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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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叔扬

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】蛋白质的小分子配体的鉴定

大家好!
我有一个蛋白质,它应该结合有一个小分子配体。我的任务是要鉴定出该配体。
根据文献报道,我的蛋白质同家族的一些蛋白质分别可以结合如下配体:cAMP或cGMP,GTP,异亮氨酸或缬氨酸等支链氨基酸,α-酮戊二酸,一些色素分子,等等。

首先基本能肯定我的蛋白质的配体不是色素。理由有二。一、表达的蛋白质没有颜色;二、一般蛋白质和色素是共价结合,而我的蛋白质的功能是传递信号的,也就是说它和其配体不是共价结合而应该是非共价结合。

我的蛋白质同家族的一些蛋白质的配体,基本上都是通过蛋白质晶体衍射而得以鉴定出来的。
然而我的蛋白质没有得到结晶,所以无法通过这种方法实现。
大家有什么看法呢?

假设我的蛋白质的配体是cAMP,我该怎样把它从蛋白质中分离纯化并浓缩出来,加以鉴定呢?
而或该配体是支链氨基酸,我又该怎样做呢?
感谢各位了,谢谢!

[ Last edited by 叔扬 on 2009-11-27 at 10:59 ]
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小子无识
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pal2004

木虫 (正式写手)

不知你是用什么方法判断你的蛋白上结合了小分子配体的?
2楼2009-11-27 13:35:00
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叔扬

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by pal2004 at 2009-11-27 13:35:
不知你是用什么方法判断你的蛋白上结合了小分子配体的?

第一,这个蛋白质的家族已经有不少成员被报道结合了小分子配体,该家族在生物信息学分析中被认为是配体结合蛋白。
第二,当我在表达纯化出这个蛋白质以后,发现其分子量比预期的偏大一些。有可能是因为结合了小分子配体。

尽管该蛋白质结合了小分子配体这句话,还不是一个结论,而尚属一个推测,但也是一个课题。所以我在这里请教鉴定该配体(如果存在)的方法。谢谢!

[ Last edited by 叔扬 on 2009-11-27 at 16:39 ]
小子无识
3楼2009-11-27 16:32:03
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