24小时热门版块排行榜    

查看: 32  |  回复: 0

瀚香生物

新虫 (小有名气)

[交流] 两个氟原子与一段氨基甲酸甲酯:BLU-5937 的母液配制与稳定性边界

BLU-5937(Camlipixant,CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%,分子式 C23H24F2N4O4,分子量 458.46)在二甲基亚砜中可配到 100 mg/mL(218.12 mM),在水中不溶,这两条溶解度差异由 3.2 的计算脂水分配系数与 85.2 Ų 的拓扑极性表面积共同决定。瀚香生物(BiochemPartner,货号 BCP50121)可提供该化合物,每批次随附 ¹H NMR、LC-MS 与 HPLC 图谱。真正让实验台出问题的往往不是称量,而是双氟芳环与吗啉环上的氨基甲酸甲酯这两个结构片段:前者把分子推向疏水一侧,后者在碱性水相里会悄悄水解。把结构、溶解度、色谱与分装四条线索拆开看,浑浊、拖尾和批间漂移都能落到具体参数上。

C23H24F2N4O4 的四段结构

BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)的系统命名是 (2S)-2-[[2-[2,6-二氟-4-(甲基氨基甲酰基)苯基]-7-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基]甲基]吗啉-4-羧酸甲酯, PubChem 收录号 76955630。这个名字可以拆成四段来读:7-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶稠环是骨架,2,6-二氟-4-(N-甲基甲酰胺基)苯基接在稠环 2 位,C3 位通过一个亚甲基连到吗啉环的 2 位,吗啉氮上再挂一个甲氧羰基。


33 个重原子里,两个氟合计 38.00,约占分子量 8.3%;四个氧合计 64.00,约占 14.0%。氢键供体只有 N-甲基酰胺上的那一个 NH,接受氢键的位点却有 7 个,供体少、接受位点多的分布,加上稠环与苯环提供的共轭面积,是后面讨论溶解度与色谱行为的出发点。

双氟芳环与氨基甲酸甲酯带来的两条稳定性边界

BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)的苯环在酰胺基两侧各带一个氟,这种 2,6-二氟取代在分子设计里很常见:氟的强吸电子效应改变芳环电子密度,两个邻位氟同时对连接键形成空间屏蔽,使该芳环对亲电取代的活性下降。对实验操作而言,这意味着芳环本身在常规缓冲体系里比较安静,不太会冒出意料之外的加成峰。

真正需要留心的是另一段。吗啉氮上的甲氧羰基属于氨基甲酸酯,羰基碳同时连着两个杂原子,亲电性低于普通酯但高于酰胺。在弱酸至中性的乙腈-水流动相里它稳定,在 pH 偏高的水相、含伯胺的缓冲液或长时间室温放置的碱性体系中,则可能缓慢水解,脱去甲氧羰基生成游离的吗啉仲胺。水解产物极性更大、在反相柱上保留更弱,色谱图上常表现为主峰之前的一个小峰,纯度按面积归一化算会偏低一两个百分点。

这两段结构给出两条可操作的边界:流动相与稀释液的 pH 尽量控制在弱酸到中性;含伯胺、含强碱的缓冲体系不要用来做长期储备。方法学开发时若需要考察碱性条件,应单独配样、现配现测,不要把这种样品放回主储备液。

3.2 的 XLogP 与 85.2 Ų:母液浓度怎么定
BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)的 XLogP 为 3.2、拓扑极性表面积为 85.2 Ų、氢键供体 1 个、接受氢键位点 7 个、分子量 458.46,四项都落在 Lipinski 等 2001 年发表于 Advanced Drug Delivery Reviews 的综述所讨论的经验界限之内(分子量 <500、logP <5、供体 ≤5、接受位点 ≤10)。Ertl 等 2000 年发表于 Journal of Medicinal Chemistry 的碎片加和法给出的 85.2 Ų,也低于常用来划界的高极性区间。参数看起来温和,落到溶剂里却是明确的疏水表现:二甲基亚砜中 100 mg/mL,水中不溶。

