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jlcuit

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】询问本版有人对吸附情形进行分子模拟的吗？

比如说用氧化铁吸附水溶液中的砷酸盐，当吸附平衡时砷酸根具体怎么跟氧化铁表面进行连接的？据我现在了解，是氧化铁表面有羟基，通过羟基上的氧与砷酸根上的氧共用，可能是双齿双核配位的。
看过用gaussian模拟的，也有用ADF模拟的，不知道有没有专搞这方面的？

谢谢！
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1楼 2009-11-24 19:43:03
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-25 09:11
即使能的话,你这还得在水溶液中,再一个就是如何搭建模型啦
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2楼2009-11-25 09:03:14
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jlcuit

木虫 (正式写手)
★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 11-26 21:48
引用回帖:
Originally posted by erylingjet at 2009-11-25 09:03:
即使能的话,你这还得在水溶液中,再一个就是如何搭建模型啦

是啊 所以我觉得用gaussian算水溶液中好像不好吧？但文献中确实有算的，现在老板想用gaussian来算吸附，在一个猜想的吸附结构旁边加了若干个水分子 不知道可不可以。
加水是相当于在水溶液中，但是gaussian算这个好像不在行吧？
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3楼2009-11-26 21:00:22
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by jlcuit at 2009-11-26 21:00:


是啊 所以我觉得用gaussian算水溶液中好像不好吧？但文献中确实有算的，现在老板想用gaussian来算吸附，在一个猜想的吸附结构旁边加了若干个水分子 不知道可不可以。
加水是相当于在水溶液中，但是gaussian算 ...

在一个溶质分子周围摆放一些溶剂分子
这一点并不是高斯是否在行
而是摆放的人是否在行

在溶质分子周围摆放一圈溶剂分子，两种分子的相对位置，这个摆放的相对位置最见真功夫了。
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4楼2009-11-26 21:49:55
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jlcuit

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-11-26 21:49:

在一个溶质分子周围摆放一些溶剂分子
这一点并不是高斯是否在行
而是摆放的人是否在行

在溶质分子周围摆放一圈溶剂分子，两种分子的相对位置，这个摆放的相对位置最见真功夫了。

嗯，这个深有感触！
当我摆放其他小分子时，初试猜测了好多结构，就优化好了一个，但却是很不对称的那种结果！
不知yjcmwgk有没有这方面的东东可以学习下？~
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5楼2009-11-27 17:05:31
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