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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】如何读siesta的输出结构？molekel？
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁

[交流] 【求助】如何读siesta的输出结构？molekel？已有2人参与

助教告诉俺用molekel软件，但是貌似什么输出文件都打不开呢
文件格式不一样啊。连个说明书也没找到
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1楼2009-11-19 17:21:38
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xhsh

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢回帖交流 11-19 20:58
每个软件都有它固定的输入文件的格式。直接用molekel打开siesta的输入文件是不可能的。你要把坐标单独做成一个文件。格式：

A    x   y   z
B    x   y   z
...
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2楼2009-11-19 19:47:40
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
用什么才能修改输出文件的格式，使得molekel或者xcrysden能读出来呢
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3楼2009-11-20 18:43:43
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dtlfnwu

铜虫 (小有名气)
★
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢提示 11-21 20:44
你用什么操作系统呢?  如果是WINDOWS可以用写字板打开,如果是UNIX可以直接用命令less name.out 打开.

[ Last edited by dtlfnwu on 2009-11-21 at 10:09 ]
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4楼2009-11-21 16:07:12
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xhsh

木虫 (小有名气)
★
aylayl08(金币+1,VIP+0):谢谢提示 11-22 09:22
vi or emacs or else
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5楼2009-11-22 08:49:45
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
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zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-04-11 21:01
引用回帖:
Originally posted by minmin_0082003 at 2009-11-19 10:21:38:
助教告诉俺用molekel软件，但是貌似什么输出文件都打不开呢
文件格式不一样啊。连个说明书也没找到

xcrysden直接能读.xyz文件吗不是？
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弘德明志博学笃行
6楼2010-04-10 23:44:29
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minmin_0082003

金虫 (正式写手)

莫愁莫愁
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-04-10 23:44:29:

xcrysden直接能读.xyz文件吗不是？

可以，我是想看电子结构.......
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7楼2010-04-11 14:31:58
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by minmin_0082003 at 2010-04-11 07:31:58:

可以，我是想看电子结构.......

是说的电子结构是要看电子分布吗？
要是这样的话，还是用这个软件，只是要处理一下再看！我可以给你一个资料，你自己研究一下！看来你是新手了，我也是新手，所以对这个也是刚开始研究！siesta的大部分后续处理都在/Uitl里面！我把资料发到你的邮箱里了！就是你给我的那个！希望对你有用！在学习的过程中希望相互交流！
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弘德明志博学笃行
8楼2010-04-12 09:16:07
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