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序列求鉴定】发酵液表型疑似贝莱斯芽孢杆菌,一代测序结果存疑,求大佬帮忙看序列 已有1人参与
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各位老师/虫友大家好:我们团队在做一株产脂肽芽孢杆菌的筛选,发酵液具有强起泡、产生物膜(金油)、排油抑菌的特性,平板菌落呈典型的粗糙、褶皱状(图1)。但送检一代测序(Sanger)后,测序公司给出的BLAST结果却是“格氏乳杆菌(Lactobacillus gasseri)”。我们对比了序列特征,发现测序公司给出的序列片段(TCGAGCG…AGCTT)更符合枯草芽孢杆菌复合群的特征,与乳杆菌不符。因为经费有限,暂时无法重做高通量测序。想请教版内的微生物大佬:?能否帮忙看一下这段序列(见附件截图),从序列特征上判断,这到底是不是芽孢杆菌?附上平板形态图和测序序列截图,感谢各位大佬指点! 发自小木虫IOS客户端 |
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