| 查看: 8147 | 回复: 804 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 cory0931 的 79 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
如何快速、批量挖掘高活性生物酶 挖酶、生物酶挖掘、挖酶教学、批量挖掘、高质量
|
|||
|
主要是提供思路，附带部分衍生阅读资料（本人已发表于其他平台） 1. 既然是快速，那自然不能是手动一个一个来，得用要专业的分析方和和技术平台； 2. 既然是要批量，那必然会涉及到如何获取高质量的靶标物质库（比如蛋白序列库、核酸序列库）； 3. 高活性，那自然少不了批量的活性预测分析； 4. 生物酶，那必然是要进行酶功能、种类的精准预测； 那么，高质量的数据从哪里来？ 1. 自有资源，包括自有菌株--已经明确其具有较高的特定功能酶活性 -- 拿到全基因组、或全蛋白组、或转录组测序数据； 2. 自由测序库，这个更容易实现——比如从油污积聚、降解油污的环境中收集样本，三代测序，拿到序列库，这其中大概率是会有对应的解油污高活性酶存在； 3. 在线库直接挖掘，这个有一定的技术门槛；其前提是获取到大量的，潜在的靶标序列，再从里面进行层层筛选、挖掘；包括但不限于 1）序列层面的筛选； 2）理化特性层面筛选； 3）结构层面的筛选； # 注意，这其中的每一步，都是批量实现的，单个操作只适用于对明确功能酶分子的精细优化、以及少量靶标的精细筛选； 怎么挖掘？ 1. 必然是要对靶标酶，有一个深刻的认识，其具体功能、理化特性、结构特征、分子动力特征等； 2. 挖掘，则是基于对靶标酶的有限认知，进行举一反三的批量发现； 其他 —— 一些别家网站的延申阅读资源； signalp6 分泌信号肽预测——全基因组级、宏基因组级分泌表达预测 Foldseek本地部署 详细教程-- cpu 模式参考 deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析，适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析 CataPro本地安装--CPU模式（cpu mode）-- 经验资料整理 CLEAN蛋白酶功能预测工具介绍 目前最精准的酶功能预测工具 全基因组蛋白分泌表达预测与优化 -- 策略-附流程图 原核生物表达异源蛋白--最佳分泌信号肽筛选策略--思路来自2018年的文献 真核生物异源蛋白高效分泌表达策略--分泌信号肽优化方案 三代测序之-- - 挖掘特定功能基因--pacbio测序数据挖掘--纳米孔测序、GenoCare等 -- 功能蛋白碗蕨 功能酶挖掘方案  |
回复此楼» 猜你喜欢
华南理工大学 基础医学学硕和临床医学学硕调剂
已经有11人回复
-
药物检测中微生物限度计数结果判断
已经有0人回复
-
药物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有70人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
求助中国药典1995年版、二部
已经有0人回复
-
申博自荐
已经有2人回复
-
求大佬收留
已经有0人回复
-
北京协和医学院杰青课题组招聘科研助理
已经有0人回复
-
求助https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2535777123 全文
已经有0人回复
-
请教执业药师报考的一些问题
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
告别流水线爽文！108万字完结仙侠《女娲石之灵石奇缘（仙界篇）》值得细品
+1/9020
-
散金祈福
+5/4020
-
散金祈福
+5/1170
-
散金祈福
+3/798
-
每年这时候我都再仔细读一遍《范进中举》
+1/477
-
南方医科大学|生物材料与医学工程团队诚聘科研助理
+2/278
-
散金求好运
+1/193
-
上海交通大学张航课题组招聘博士后（电化学储能）
+1/89
-
山东征女友，坐标济南
+1/89
-
Polymers 期刊特刊 组稿
+1/78
-
哈尔滨工业大学（校本部）电子与信息工程学院2027级博士招生
+1/65
-
中山大学化学工程与技术学院欧阳钢锋/吴鑫课题组博士生（2027年入学）/博士后招聘启事
+1/43
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
+1/37
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
+1/34
-
2027环境工程博士申请
+1/8
-
江苏大学生物科学与技术学院雍阳春课题组招聘“合成生物学”副教授/讲师
+1/4
-
找女友
+1/2
-
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/2
-
清华大学环境课题组招聘环境工作专业客座生研究生2-3名（应用导向）
+1/1
-
找女友
+1/1
706楼2026-08-19 20:47:47
简单回复
jiaoxg3楼
2026-07-02 14:56
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
浮云1665楼
2026-07-02 14:57
回复
cory0931(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫手机客户端
toppaper8楼
2026-07-02 18:10
回复
