在进行模拟或其他分析。
现在已经有不少实验测定的受体的空间结构,为预测受体结构提供了很好的模板。
2楼2009-12-10 18:04:11
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keyanhrc

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
1949stone(金币+2,VIP+0):谢谢交流 12-10 21:39
經天(金币+2,VIP+0): 12-10 22:27
蛋白空间结构的预测好像只能做单一蛋白的,像你这样多种亚基组合成通道的好像不能预测的吧。将这些基因共转细胞后,可以用免疫荧光做亚细胞定位,逐个做某个基因缺少情况下,蛋白定位情况,或许该方法可行,仅供参考!
3楼2009-12-10 18:52:58
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keyanhrc

新虫 (小有名气)

蛋白空间结构的预测好像只能做单一蛋白的,像你这样多种亚基组合成通道的好像不能预测的吧。将这些基因共转细胞后,可以用免疫荧光做亚细胞定位,逐个做某个基因缺少情况下,蛋白定位情况,或许该方法可行,仅供参考!
4楼2009-12-10 18:53:14
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經天

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by keyanhrc at 2009-12-10 18:52:
蛋白空间结构的预测好像只能做单一蛋白的,像你这样多种亚基组合成通道的好像不能预测的吧。将这些基因共转细胞后,可以用免疫荧光做亚细胞定位,逐个做某个基因缺少情况下,蛋白定位情况,或许该方法可行,仅供参 ...

我看的一些文献也是这么做的,细胞共表达以后进行单个基因的定点突变,不过这么做很慢,并且定点突变很不好做,想从另一个角度去做,谢谢啊。
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5楼2009-12-10 22:29:52
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經天

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by anquren at 2009-12-10 18:04:
这个好做,先预测受体的空间结构,在进行模拟或其他分析。
现在已经有不少实验测定的受体的空间结构,为预测受体结构提供了很好的模板。

您说不少实验室测定受体的空间结构,是好几个亚基组合以后的空间结构吗,怎么测的啊,很想去了解一下,请教啊。
一种与世无争的上进,内在的坚毅和质朴无华的大度!【穷吾一生而追求之!】
6楼2009-12-10 22:32:34
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anquren

金虫 (正式写手)


經天(金币+1,VIP+0): 12-14 16:59
引用回帖:
Originally posted by keyanhrc at 2009-12-10 18:52:
蛋白空间结构的预测好像只能做单一蛋白的,像你这样多种亚基组合成通道的好像不能预测的吧。将这些基因共转细胞后,可以用免疫荧光做亚细胞定位,逐个做某个基因缺少情况下,蛋白定位情况,或许该方法可行,仅供参 ...

多亚基的也可以预测,要看情况了,比如通过对接、叠合等。
7楼2009-12-11 11:59:34
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anquren

金虫 (正式写手)


經天(金币+1,VIP+0): 12-14 17:00
引用回帖:
Originally posted by 經天 at 2009-12-10 22:32:


您说不少实验室测定受体的空间结构,是好几个亚基组合以后的空间结构吗,怎么测的啊,很想去了解一下,请教啊。

几个亚基的能不能预测或怎么预测要看具体情况了。这个论坛上做结构预测的人很多。
8楼2009-12-11 12:00:42
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wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
經天(金币+2,VIP+0): 12-14 14:53
經天(金币+1,VIP+0): 12-14 16:59
测结构是当前生物化学/生物物理研究的王冠吧。
非常困难。
有几个膜蛋白结构都是拿了诺贝尔奖的。
生物物理所做的一个结构是nature封面。
http://blanco.biomol.uci.edu/Membrane_Proteins_xtal.html
这里有所有的膜蛋白结构。
9楼2009-12-11 15:38:08
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冬虫夏草1

金虫 (小有名气)

★ ★
經天(金币+2,VIP+0): 12-14 14:53
根据我所学最有效地方法是:
X晶体衍射法和核磁共振相结合测蛋白质三维结构.再用软件还原即可(涉及到生物信息学).也可用气化质谱仪测(一般难度较大,蛋白质很难气化!).
蛋白质的一维结构有氨基酸测序仪呀
倚楼听风雨,淡看江湖路!
10楼2009-12-11 15:57:52
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