| 查看: 7320 | 回复: 804 | ||||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 cory0931 的 79 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会 | ||||
[交流]
如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量
|
||||
|
主要是提供思路，附带部分衍生阅读资料（本人已发表于其他平台） 1. 既然是快速，那自然不能是手动一个一个来，得用要专业的分析方和和技术平台； 2. 既然是要批量，那必然会涉及到如何获取高质量的靶标物质库（比如蛋白序列库、核酸序列库）； 3. 高活性，那自然少不了批量的活性预测分析； 4. 生物酶，那必然是要进行酶功能、种类的精准预测； 那么，高质量的数据从哪里来？ 1. 自有资源，包括自有菌株--已经明确其具有较高的特定功能酶活性 -- 拿到全基因组、或全蛋白组、或转录组测序数据； 2. 自由测序库，这个更容易实现——比如从油污积聚、降解油污的环境中收集样本，三代测序，拿到序列库，这其中大概率是会有对应的解油污高活性酶存在； 3. 在线库直接挖掘，这个有一定的技术门槛；其前提是获取到大量的，潜在的靶标序列，再从里面进行层层筛选、挖掘；包括但不限于 1）序列层面的筛选； 2）理化特性层面筛选； 3）结构层面的筛选； # 注意，这其中的每一步，都是批量实现的，单个操作只适用于对明确功能酶分子的精细优化、以及少量靶标的精细筛选； 怎么挖掘？ 1. 必然是要对靶标酶，有一个深刻的认识，其具体功能、理化特性、结构特征、分子动力特征等； 2. 挖掘，则是基于对靶标酶的有限认知，进行举一反三的批量发现； 其他 —— 一些别家网站的延申阅读资源； signalp6 分泌信号肽预测——全基因组级、宏基因组级分泌表达预测 Foldseek本地部署 详细教程-- cpu 模式参考 deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析，适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析 CataPro本地安装--CPU模式（cpu mode）-- 经验资料整理 CLEAN蛋白酶功能预测工具介绍 目前最精准的酶功能预测工具 全基因组蛋白分泌表达预测与优化 -- 策略-附流程图 原核生物表达异源蛋白--最佳分泌信号肽筛选策略--思路来自2018年的文献 真核生物异源蛋白高效分泌表达策略--分泌信号肽优化方案 三代测序之-- - 挖掘特定功能基因--pacbio测序数据挖掘--纳米孔测序、GenoCare等 -- 功能蛋白碗蕨 功能酶挖掘方案  |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生物类实验技术 |
» 猜你喜欢
一篇扩散模型的Nature Machine Intelligence论文和Elsevier上的深度学习药物书籍
已经有1人回复
-
中国药科大学2026入学博士，药物合成和设计经验，放射化学及放射医学研究
已经有25人回复
-
药理学论文润色/翻译怎么收费?
已经有213人回复
-
使用MolAICal进行多肽虚拟筛选教程-同样适用于蛋白质和核酸的虚拟筛选
已经有1人回复
-
使用MolAICal计算药物化学过滤器MCFs及MCE-18描述符
已经有0人回复
-
使用MolAICal发现蛋白受体潜在的活性口袋及位点
已经有0人回复
-
华理药学学硕求调剂，总分324
已经有0人回复
-
292药学调剂
已经有1人回复
-
澳门理工大学人工智能药物发现中心招收2026级博士研究生（申请-考核制）
已经有10人回复
-
使用MolAICal生成小分子CHARMM力场拓扑和参数文件
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
散金祈福
+5/4105
-
散金祈福
+5/1335
-
基金申请小调查！预祝申请必定中中中！！祈福！！！
+5/575
-
每年这时候我都再仔细读一遍《范进中举》
+1/478
-
华西生物制药研究院招聘科研助理
+2/406
-
越临近，反而有点忐忑了
+5/310
-
散金求好运
+1/199
-
山东征女友，坐标济南
+1/91
-
焦虑
+1/85
-
强耀生物金秋开学季活动，2026年8月18日-10月31日，肽库筛选低至2W5
+3/61
-
上海交通大学张航课题组招聘博士后（电化学能量存储与转换）
+1/44
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
+1/42
-
流放岭南浮肿了求救
+1/26
-
南方医科大学深圳医院陈烨/余涛教授课题组联合培养博士后招聘
+1/8
-
2026年国自然
+1/6
-
基因组大数据解析：从深渊鱼类到AI蛋白质设计-AI本地大模型部署内存到底要多大
+1/5
-
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/2
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/2
-
Olink高通量蛋白组测序：PEA 技术驱动的微量样本蛋白全景解析
+1/2
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/1
21楼2026-08-17 22:18:37
23楼2026-08-17 22:18:37
24楼2026-08-17 22:18:37
25楼2026-08-17 22:18:37
26楼2026-08-17 22:18:37
27楼2026-08-17 22:18:37
28楼2026-08-17 22:18:37
30楼2026-08-17 22:18:37
32楼2026-08-17 22:18:37
33楼2026-08-17 22:18:37
34楼2026-08-17 22:18:37
35楼2026-08-17 22:18:37
37楼2026-08-17 22:18:37
38楼2026-08-17 22:18:37
39楼2026-08-17 22:18:37
40楼2026-08-17 22:18:37
41楼2026-08-17 22:18:37
42楼2026-08-17 22:18:37
43楼2026-08-17 22:18:37
44楼2026-08-17 22:18:37
45楼2026-08-17 22:18:37
46楼2026-08-17 22:18:37
47楼2026-08-17 22:18:37
49楼2026-08-17 22:18:37
50楼2026-08-17 22:18:37
简单回复
tfang2楼
2026-07-02 14:39
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
jiaoxg3楼
2026-07-02 14:56
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
2026-07-02 14:57
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
浮云1665楼
2026-07-02 14:57
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫手机客户端
2026-07-02 16:02
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
2026-07-02 16:40
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
toppaper8楼
2026-07-02 18:10
回复
2026-07-02 19:20
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
逍遥仙影10楼
2026-07-03 10:42
回复
滴滴Grace合肽库11楼
2026-07-03 11:05
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
ckxbear12楼
2026-07-03 16:20
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
psylhh13楼
2026-07-04 00:08
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
sct7314楼
2026-07-04 20:27
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
庚辰辛丑15楼
2026-07-05 20:51
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
gter_wang16楼
2026-07-06 09:13
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
dsctg17楼
2026-07-06 14:50
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
laozhu557218楼
2026-07-07 08:12
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
jiantu19楼
2026-07-08 10:09
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
ringtail20楼
2026-07-09 15:37
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
xdse878222楼
2026-08-17 22:18
回复
涓�
hs18166zd1829楼
2026-08-17 22:18
回复
666
hs18166zd2131楼
2026-08-17 22:18
回复
1
yneu821736楼
2026-08-17 22:18
回复
+1
997093184148楼
2026-08-17 22:18
回复
.
