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毕合生物2024

铜虫 (正式写手)

[交流] WB阴性对照里有条带!

1 WB实验的阴性对照组出现条带,可能有哪些原因?

阴性对照出现信号,说明这套WB体系“看到了不该看的东西”。可能的原因包括:

A 上样错误:比如上样的时候突然忘了加到哪个样本,或者加串了孔。或者干脆样本制备时带入了其他组的蛋白污染。

B 设备污染:转膜槽、电泳槽、刮刀等会重复使用的器材没洗干净,残留了蛋白、样本或抗体,造成污染。

C 抗体问题:抗体浓度过高,或者特异性不好,看谁都像目标蛋白,发生了非特异性结合,粘上了别的蛋白。

D 阴性了,但没有完全阴性:所谓的“阴性对照”有时可能并非绝对阴性。比如野生型(WT)细胞可能本身就有低水平表达,或者存在正常表达的同源蛋白,或存在一些能被抗体错误识别的剪切体、修饰形式。

2 不同原因导致出现不该有的条带,条带之间亦有差别,原因可能是?

首先,我们要看看这个不该出现的条带是单阴性对照有呢,还是所有的泳道都有。然后还要看它是菀菀类目的蛋白呢,还是有一大堆杂带。

A 如果条带的位置和目的条带完全一样,只出现在个别泳道:

很可能是今天移液枪心情不好手抖上错样了。比如你阴性对照是KO细胞,结果在50kDa出了条带,还和阳性组长得一模一样——那大概率是你加错样了。

B 如果阴性对照出现了不同分子量的条带,甚至全膜都是杂带:

那更可能是抗体非特异性结合,乱认亲戚。或者是抗体浓度过高、交叉反应等原因。

C 如果所有用同一批样本制备的膜,阴性组都有一样的多余条带:

这种情况可能是样本制备的问题,比如污染,或者离心柱等提取耗材的问题。

D 如果条带很弱,但位置正确,而且跑了好几张膜一直重复出现:

这种鬼上身的情况可能就是内源性表达,样本里确实有这么一个“幽灵“。譬如KO样本的基因敲除并不完全,或者我们刚才说的野生型(WT)细胞可能本身就有低水平表达等情况。

3 如何初步排查?

发现阴性对照有无中生有的条带,先冷静分析:

A 看位置:条带和目的蛋白一样吗?一样 → 查上样和样本;不一样 → 查抗体。

B 看分布:是单个泳道还是多个?局部 → 操作失误;全膜 → 抗体或封闭问题。

C 看强度:很弱的条带更可能是背景,很强的条带基本就是加错样。

4 如何优化?

除了常规的重新配置浓度、换抗体等以外,在这里还要介绍一个二抗对照实验:不加一抗,只加二抗和底物进行孵育。如果阴性对照泳道还是有条带,说明是二抗的非特异性结合或封闭不充分所致。

WB阴性组出现条带,务必学会从条带的位置和形态中读取线索,你就能从“慌了”和“急了”变成“我悟了”。

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