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科研战神来了

新虫 (小有名气)

[交流] 实验技巧|小提质粒提升浓度实用大法!

在质粒提取中,浓度突破 1000 ng/μL 是很多同学梦寐以求的目标。高浓度意味着更少的转染体积、更高的共转染效率,也为下游显微注射、动物实验等铺平道路。今天我就结合一份真实操作记录,逐帧拆解每一个关键节点,并补充那些容易遗漏却决定成败的“隐藏步骤”,帮你把质粒小提做到大提级别的浓度。一、摇菌-量不在多,精在“对数”从平板上挑取单克隆菌落,接种于小摇管(如 3~5 mL 含抗生素 LB)中,先进行一级活化(37℃,200 rpm,约 6~8 h)。取上述活化菌液 200 μL,转接至 15 mL 含抗生素的 LB 培养基中(共制备 2 管,总体积 30 mL),置于 50 mL 离心管中。摇菌条件:37℃,200 rpm,摇 13~14 h。🔑 点拨:这个时间点正好卡在对数生长后期,菌体密度高且质粒拷贝数处于峰值。若摇过久(>16 h),菌体老化自溶,质粒反而下降。二、离心收集菌体 - 宁可多取,不可少取将每管菌液分别倒入 1.5 mL EP 管中,每次 1 mL,12 000 rpm 离心 1 min,弃上清,重复收集,直至全部菌液沉淀完。两管菌液分别得到两个菌体沉淀。⚠️ 注意:建议每管至少收集 8~10 次(即 8~10 mL 菌液),保证起始菌量充足,这是高浓度的基础。三、Buffer P1 重悬 - 温柔而彻底提前在 Buffer P1 中加入 RNase A(按说明书比例),并储存于 4℃。向每管沉淀中各加入 500 μL Buffer P1。使用移液器反复吹打,或涡旋振荡至完全无块状菌体,形成均匀的菌悬液。💡 重悬不彻底,后续裂解会不均一,得率直接打八折。四、裂解与中和-黄金 5 分钟,手速要快向每管中分别加入 500 μL Buffer P2(含 SDS + NaOH),立即上下颠倒 6~10 次,直至溶液变得澄清透亮、粘稠(说明菌体已完全裂解)。严格控制在 5 分钟之内,加入 500 μL Buffer P4(或中和液),同样立即颠倒 6~10 次,可见白色絮状沉淀(蛋白质和基因组 DNA 析出)。室温静置 10 min,然后 12 000 rpm 离心 10 min。🕐 关键:P2 作用时间超过 5 分钟会使质粒断裂;P4 加入后颠倒要迅速,中和不充分会导致后续滤柱堵塞。五、CS 柱过滤 -避开“白色幽灵”小心吸取离心后的上清,切勿吸到白色细小沉淀(那是蛋白-基因组复合物),否则会堵塞 CS 柱。将上清分批加入 CS 过滤柱(每次不超过 700 μL),12 000 rpm 离心 2 min,收集滤液至新的 2 mL EP 管中。准确记录滤液总体积(这一步很多人忽略,但后续计算异丙醇用量全依赖它)。六、异丙醇沉淀 - 体积可以“抠”一点根据滤液体积,加入 0.3 倍体积的异丙醇(例如滤液 1294.6 μL,理论加 388.4 μL,实际可加 385 μL,适当减少无妨)。上下颠倒混匀,室温静置 3~5 min(让核酸充分析出)。🧪 异丙醇略减量反而能减少盐类共沉淀,对纯度有益。七、CP4 柱吸附 - 别急着离心,先“泡一泡”提前平衡 CP4 柱:向每个 CP4 柱中加入 500 μL Buffer BL,12 000 rpm 离心 1 min,弃滤液(此步骤务必先做!)。将上述混合液分次加入平衡好的 CP4 柱中(两管菌液各用一个吸附柱)。关键操作:加样后室温静置 3~5 分钟,让质粒 DNA 与硅胶膜充分结合,然后再 12 000 rpm 离心 1 min,弃滤液。📌 静置这一步很多人跳过去,但它是提高结合效率的“隐形杠杆”。八、洗涤 - PD 与 PW 的“前后夹击”Buffer PD 洗涤:向每个 CP4 柱加入 500 μL Buffer PD(去蛋白),12 000 rpm 离心 1 min,弃滤液。Buffer PW 洗涤:向每个柱子加入 600 μL Buffer PW(已加无水乙醇),静置 3 分钟(让残留盐充分溶解),然后 12 000 rpm 离心 1 min,弃滤液。空离除醇(⭐ 补充关键步骤):将 CP4 柱放回收集管,12 000 rpm 空离 2 min,并打开管盖于室温放置 3~5 min,使乙醇彻底挥发。🔥 乙醇残留会严重抑制下游酶切和转染,空离+晾干是提浓度的“隐形卫士”。九、终极洗脱 -“串联洗脱”法,浓度翻倍这是本方案最精华的“浓缩大法”:第一次洗脱(柱1):用 200 μL 预热至 60℃ 的 ddH₂O 滴入第一个 CP4 柱膜中央,60℃ 静置 2 min,12 000 rpm 离心 1 min,收集洗脱液。重复洗脱柱1:将同一份洗脱液再次加回柱1膜上,静置 2 min,再次离心。此时柱1的大部分质粒已被洗脱。转柱洗脱(柱2):取 20 μL 预热 ddH₂O 先浸润第二个 CP4 柱的膜(使其活化)。然后将柱1的洗脱液(约 200 μL)全部吸出,加到柱2的膜中央,60℃ 静置 2 min,离心收集。重复洗脱柱2:将洗脱液再次加回柱2,静置 2 min,离心,最终得到约 200 μL 的高浓度质粒溶液。🏆 解读:这种方法相当于用同一份洗脱液“串行”流过两个柱子,把两个柱子的质粒富集到同一体积中,浓度可提升 1.6~2 倍。1000 ng/μL 就是这样“挤”出来的。十、后续检测与保存取 1~2 μL 测 OD260/280(应介于 1.8~2.0),并计算浓度。分装成小管(避免反复冻融),-20℃ 保存。若长期保存,建议 -80℃。
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