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javacfish

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian计算CH3NH2的质子化

计算CH3NH2的质子化,即CH3NH3+,怎么用高斯算?
怎么制作输入文件?

是不是不能做质子化?

我的目的是想得到优化的键长,键角,二面角的参数。

我用普通的方法算了一下,发现有个H和N的键长特别的长。

[ Last edited by javacfish on 2009-11-30 at 22:39 ]
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zhou2009

版主 (著名写手)

★
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高斯应是能做这种质子化计算的。

你说“有个H和N的键长特别的长”,可能是H的位置放得不对。
CH3NH2中的 -NH2 应是锥形的,H+应接在锥顶方向的孤对电子处。

我在chem3d的版面输入CH3NH3+,立即显示出它的图形,是一个与CH3CH3一样的结构,按这个结构优化应即成。

[ Last edited by zhou2009 on 2009-12-1 at 09:55 ]
2楼2009-12-01 09:54:28
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★
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javacfish=zhidao_bu?
在mdbbs上回答了。
用gview画CH3NH2后,直接用gview工具栏上的加氢按钮,就直接加上并调整好位置了。记得要确认一下对称性,同时gview默认电荷数0而去调整多重度,这个要手工修改一下。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2009-12-01 10:11:49
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★
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试试这个:

#p 方法 基组 opt

Title

1 1
C                 -0.00000000    0.00000000   -0.81052631
H                 -0.17517729    0.99347977   -1.16719263
H                 -0.77279008   -0.64844787   -1.16719263
H                  0.94796736   -0.34503190   -1.16719263
H                 -0.77278865    0.64844667    1.08613998
H                 -0.17517697   -0.99347794    1.08613998
H                  0.94796562    0.34503127    1.08613998
N                  0.00000000    0.00000000    0.72947369
4楼2009-12-01 13:58:27
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★
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引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2009-12-1 10:11:
javacfish=zhidao_bu?
在mdbbs上回答了。
用gview画CH3NH2后,直接用gview工具栏上的加氢按钮,就直接加上并调整好位置了。记得要确认一下对称性,同时gview默认电荷数0而去调整多重度,这个要手工修改一下。

javacfish=zhidao_bu!!
5楼2009-12-01 14:01:15
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