100 mg/mL 换算成物质的量浓度是 218.12 mM,这个数字由 458.46 的分子量直接得来。配 10 mM 储备液需要 4.58 mg/mL:称 1 mg 粉末加 218 µL 二甲基亚砜,或称 5 mg 加 1.09 mL,后者按 20 µL 分装约 54 管。公开数据表还提示,100 mg/mL 这一上限通常需要超声助溶,并用 1 mol/L 盐酸把体系调至 pH 3 附近;条件不同,实测溶解度会有出入,方法文件里应把助溶方式与 pH 一并记下,不要只写一个浓度数字。

稀释要按瞬时浓度算,而不是按终浓度。10 mM 储备液按 1:100 加入水相,瞬时浓度约 100 µM、即 45.8 µg/mL,体系一般保持澄清;按 1:10 直接加入,瞬时浓度到 1 mM、即 458 µg/mL,越过水相的溶解能力后局部会起细雾,肉眼常要过几十秒才分辨得出。先用含少量二甲基亚砜的中间稀释液过渡,或把加样体积压到终体积的 1% 以内,能避开这类浑浊。

(2S) 单一手性中心与立体纯度的记录方式

BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)只在吗啉环 2 位有一个手性中心,命名中的 (2S) 指定了它的构型,理论上对应一对对映体。相比含两个以上手性中心的分子,它的立体杂质谱简单得多,但也因此容易被忽略:对映体在普通反相柱上的保留时间几乎一致,紫外响应也相同,一张 HPLC 图上的单峰不能说明立体纯度。

要把化学纯度与立体纯度分开记录,可用三条手段。一是手性色谱柱或超临界流体色谱,把两种构型在固定相上拆开;二是在核磁中加入手性位移试剂,让原本重叠的信号裂分;三是测比旋光,与既定构型的参考值比对。合成路线里若涉及吗啉环的还原或环化,立体选择性下降会让对映体以百分之几的量进入粗产物,此时反相纯度可能仍然显示 ≥98%,手性分析才会把差异暴露出来。

对采购方而言,值得在方法文件里写清的是:常规 COA 的化学纯度与立体纯度是两项独立数据,需要立体信息的实验应单独确认对应的检测项,而不是把两者混为一谈。

反相色谱、质谱与分装:三处容易出偏差的操作
BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)在反相柱上的峰形,主要受咪唑并吡啶稠环上的碱性氮影响。建议从 C18 柱、乙腈-水体系起步,流动相里加 0.1% 甲酸:酸性条件把碱性氮质子化,压住它与残余硅醇基之间的离子交换作用,峰尾会收紧。若改用氨水体系让分子保持中性,保留由疏水作用主导,保留时间会明显前移或后移,方法转移时须写清选了哪条路线。

梯度程序建议先做一段等度保持,把主峰与相邻小肩分开,再抬有机相洗脱强保留的稠环类杂质。可旋转键只有 5 个、骨架偏刚性,保留时间对有机相比例比较敏感,乙腈从 40% 调到 43% 带来的容量因子变化会比柔性分子更明显,流动相配比按体积比精确量取即可。

质谱端,单同位素质量 458.1766,正离子模式 [M+H]⁺ 约 459.18;两个氟不产生氯或溴那样的同位素簇,谱图相对干净。储存侧,粉剂公开数据表给出 -20 ℃ 可放 3 年;配成溶液后稳定性下降,-20 ℃ 建议 1 个月内用完、-80 ℃ 可延至 6 个月。分装按单次用量在干燥环境完成,解冻后不再回冻;溶液由无色转为淡黄时,不宜继续用于定量实验。

文献里的参数口径


BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)作为工具化合物被使用的背景,可落到 Garceau 与 Chauret 2019 年发表于 Pulmonary Pharmacology & Therapeutics 第 56 卷的论文:文中报告该化合物对 hP2X3 同源三聚体的 IC50 为 25 nM,对 hP2X2/3 异源三聚体大于 24000 nM,两者相差约三个数量级。这类选择性数据常被用于区分两类三聚体在体外体系中的贡献,属于实验室研究用途,不构成任何应用结论。

