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科研战神来了

新虫 (小有名气)

[交流] 细胞提 RNA 完整操作指南|从收样到测浓度一步不缺

实验目的与原理在细胞生物学研究中,常需提取细胞总RNA,通过逆转录获得cDNA,再利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测目标基因在mRNA水平的表达量。本实验采用Trizol法提取RNA,其原理是利用异硫氰酸胍和酚等成分快速裂解细胞并抑制RNase,再通过氯仿抽提、异丙醇沉淀获得高纯度RNA。实验前准备耗材:无RNase的枪头、离心管(1.5 mL EP管)、一次性手套、口罩、帽子。试剂:Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、75%乙醇(用DEPC水配制)、DEPC水。器材:4℃低温离心机、涡旋振荡器、冰盒、移液器、超净台(或干净通风区域)。细胞准备:六孔板中培养的细胞,密度适宜(通常80%~90%融合度)。
一、详细实验步骤1.细胞裂解吸除细胞培养液,用预冷的PBS轻轻洗涤细胞1~2次(去除残留培养基和血清),吸净PBS。每孔(六孔板的一个孔)加入 1 mL Trizol,室温下置于摇床或手动震荡 3~5 min,使细胞充分裂解。室温静置 10 min,促使核蛋白复合物完全解离。💡 若细胞量较少(如12孔板或96孔板),可相应减少Trizol体积(如0.5 mL),后续氯仿等按比例调整。2.氯仿抽提向裂解液中加入 250 μL 氯仿(Trizol:氯仿 = 4:1)。盖紧管盖,剧烈上下颠倒或涡旋震荡 15秒,直至溶液呈粉白色乳浊液(充分混匀)。室温静置 15 min,使水相和有机相清晰分层。
3.离心分层设置离心机为 4℃,12,000 rpm,离心 15 min。离心后,液体分为三层:上层无色水相(含RNA)、中间白色薄层(DNA/蛋白质)、下层粉色有机相(酚、氯仿)。
小心吸取上层水相(约400~500 μL)至新的无RNase EP管中,切勿触及中间层及下层。
✔️ 判断标准:吸出的液体应对光呈透明淡黄色;若呈粉红色,表明吸入了有机相,需重做。4.RNA沉淀向上清中加入 500 μL 异丙醇(体积约为水相的1倍),轻轻颠倒混匀。室温静置 15 min(推荐)或 -40℃过夜(可提高低丰度RNA产量)。5.沉淀收集4℃,12,000 rpm,离心 15 min。
离心后管底可见白色胶状沉淀(RNA)。小心弃去上清(可用移液器吸除),保留沉淀。
6.洗涤RNA加入 1 mL 75%乙醇(用DEPC水新鲜配制,预冷更佳),轻柔颠倒或轻微弹动管壁,使沉淀漂浮并得到洗涤。
⚠️ 注意:此步要紧盯白色沉淀,避免吸弃或倒弃沉淀。4℃,10,000 rpm,离心 10 min。7.干燥与溶解小心吸除全部上清(乙醇)。可短暂离心后吸尽残留液体。将EP管开盖置于干净、无尘、通风处(如超净台内)晾干,直至RNA沉淀由白色变为半透明状(约5~10分钟)。
❌ 切勿过度干燥,否则RNA难以溶解。根据沉淀大小,加入 30~50 μL DEPC水(沉淀多则加50 μL,沉淀少则加30 μL),轻轻吹打混匀,冰上溶解10~15 min,可短暂涡旋助溶。8.浓度测定与保存取1~2 μL RNA溶液,使用微量分光光度计测定浓度及纯度(OD260/280应在1.8~2.0之间,OD260/230>1.8)。RNA样品可立即用于逆转录,或分装后于 -80℃冰箱长期保存(避免反复冻融)。
二、注意事项严防RNase污染所有枪头、离心管、移液器套筒等均需无RNase认证。操作台面、移液器等用RNase清洁剂擦拭。实验全程佩戴口罩、干净手套、一次性帽子,避免口鼻、头发、皮屑污染。环境要求在人少、封闭、无气流扰动的专用区域提取RNA(最好在超净工作台中)。操作时动作轻柔,避免剧烈呼吸或交谈。关键步骤提示吸上清时宁少勿多,若吸到中间层或粉色有机相,可导致DNA/蛋白质污染。75%乙醇洗涤后,务必吸尽乙醇,否则残留会抑制下游逆转录反应。晾干时不要完全干透(RNA变白脆裂则难溶)。样品标识所有EP管务必清晰标注样品名称、日期,避免混淆。
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