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lifei_dut

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】采用高斯计算的分子静电势能否真实的反映化合物与生物体的相互作用？

静电势可以反映化合物之间的非共价相互作用。但是我们计算的静电势都是单一分子在真空或者水相中的结果。但是在研究配体-受体相互作用的时候，化合物进入生物体之后，它的静电势可能发生改变。那么我们单纯计算的静电势能否真实的表征相互作用呢？
如果能？是基于什么样的理由呢？

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1楼2009-12-02 10:03:30

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zhou2009

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 12-3 17:37

"化合物进入生物体前后，静电势可能发生变化，而计算的是进入之前的静电势。"

计算的如果仅"是进入之前的静电势"这一种情形,不能反映相互作用。否则只是推断，不是计算。
当然，根据之前的静电势，可以判断化合物什么部位是给电子的，或者什么部位是可以接受电子的，再结合生物体给化合物周围形成的环境来分析给、受的可能情况。

当然最好是：相互作用还是要模拟一个进入生物体后，化合物周围的环境，并进行计算，实际得到化合物进入生物体前后，静电势可能发生的变化。

[ Last edited by zhou2009 on 2009-12-2 at 14:53 ]