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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】用ms到vasp里的poscar文件
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lishufei

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】用ms到vasp里的poscar文件

我想用ms 的结构转化成vasp 输入文件的poscar
比如LiBH4
我用ISCD得到两个一个是Z为2的一个是Z为4的。我应该用哪个？下面哪些数字在ms里是有用的。具体在ms里怎样操作才能得到poscar要的数字。
我是才接触计算，我用的是ms4.0，麻烦把具体操作步骤给我写的详细点。
非常谢谢 ！！
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1楼 2009-11-26 16:04:45
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长
★ ★
lishufei(金币+1,VIP+0): 11-26 19:14
aylayl08(金币+1,VIP+0):感谢区长提示 12-12 19:55
如果你搜索本版or计算基础版里面的精华帖 肯定有帖子可以解决你这个问题
因为我曾经写过一个很详细的帖子
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2楼2009-11-26 19:05:01
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lishufei

金虫 (正式写手)
给我个链接好吗
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3楼2009-11-26 19:19:52
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
★
lishufei(金币+1,VIP+0): 11-26 21:12
搜索都不想搜索啊
你也太懒了吧
赞一下(2人) 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
4楼2009-11-26 20:04:52
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freer007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lishufei(金币+1,VIP+0): 11-26 21:12
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 11-30 20:20
链接：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=646969&view=old
另外一种方法：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1376166
要多用搜索。
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5楼2009-11-26 20:12:10
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lishufei

金虫 (正式写手)
这己个帖子我看过我现在以H2O-2为例
%BLOCK LATTICE_CART

       3.300000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000

       0.000000000000000       3.300000000000000       0.000000000000000

       0.000000000000000       0.000000000000000       3.300000000000000

%ENDBLOCK LATTICE_CART



%BLOCK POSITIONS_FRAC

  H   0.1700000017881393   0.1700000017881393   0.1700000017881393

  H  -0.1700000017881393  -0.1700000017881393   0.1700000017881393

  H  -0.1700000017881393   0.1700000017881393  -0.1700000017881393

  H   0.1700000017881393  -0.1700000017881393  -0.1700000017881393

  H   0.6700000017881393   0.6700000017881392   0.3299999982118607

  H   0.3299999982118607   0.3299999982118607   0.3299999982118606

  H   0.6700000017881393   0.3299999982118606   0.6700000017881393

  H   0.3299999982118607   0.6700000017881393   0.6700000017881393

  O   0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000

  O   0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.5000000000000000

%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
这是ms的到的
我的poscar是
H2O _2
1

       3.300000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000

       0.000000000000000       3.300000000000000       0.000000000000000

       0.000000000000000       0.000000000000000       3.300000000000000

8 2
direct

         0.1700000017881393   0.1700000017881393   0.1700000017881393

               -0.1700000017881393  -0.1700000017881393   0.1700000017881393

                -0.1700000017881393   0.1700000017881393  -0.1700000017881393

              0.1700000017881393  -0.1700000017881393  -0.1700000017881393

              0.6700000017881393   0.6700000017881392   0.3299999982118607

              0.3299999982118607   0.3299999982118607   0.3299999982118606

              0.6700000017881393   0.3299999982118606   0.6700000017881393

              0.3299999982118607   0.6700000017881393   0.6700000017881393

             0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000

            0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.5000000000000000
可是我vasp运算是出错
vasp.4.6.28 25Jul05 complex
POSCAR found :  0 types and    0 ions
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               000000000048F09D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000415B29  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000041184A  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003238E1D8B4  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000041176D  Unknown               Unknown  Unknown
[gan@localhost h2o1]$
帮我分析分析原因
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6楼2009-11-26 21:12:20
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lishufei

金虫 (正式写手)
另外我的incar是 PREC = Normal    ! standard precision
ENMAX = 400      ! cutoff should be set manually
ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.1
IBRION = 1       ! use DIIS algorithm to converge
NFREE = 2        ! 2 independent degrees of freedom
NSW = 10         ! 10 ionic steps
EDIFFG = -0.02   ! forces smaller 0.02 A/eV
kpoints是Gamma-point only
1        ! one k-point
rec       ! in units of the reciprocal lattice vector
0 0 0 1  ! 3 coordinates and weight
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7楼2009-11-26 21:15:58
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zhangdelin0000

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
lishufei(金币+1,VIP+0): 11-27 18:20
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie~ 11-30 20:20
这个必须要对其，还有那些原子要固定都必须标明
0.1700000017881393   0.1700000017881393   0.1700000017881393

               -0.1700000017881393  -0.1700000017881393   0.1700000017881393

                -0.1700000017881393   0.1700000017881393  -0.1700000017881393

              0.1700000017881393  -0.1700000017881393  -0.1700000017881393

              0.6700000017881393   0.6700000017881392   0.3299999982118607

              0.3299999982118607   0.3299999982118607   0.3299999982118606

              0.6700000017881393   0.3299999982118606   0.6700000017881393

              0.3299999982118607   0.6700000017881393   0.6700000017881393

             0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000

            0.5000000000000000   0.4999999999999999   0.5000000000000000
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8楼2009-11-27 08:29:14
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lishufei

金虫 (正式写手)
问个弱弱的问题在vasp中我想进行晶体结构优化在incar文件里一般应该设置哪些参数。优化结果好坏是不是看最后的F和E0？是不是F和E0越小越好阿？
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9楼2009-11-28 09:54:17
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lishufei

金虫 (正式写手)
谁有侯博士的vasp教材特别是计算用vasp计算的成功例子。
给个链接也行。谢谢
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10楼2009-11-28 09:56:29
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