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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】 怎样确定中心距离？
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sw-2384

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】 怎样确定中心距离？

我以金为电极，在中心区域放入一个分子，但这个分子两端是不对称的，是不同种原子，也就是说两侧电极与分子间的距离是不同的（d1和d2)，如果我想算得一个最小能量的中心区域的距离，就有两个变量，d1和d2，那我应该怎么做呢？
谢谢！

[ Last edited by sw-2384 on 2009-12-7 at 09:24 ]
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1楼 2009-11-27 12:27:54
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
sw-2384(金币+1):谢谢参与
sw-2384(金币+1,VIP+0): 11-27 13:27
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 12-7 19:57
我也遇到过同样的问题，
建议的方法：写一个for（a,b）循环，没有优化之前，计算总能。

不过计算结果不仅与距离有关，还与分子结构、电极类型有关
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2楼2009-11-27 12:50:54
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sw-2384

木虫 (正式写手)
可是这个for(a,b)循环怎样写呢？谢谢！
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3楼2009-11-27 13:30:21
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)
★ ★ ★
zdhlover(金币+1,VIP+0):欢迎常来交流讨论 11-27 02:30
sw-2384(金币+1,VIP+0): 11-28 09:39
qasd(金币+1,VIP+0):xiexie~ 12-7 19:58
很简单
看下手册中，有关于计算分子距离与能量的例子
这个要写成2维的，因为变量是两个。
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4楼2009-11-27 19:22:08
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xhsh

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
sw-2384(金币+1):谢谢参与
sw-2384(金币+1,VIP+0): 11-28 09:38
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 12-7 19:49
如果简单点，可以 这样：

计算单个分子到一个电极的距离。也就是，暂时不连接另一个电极。将分子连接到第一个电极，确定距离d1, 然后再单独将分子连接到第二个电极，确定d2，最后再同时把两个电极接上，分子与左边电极的距离为d1，与右边的电极距离为d2。
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5楼2009-11-27 19:49:40
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)
★ ★ ★
sw-2384(金币+1,VIP+0): 12-7 09:25
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 12-7 19:58
两个问题需要你考虑，1，选取什么样的电极，有线的lih2li，有面的FeMgoFe，哈哈，该选什么样的电极呢？2，如何确定分子构型和分子与电极的“接触（包括键长度和整个分子空间的旋转）”，这个过程涉及到结构优化，以及以后性质的计算。
需要你做尝试计算啦，嘻嘻~，建议首先把lih2li那个例子弄熟悉了再....
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6楼2009-12-05 22:14:38
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)
4楼的朋友说详细点，你的具体实施步骤是什么。谢谢
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7楼2009-12-05 22:16:17
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