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义翘神州

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[资源] 无细胞合成技术在创新药高通量筛选中的应用

传统的抗体筛选技术在获得候选序列后,需要经过繁琐的细胞培养、转染、表达等过程,实验周期长,动辄2-3个月,难以满足创新药(尤其是ai制药)的需求。因此,无细胞蛋白合成技术越来越被重视。

无细胞蛋白合成技术(cfps)不需要漫长的细胞培养周期,直接从dna模板快速生成抗体片段或全长抗体,仅需3个小时就能获得高活性目的蛋白。并且cfps还可以平行测试大量的抗体序列,适配高通量实验设计,短时间内就能筛选出具有高亲和力与高特异性的候选分子。

01 cfps在抗体筛选中的应用
hunt等人将cfps、快速dna扩增与alphalisa高通量检测相结合,建立了一套无需细胞培养、可在24小时内从序列到抗体筛选的快速平台,成功对135株已发表的抗sars-cov-2抗体与119株免疫小鼠来源的抗体进行快速功能评价,鉴定出多个候选中和抗体,其中sc2-3抗体可结合所有受试的病毒突变体。这一技术为抗体药物研发提供了快速、高通量的解决方案。
无细胞合成技术在创新药高通量筛选中的应用

无细胞抗体筛选工作流程
(源自文献:doi: 10.1038/s41467-023-38965-w)

02 cfps在酶制剂中应用
酶在化学合成、药物开发等领域发挥着关键作用。传统方法需要经过转化、培养、诱导表达及裂解等多个步骤,耗时久,严重制约了研发效率。无细胞蛋白合成系统能够直接利用线性dna模板进行蛋白质合成,快速表达大量酶突变体,同时反应体积可缩小至μl级,便于在多孔板或微流控系统中并行高通量测试。

landwehr等人开发了一个集成的高通量技术平台,将无细胞表达系统与机器学习模型深度整合,开发了“设计-构建-测试-学习”的工作流。研究人员利用cfps在体外快速完成定点饱和突变文库的构建与蛋白质合成,在24小时内生成数百至数千个序列明确的蛋白质突变体,并对1217种突变体在10953个独特化学反应中的底物偏好进行了评估,以此绘制出详细的酶适应度景观。基于这些数据,团队构建增强岭回归模型,成功预测出能够高效合成9种小分子药物的酶突变体,其活性相较于野生型提高了1.6至42倍。

无细胞合成技术在创新药高通量筛选中的应用-1
cfps与机器学习相结合的酶工程平台
(源自文献:doi: 10.1038/s41467-024-55399-0)

03 cfps在药物发现中的应用
cfps能够用于膜蛋白、多肽类、adc等药物研发过程中。gu等人通过cfps构建了原位合成膜蛋白亲和色谱(ismac),实现了pdgfrβ抑制剂的高通量筛选及药物-蛋白亲和力的测定。这一策略可推广至其他受体及酶的靶向药物筛选,同时结合位点定向突变,能够快速验证药物结合位点及药物与生物大分子相互作用。

sutro biopharma公司将cfps与非天然氨基酸定点偶联技术结合,构建了xpresscf+平台,用于开发位点特异性的新型adc。通过将带叠氮基团的pamf位点特异性插入曲妥珠单抗,该平台成功产出dar高度均一的adc。目前,sutro开发的stro-004正在进行Ⅰ期临床试验,用于评估复发性/转移性实体瘤成人患者中的安全性、药代动力学和初步抗肿瘤活性。

xpressmax™无细胞蛋白合成解决方案
义翘神州(sinobiological)自主研发的xpressmax™无细胞蛋白合成试剂盒(货号:cfkit02),无需繁琐的细胞培养或转染操作,仅需向反应体系中加入质粒或pcr产物,即可在数小时内获得具有高可溶性、高活性的目的蛋白,广泛应用于抗体药物发现、高通量筛选等多元化场景,加速候选分子的验证与优化。


【参考文献】
1. andrew c. hunt, et al. a rapid cell-free expression and screening platform for antibody discovery. nature communications, 2023. https://doi.org/10.1038/s41467-023-38965-w
2. kanghun lee, et al. cell-free biosynthesis of peptidomimetics. biotechnology and bioprocess engineering, 2022. doi 10.1007/s12257-022-0268-5
3.landwehr gm,et al. accelerated enzyme engineering by machine-learning guided cell-free expression. nat commun. 2025. doi:10.1038/s41467-024-55399-0
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