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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 基因芯片中高表达的基因有意义吗？
汕头大学海洋科学接受调剂
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

[交流] 基因芯片中高表达的基因有意义吗？

本人在做芯片实验，实验材料是不同的发育阶段。看了些芯片方面的文献，发现大家讨论或关注的都是差异表达的基因，特别是差异倍数大的，大家好像越关心！可是本人发现在芯片结果中，在统计出有一定差异的（2倍左右吧）基因里面，有些基因显著比其他差异表达的基因表达水平高！！不知道这些基因怎么看待？我认为他们的生物学意义可能大一些，不知道各位英雄有何见解？本人对芯片了解的不多！！希望各位发表一下高见！！谢谢！
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1楼 2009-11-19 19:23:42
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漫迹

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本人对此了解也不多呢，帮不上忙，遗憾哈，不过觉得基因芯片技术倒是很先进呢
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2楼2009-11-19 20:40:47
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
“在统计出有一定差异的（2倍左右吧）基因里面，有些基因显著比其他差异表达的基因表达水平高！”这是很正常的，因为本来基因组中的不同基因的表达情况就是不一样的，因为毕竟每个基因的拷贝数及其表达情况都是不一样的。如果要看某些基因的表达量和其他的相比的话也一定要看相关的基因，例如同一条代谢途径上的相互影响的基因。
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3楼2009-11-19 21:09:09
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
谢谢zhuifeng7000  ！
拷贝数我也查过，是1，上下游基因表达有的是暂不清楚的，无法看出，或者说他们的上游基因有的是一样的，就无法判断这条代谢途径表达如何。但从相关物种研究来看，这些基因似乎都与激素相关，不知道这种高表达有意义吗？
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4楼2009-11-20 09:36:16
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by shenye.judy at 2009-11-20 09:36:
谢谢zhuifeng7000  ！
拷贝数我也查过，是1，上下游基因表达有的是暂不清楚的，无法看出，或者说他们的上游基因有的是一样的，就无法判断这条代谢途径表达如何。但从相关物种研究来看，这些基因似乎都与激素相关 ...

我觉得有些基因显著比其他差异表达的基因表达水平高，如果比较的这些基因关系不密切的话不能说明显著的问题。（我也不是很懂）
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5楼2009-11-20 16:18:17
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hyde0706

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我觉得是这样理解：差异表达是不同时期同一基因的表达变化，这样更能说明其与发育的关系。而表达量很高的基因，可能是一些生物必须的结构蛋白或者关键酶的基因，这些基因表达量一直很高，但是在发育不同阶段变化不大。
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6楼2009-11-20 20:58:19
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
谢谢楼上各位的交流！！！
我也看过一些文献，大家关心的基本上是差异大的！
只是我在这些统计出来差异表达的基因里面，发现那些表达量高一些的基因都与激素有些联系（是其他物种的同源基因研究结果），所以就在考虑在写文章的时候应该怎么样讨论？怕讨论错了被拒。
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7楼2009-11-21 11:01:28
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junjiew7781

铜虫 (著名写手)
那就可能与信号传导有关系!
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8楼2010-02-09 10:44:55
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