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minsong

应助: (幼儿园)
在线:
虫号: 437303

[交流] 【求助】用VASP软件并行计算出现的问题

想请教各位大侠，为什么我这里计算的时候使用16个节点并行计算时，竟然没有一个节点计算的速度快？？并且使用8个节点的时候是最快的。。。我觉得这个事情不应该阿。。。既然是并行计算，应该所用的节点越多就越是快才对呀。。请各位赐教！！！！谢谢

补充：16个节点都是用千兆网连接的服务器8核机。。。。

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1楼 2009-11-23 15:08:46

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westmonster

金虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 5637.3
帖子: 401
在线: 236.4小时
虫号: 456224
注册: 2007-11-11
专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
qasd(金币+1,VIP+0):xiexie 11-23 22:36

节点与节点之间数据传输同步限制的速度吧~具体不懂，坐稳沙发一起等大牛现身

赞一下(11人)

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蝉，于其脱壳展翅，则蛰居地下，似无声无息，实则以备有所为。

2楼2009-11-23 15:34:46

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minsong

应助: (幼儿园)
在线:
虫号: 437303

据说有工程类的软件会出现这样的问题，难道VASP也会有这个事情出现？？？听说都会有个中间值。在这个值的前后都不是最快的。。我这么说对不对呢？大侠？

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3楼2009-11-23 15:53:40

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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

1ST强帖: 3
应助: 51 (初中生)
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散金: 2975
红花: 34
帖子: 1278
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注册: 2008-12-17
性别: GG
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 11-23 22:36

这个不是vasp的问题，是你集群的问题，说明你的集群不是线性增加的。这个也很正常。
如果能保证核越多，计算速度越快，那得烧相当多的钱。
想并行必须得用千兆网卡，那是必须的。
同样，计算节点的足够多的时候，在vasp并行计算时，还是需要信息传递和处理的。核一多了，必然限制它的速度。毕竟节点和节点传递也要花一段时间。
一般的计算集群，8个节点计算速度最快是很正常的。

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真理是一点点接近的！

4楼2009-11-23 16:08:06

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minsong

应助: (幼儿园)
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虫号: 437303

引用回帖:

Originally posted by gavinliu7390 at 2009-11-23 16:08:
这个不是vasp的问题，是你集群的问题，说明你的集群不是线性增加的。这个也很正常。
如果能保证核越多，计算速度越快，那得烧相当多的钱。
想并行必须得用千兆网卡，那是必须的。
同样，计算节点的足够多的时候 ...

请问专家什么叫做线性增加呢？非常感谢。。。

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5楼2009-11-23 16:34:54

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