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CT 孔隙统计，粘在一起的孔怎么拆开？说说分水岭的坑
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做孔隙尺寸分布的时候，经常遇到一个问题：阈值分出来的孔很多是连在一起的，直接做连通域标记，几个孔会被算成一个大孔，平均孔径偏大，孔的个数偏少。 常用办法是距离变换加分水岭：先对孔的二值图做距离变换，取局部极大值当种子，再做分水岭，把相连的孔沿“颈部”切开。Avizo、Dragonfly、Fiji（MorphoLibJ）都有这一套。 几个自己踩过的坑： 1. 种子太多会过分割。噪声或者孔表面不平，会在一个孔里出现好几个极大值，一个孔被切成几块。一般先对距离图做一点平滑，或者用 h-maxima 压掉高度很小的极大值，h 值要试几次，看切出来的结果合不合理。 2. 连通方式要说清楚。三维里 6 连通和 26 连通得到的孔数可能差不少，尤其是体素尺度上只靠一个角相连的地方。写论文时最好注明用的是哪种。 3. 切开以后，“孔”的定义就变了。分水岭切的是几何上的颈部，不一定对应真实的孔喉。如果关心的是渗流或连通性，切开前的连通域信息也要留着，两套结果各回答各的问题。 4. 贴边的孔要单独处理。和视野边界相交的孔尺寸是被截断的，统计粒径分布时一般剔除，或者至少单独标出来，不然小孔比例会偏高。 5. 最小尺寸阈值。只有几个体素的“孔”很可能是噪声，筛掉多少体素以下的要定一个标准，并且和体素尺寸一起报出来。 最后建议随机抽几张切片，把分割结果叠在原图上看一眼，比只看统计图靠谱。大家做孔隙分割一般用什么参数？欢迎交流。 |
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