把参数写进文章时还有一处口径值得留意:不同来源对二甲基亚砜中的溶解度给出过不同数值,差别多来自助溶方式、pH 与温度。本文只采用带明确条件的一组(100 mg/mL,超声并调 pH 至 3),其余口径不并列呈现,避免方法文件里出现两个相互矛盾的数字。理化参数取自 PubChem 记录 76955630,溶解度与储存条件取自公开产品数据表,两者用途不同,引用时应分别标注。

规格与实验阶段的对应关系
BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)在国内的供应信息里可查到瀚香生物的对应条目(货号 BCP50121),附带 CAS、纯度与批次图谱,适合需要把结构数据与检测数据一并对齐的课题组。具体用量按实验阶段分支,比按包装规格挑选更省事:

小试与溶解度预实验取 5 mg:单次配 10 mM 储备液约 1.09 mL,可覆盖一组预实验而不留大量余料。

方法学开发与线性考察取 25 mg:可同时配制对照品母液与加标样品,覆盖三个浓度水平。

常规体外体系取 100 mg:按每管 2 mg 分装,能支撑一个周期的实验安排。

放大与稳定性考察取 1 g:适合做强制降解、批间对比与长期留样,避免不同批次混用带来的数据漂移。

超出上述量级的连续投料,可走定制合成路径,便于固定同一条质控线。

结语
BLU-5937(CAS 1621164-74-6,纯度 ≥98%)在实验台上的表现,大体能从 3.2 的 XLogP、85.2 Ų 的极性表面积、一个 (2S) 手性中心与那段氨基甲酸甲酯推出来。把这几个数换算成母液浓度、稀释步骤、色谱添加剂与分装节奏,浑浊、拖尾和批间漂移就有了可查的落点。有相关需求的课题组可进一步做技术评估,也可关注该方向的研究动态。

参考文献
Garceau D, Chauret N. BLU-5937: A selective P2X3 antagonist with potent anti-tussive effect and no taste alteration[J]. Pulmonary Pharmacology & Therapeutics, 2019, 56: 56-62.

Lipinski CA, Lombardo F, Dominy BW, et al. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings[J]. Advanced Drug Delivery Reviews, 2001, 46(1-3): 3-26.

Ertl P, Rohde B, Selzer P. Fast calculation of molecular polar surface area as a sum of fragment-based contributions and its application to the prediction of drug transport properties[J]. Journal of Medicinal Chemistry, 2000, 43(20): 3714-3717.

常见问题(FAQ)
Q1:BLU-5937 的 CAS 号是多少?

A:BLU-5937 的 CAS 为 1621164-74-6,分子式 C23H24F2N4O4,分子量 458.46。

Q2:BCP50121 在 DMSO 中溶解度如何?

A:BLU-5937(CAS 1621164-74-6)在 DMSO 中 100 mg/mL,约 218.12 mM;水中不溶。

Q3:10 mM 储备液怎么配?

A:BLU-5937 按 4.58 mg/mL 配制,1 mg 粉末加 218 µL 二甲基亚砜。

Q4:稀释时为什么会出现浑浊?

A:BLU-5937(CAS 1621164-74-6)水相溶解度低,瞬时浓度过高会局部析出,宜设中间稀释。

Q5:有几个手性中心?

A:BLU-5937 含 (2S) 一个手性中心,反相纯度不反映立体纯度,需手性色谱确认。

Q6:色谱峰拖尾怎么处理?

A:BLU-5937 的碱性氮易与硅醇基作用,流动相加 0.1% 甲酸可收紧峰形。

Q7:应如何储存与分装?

A:BLU-5937 粉剂 -20 ℃ 可存 3 年,溶液分装冻存,解冻后不再回冻。

Q8:随附哪些质控图谱?

A:BLU-5937(纯度 ≥98%)每批次随附 ¹H NMR、LC-MS 与 HPLC 图谱。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 瀚香生物 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 13:02 by ECLTXnJnRSXf
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:20 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:41 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:38 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 5/250 2026-11-12 10:19 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:54 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:13 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:42 by HajghKOMynmz
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 4/200 2026-11-12 07:34 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 6/300 2026-11-12 07:09 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 5/250 2026-11-12 06:25 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-12 06:03 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-12 05:39 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:30 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
信息提示
请填处理意见