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【求助】如何不加对称性限制是指需要加NOsymm
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如何不加对称性限制是指需要加NOsymm吗？ 还是关于对称性的命令什么也不加？ |
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zhangmt
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2楼2009-11-25 15:55:48
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我在实际应用中的效果是这样的： 对于一般计算，不加NOsymm，GS会自动进行对称性分析。它会将坐标移至以Z轴为主的方向，并移动分子，让分子的电荷重心在坐标原点，然后进行对称性分析，进行计算。 有时由于某种需要，要求保留输入的坐标，不需要让GS对输入的坐标作改变，就加NOsymm关键词。 但加NOsymm不做对称性分析，如对于单个原子，有时会影响计算结果，要注意。 把话说成“不加对称性限制是指需要加NOsymm”，反倒不易明白。 [ Last edited by zhou2009 on 2009-11-25 at 16:40 ] |
3楼2009-11-25 16:29:00
zhangmt
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我做过的一个配合物体系，按照习惯上考虑，应该是一个有对称性的分子， 而且通常单晶也证实确实大多数配体的情况下都是对称性构象稳定，但是在特定配体的情况下，那个对称性的结构非但不是最稳定的，反而是过渡态，对应的非对称的一对对映体才是稳定构象——这个时候如果不取消对称性限制，想当然的输入对称性结构，是找不到稳定构象的，或者说，无法发现这个特定现象。。所以取消对称性限制在一定情况下还是必要的。这个根据实际需要而定吧。 [ Last edited by zhangmt on 2009-11-25 at 22:41 ] |
4楼2009-11-25 22:38:00