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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 泛基因组
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iris66

[交流] 泛基因组

老师给布置了作业，让我查一下泛基因组学。
我想请问一下，泛基因组是什么？还有现在的研究现状。
不胜感激！
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1楼 2009-11-30 11:17:42
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09021122

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by iris66 at 2009-11-30 11:17:
老师给布置了作业，让我查一下泛基因组学。
我想请问一下，泛基因组是什么？还有现在的研究现状。
不胜感激！

泛基因组学属于后基因组学的范畴。
下面是一篇关于泛基因组的文章。
希望对你有用！
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雄关漫道真如铁，而今迈步从头越
2楼2009-11-30 13:01:38
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09021122

木虫 (正式写手)
pan-genome这个概念是分子生物学的反映，许多重要的病原体（包括TIGR研究的那些流感、衣原体和肠胃传染物）包含特定基因组的多条链。通过pan-genome来研究这些微生物，科学家能更好地了解新的病原体是如何进行侵染的，还能对特殊情况进行靶向治疗。方法之一是将物种的核心基因组聚集起来，同时研究人员可能排除一个核心基因组，搜寻一些边缘取代基因，边缘基因可以解释为什么特定链具有独一无二的活性。

        TIGR的科学家说pan-genome这个概念也强调了对基因组的传统认识的局限性，研究人员通常用一种"类型"的基因组来描述物种。一般情况下，在自然或实验室条件下很容易获得特异的、典型的基因组。随后科学家在公共数据库中选择已知的基因组来搜寻药物靶、解释生态位以及绘制进化图。那么如何做才能让这些微生物基因组更好地反映事实呢？

        比较基因组学开始发展的时候，TIGR的专家提高了对pan-genomes的注意力。不过现在仍然存在很多问题，尽管一些微生物如GBS有无穷的pan-genomes，但其它物种的pan-genomes却极为有限。比较分析炭疽杆菌的8个样本，Tettelin等发现只有4个基因组能充分表现出它们各自的pan-genome。

        这些结果吸引了科研人员对进化研究更多的注意力，他们期待更为深入地了解特定物种的多样性及其发生机理。
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雄关漫道真如铁，而今迈步从头越
3楼2009-11-30 13:06:02
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