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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】读CHGCAR里的数据
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yunml

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】读CHGCAR里的数据

虽然用vesta能很好的看电荷密度，但是不能得到几个相减的电荷密度差。网上有小软件做这个，但我的老是出问题，所以特别想自己拿最原始的数据，自己动手在origin做。

问题是chgcar里面的数据根本读不同，有没有哪位高人能指点下？ 不胜感激。
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一以贯之
1楼 2009-12-04 10:47:13
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yunml

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 灯塔守望者 at 2009-12-4 17:50:
OK，下一步我将在vaspkit中增加提取差分电荷密度数据！

问下，我想用Fe吸附CO后的减去单独优化的Fe表面的，再减去单独CO的可以吗？

网上那个小软件似乎必须得结构参数一样才能减。

非常感谢！
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一以贯之
6楼2009-12-05 09:30:26
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+3,VIP+0):感谢指点 12-4 13:46
chgcar首先输出的是结构信息，然后输出FFT-grid的维度，即NGX，NGY，NGZ，然后输出网格中每一个点的电荷密度，输出的格式在vasp手册里有提到：
WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC)
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2楼2009-12-04 13:24:41
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灯塔守望者

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1,VIP+0):鼓励交流 12-5 16:37
OK，下一步我将在vaspkit中增加提取差分电荷密度数据！
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3楼2009-12-04 17:50:41
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yunml

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by TIGERYZZ at 2009-12-4 13:24:
chgcar首先输出的是结构信息，然后输出FFT-grid的维度，即NGX，NGY，NGZ，然后输出网格中每一个点的电荷密度，输出的格式在vasp手册里有提到：
WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC)

能不能解释一下"WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC) "?  因为我看chgcar里面电荷密度部分每行有五个数据，按照（x,y,z,density）理解好像不对啊。

还有，上面的语句是Fortran写的吗？  多谢了！

CHGCAR 如下：
Fe-CO                                    
   1.00000000000000     
     0.000000    5.732800    0.000000
     0.000000    0.000000    5.732800
    17.166000    0.000000    0.000000
   1   1  24
Direct
  0.500000  0.464705  0.451881
  0.500000  0.641670  0.501367
  0.000000  0.000000  0.000000
  0.000000  0.500000  0.000000
  0.500000  0.000000  0.000000
...

   48   48  144
0.11710375410E+05 0.11082654420E+05 0.93465338201E+04 0.69185564327E+04 0.43845496481E+04
0.23036430807E+04 0.98892296509E+03 0.40174174331E+03 0.23369168341E+03 0.16858018791E+03
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0.16846542258E+03 0.23345974810E+03 0.40125016805E+03 0.98777940755E+03
...

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  0.4917278E-03 -0.1912815E-01  0.8767631E-03 -0.7149171E-03 -0.8271628E-03
-0.2565947E-03  0.2019992E-02  0.9772558E-02 -0.5522550E-02  0.3923657E-01
...
augmentation occupancies  26 138
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  0.2499834E-03  0.2262646E-02  0.5939990E-02  0.3275988E-02  0.3513974E-01
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...
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一以贯之
5楼2009-12-05 09:24:11
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