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kuangyd

[交流] 【求助】平衡分子系统的质量中心速度和温度的关系

Temperature is calculated from the total kinetic energy and the total number of degrees of freedom. For a nonperiodic system:

Eq. 43

(3N-6)*Kb*T/2=求和(mi*vi^2/2)
Six degrees of freedom are subtracted because both the translation and rotation of the center of mass are ignored
这里: N是所以原子的自由度的和,Kb是普朗克常数,T是体统统计温度。

这是MS里面对非周期系统的温度定义的一句话。我想问的是:MS里面将系统质量中心的自由度给减掉了,那么质量中心的速度也不参与温度的统计。对于平衡动力学系统,是这样的吗?请问在哪里可以找到相关的理论支持。对于非平衡动力学系统,当控制恒定的温度的时候,这个肯定是要减掉的。


2,在forcite里面,motion group(定义刚体)的命令不能实现,虽然定义了,但是不起作用,大家有这个经历吗?
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kuangyd

哦,我理解有点错误。正确的理解是仅仅减掉6个质量中心的自由度,所有的原子速率参与温度统计,当然包括质量中心的速度。

在lammps软件里面,对这个质量中心的速度有专门的说法(lammps称它为bias),它采用的是将质量中心的速度从每个原子的速率中减掉,用剩余的速率统计剩余的温度,然后将这个减掉的速率和减掉的温度加回来。
  如果是非平衡系统(比如双层纳米碳管谐振器,一般将一层碳管拉出来到一定位置,然后释放),由于势能和动能在转化,这个质量中心的速率是由势能转化来的,这个质量中心的速率就不能再加回来。
2楼2009-12-01 12:09:49
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打探情报

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
太高深了
打探情报
3楼2009-12-01 12:36:33
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kuangyd


zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励! 12-1 22:05
Kb 是Boltzmann's constant
4楼2009-12-01 12:58:11
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