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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】建模密度
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金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】建模密度

用Amorphous Cell建模的时候，密度实在查不出来了，怎么确定比较好？是药物小分子
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1楼2009-12-01 15:00:55
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pumf

木虫 (正式写手)
同问，我也在为这个问题发愁呢。
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2楼2009-12-01 16:36:58
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Dream-weaver

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 21:51
synthia模块可以粗略地预测一下
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3楼2009-12-01 16:41:08
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金虫 (小有名气)
★
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 21:51
引用回帖:
Originally posted by Dream-weaver at 2009-12-1 16:41:
synthia模块可以粗略地预测一下

synthia只能预测高分子，小分子是不可以的
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4楼2009-12-01 18:46:31
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daniel2001

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 21:51
可以先赋一个初始值，建好模型后跑一个分子动力学，选用NPT系综，这样等模拟体系平衡后，自然就得到密度了。
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5楼2009-12-01 18:58:29
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金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by daniel2001 at 2009-12-1 18:58:
可以先赋一个初始值，建好模型后跑一个分子动力学，选用NPT系综，这样等模拟体系平衡后，自然就得到密度了。

想起来了，万分感谢！！！
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6楼2009-12-02 08:30:39
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