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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】用VASP软件并行计算出现的问题
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minsong

[交流] 【求助】用VASP软件并行计算出现的问题

想请教各位大侠，为什么我这里计算的时候使用16个节点并行计算时，竟然没有一个节点计算的速度快？？并且使用8个节点的时候是最快的。。。我觉得这个事情不应该阿。。。既然是并行计算，应该所用的节点越多就越是快才对呀。。请各位赐教！！！！谢谢

补充：16个节点都是用千兆网连接的服务器8核机。。。。
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1楼 2009-11-23 15:08:46
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westmonster

金虫 (正式写手)
★ ★
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qasd(金币+1,VIP+0):xiexie 11-23 22:36
节点与节点之间数据传输同步限制的速度吧~具体不懂，坐稳沙发一起等大牛现身
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蝉，于其脱壳展翅，则蛰居地下，似无声无息，实则以备有所为。
2楼2009-11-23 15:34:46
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minsong

据说有工程类的软件会出现这样的问题，难道VASP也会有这个事情出现？？？听说都会有个中间值。在这个值的前后都不是最快的。。我这么说对不对呢？大侠？
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3楼2009-11-23 15:53:40
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞
★ ★ ★
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qasd(金币+2,VIP+0):xiexie 11-23 22:36
这个不是vasp的问题，是你集群的问题，说明你的集群不是线性增加的。这个也很正常。
如果能保证核越多，计算速度越快，那得烧相当多的钱。
想并行必须得用千兆网卡，那是必须的。
同样，计算节点的足够多的时候，在vasp并行计算时，还是需要信息传递和处理的。核一多了，必然限制它的速度。毕竟节点和节点传递也要花一段时间。
一般的计算集群，8个节点计算速度最快是很正常的。
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真理是一点点接近的！
4楼2009-11-23 16:08:06
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minsong

引用回帖:
Originally posted by gavinliu7390 at 2009-11-23 16:08:
这个不是vasp的问题，是你集群的问题，说明你的集群不是线性增加的。这个也很正常。
如果能保证核越多，计算速度越快，那得烧相当多的钱。
想并行必须得用千兆网卡，那是必须的。
同样，计算节点的足够多的时候 ...

请问专家什么叫做线性增加呢？非常感谢。。。
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5楼2009-11-23 16:34:54
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westmonster

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
怎么觉得三楼和俺沙发上那句话没大差别。。。哈哈~
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蝉，于其脱壳展翅，则蛰居地下，似无声无息，实则以备有所为。
6楼2009-11-24 09:46:16
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westmonster

金虫 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1,VIP+0):讨论奖励！ 11-25 11:22
引用回帖:
Originally posted by minsong at 2009-11-23 16:34:




请问专家什么叫做线性增加呢？非常感谢。。。

线性增加还问啊。。。他说一坐标，如果计算速度是Y，节点数是X的话，绝对不是呈线性递增的。。意思就是不是节点越多，计算速度越快。。具体函数关系没研究过~哦，这么一说，可以研究下出篇文章呢！哈哈！
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蝉，于其脱壳展翅，则蛰居地下，似无声无息，实则以备有所为。
7楼2009-11-24 09:49:54
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minsong

我这个求助贴，倒是给楼上的开辟了新的课题研究方向的呀。。。。很好很好，终于也做了件对科研有利的事情。
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8楼2009-11-24 11:06:14
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gaoguoying1981

新虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjmaxpayne(金币+1,VIP+0):谢谢 12-3 11:58
不同节点间需要传输数据，因此速度不会完全成正比
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9楼2009-12-02 11:00:15
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