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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】【求助】哪种软计算分子中原子电量比较准确？
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martin6

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】哪种软计算分子中原子电量比较准确？

兄弟我做的计算想考虑电子的转移，gaussian中的mulliken准吗？
比如我算
HOH
和HONa中的O的电量是否会一致呢？
好像这两个绝对值不一样，哪么有没有什么软件或者方法能够获得直接的比较呢？
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1楼 2009-11-30 21:25:06
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★
martin6(金币+1,VIP+0):谢谢麻烦能告诉具体点的吗？哈里斯方法用的什么软件？ 12-1 07:56
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 22:52
mulliken不准，通常哈里斯方法可能好些
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2楼2009-11-30 21:44:11
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★
martin6(金币+1,VIP+0):非常感谢，NBO里面哪个部分是讲电荷的？里面好像是讲成键比较多，可以多帮我一点么？ 12-1 07:58
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 22:52
引用回帖:
Originally posted by martin6 at 2009-11-30 21:25:
兄弟我做的计算想考虑电子的转移，gaussian中的mulliken准吗？
比如我算
HOH
和HONa中的O的电量是否会一致呢？
好像这两个绝对值不一样，哪么有没有什么软件或者方法能够获得直接的比较呢？

如果是GAUSS，用NBO
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3楼2009-11-30 22:18:32
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agou

金虫 (正式写手)
★
martin6(金币+1,VIP+0):同样的问题，能具体说一下吗？谢谢 12-1 07:59
建议NBO
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小木虫三戒总理事
4楼2009-11-30 22:31:04
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
martin6(金币+1,VIP+0):什么软件？ 12-1 07:59
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 22:52
是要算charge吗
可以用Bader
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5楼2009-11-30 22:34:23
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 12-1 22:52
martin6(金币+2,VIP+0):非常感谢，这个自洽计算的电荷是不是价电子的电荷量？ 12-2 08:25
用VASP算出自洽电荷密度，再用bader分析一下。
具体可见  http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/bader/vasp.php
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6楼2009-12-01 10:33:46
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martin6

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2009-12-1 10:33:
用VASP算出自洽电荷密度，再用bader分析一下。
具体可见  http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/bader/vasp.php

非常感谢，自洽计算中似乎只计算spd轨道的电子，是不是指的是价电子数？给出的total和我们要获得是一样的吗？谢谢
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7楼2009-12-02 08:22:29
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
martin6(金币+1,VIP+0):谢谢 12-2 12:59
引用回帖:
Originally posted by martin6 at 2009-12-2 08:22:

非常感谢，自洽计算中似乎只计算spd轨道的电子，是不是指的是价电子数？给出的total和我们要获得是一样的吗？谢谢

现在核区电荷也可以算
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8楼2009-12-02 09:41:48
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martin6

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2009-12-2 09:41:

现在核区电荷也可以算

能麻烦给篇文献么，或者说的具体一点，我不是很明白，谢谢
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9楼2009-12-02 12:58:55
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
yjmaxpayne(金币+3,VIP+0):感谢提供 12-3 12:00
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/bader/vasp.php

这边说的很详细啊。
References
G. Henkelman, A. Arnaldsson, and H. Jónsson, A fast and robust algorithm for Bader decomposition of charge density, Comput. Mater. Sci. 36, 254-360 (2006).


E. Sanville, S. D. Kenny, R. Smith, and G. Henkelman An improved grid-based algorithm for Bader charge allocation, J. Comp. Chem. 28, 899-908 (2007).


W. Tang, E. Sanville, and G. Henkelman A grid-based Bader analysis algorithm without lattice bias, J. Phys.: Condens. Matter 21, 084204 (2009).
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10楼2009-12-02 13:50:56
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