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lingling1039

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】截断距离

想问一下在做分子动力学模拟时,cutoff,也就是Rc一般是怎么规定的,我看有的取10A,除了 Rc < L/2,还有什么具体要求?多谢提示!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 11:11 ]
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fan159

金虫 (正式写手)

我也想知道,帮顶
2楼2009-11-23 11:26:59
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 11-23 12:29
Rc的上限取L/2, 下限应当大于3*\sigma, 参考汪文川译的那本书
如果用的是成套的力场, 比如charmm 或amber, 所有参数都是应该配套的
Rc也是力场的一个参数, 不能随意改变.
比如对charmm, switch=10, cutoff=12, pairlist=14
3楼2009-11-23 12:04:12
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lingling1039

银虫 (正式写手)

多谢了,能不能告诉我你说的那本书的书名?
4楼2009-11-23 16:53:17
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 11-24 09:54
引用回帖:
Originally posted by lingling1039 at 2009-11-23 16:53:
多谢了,能不能告诉我你说的那本书的书名?

这只是用于自己写程序/力场时候参考的,
如果用的是现成的力场, 以原始文献为准,
比如你要用charmm, 就用我在3楼提到的数据
5楼2009-11-23 19:00:18
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lingling1039

银虫 (正式写手)

非常感谢了!
6楼2009-11-24 09:51:25
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