24小时热门版块排行榜    

查看: 6293  |  回复: 29
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

w5student

金虫 (小有名气)

[交流] 【转帖】MS中原子对前线轨道贡献的计算实例 已有17人参与

MS作量子化学计算,和GS一样,可以计算所有原子的轨道系数

因为要用到编辑输入文件,使用关键字,所以好多人不知道

在你的输入文件里任意一行加入
print eigenvectors
然后就可以在输出文件里,就可以看到 all the MO coefficients

To do this  you need first to "save files" from the DMol3 or Castep calculation dialog, then edit the input file and finally use "run files."

看看这些轨道系数,找到你的HOMO和LUMO,就知道每一个原子对前线轨道的贡献了

对Castep只适合计算分子,不适合计算晶体。因为晶体的计算是固体物理的能带理论。


举一个简单例子:
比如利用Dmol计算水分子,想看一看每个原子对前线对前线轨道计算
1、建立水分子模型
2、打开Dmol计算对话框,设置计算,你要计算的那些性能都选上
3、点击Run运行,这是就会产生一个input文件,然后停止运行即可
4、打开input文件,在里面# Print options这一行下面(实际上任意一行都可以)写上print eigenvectors,然后保存文件
5、让input文件至于当前对话框,打开Dmol计算对话框,点击Files,然后Run File
6、查看你的outmol文件,里面就有所有原子的轨道组合系数,你就可以看出每个原子对分子轨道的贡献。找到你的HOMO、LUMO,就可以看出你的每个原子对前线轨道的贡献。



对Dmol3分子轨道计算做点补充说明,最近中国科学B化学刊登了一篇关于PbCNN结构的文章,改论文通过QM计算表明在Pb-C之间存在triple bond。我们以这个例子为研究对象,采用Dmol3这个功能进行了计算,泛函采用BLYP形式,波函数机组采用DNP,即Double numerical basis+plarized basis,数值计算精度为fine。计算过程为了反应波函数具体组合分成,输入print eigenvectors 关键词
最后得到如下计算结果:

Symmetry group of the molecule: c*v
Carbon       nbas=  1, z=   6, nrfn=  7, rcut=  9.45, e_ref= -0.042518 Ha
                                  rcore=  0.00  zval=   6.00   6.00
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=     -10.059732Ha      -273.7394eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=      -0.497867Ha       -13.5477eV
   n=2  L=1  occ= 2.00 e=      -0.190572Ha        -5.1857eV
   n=2  L=0  occ= 0.00 e=      -1.480347Ha       -40.2823eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.169346Ha       -31.8195eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -2.722222Ha       -74.0755eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -1.388876Ha       -37.7932eV  eliminated
Nitrogen     nbas=  2, z=   7, nrfn=  7, rcut=  9.45, e_ref= -0.107073 Ha
                                  rcore=  0.00  zval=   7.00   7.00
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=     -14.152027Ha      -385.0964eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=      -0.676218Ha       -18.4008eV
   n=2  L=1  occ= 3.00 e=      -0.258966Ha        -7.0468eV
   n=2  L=0  occ= 0.00 e=      -1.801528Ha       -49.0221eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.380332Ha       -37.5608eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -2.722222Ha       -74.0755eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -1.388876Ha       -37.7932eV  eliminated
Lead         nbas=  3, z=  82, nrfn= 18, rcut=  9.45, e_ref= -0.022553 Ha
                                  rcore=  0.00  zval=  82.00  82.00
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=   -2903.263585Ha    -79001.8554eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=    -489.120791Ha    -13309.6596eV
   n=2  L=1  occ= 6.00 e=    -471.031618Ha    -12817.4279eV
   n=3  L=0  occ= 2.00 e=    -116.566037Ha     -3171.9246eV
   n=3  L=1  occ= 6.00 e=    -107.955115Ha     -2937.6094eV
   n=3  L=2  occ=10.00 e=     -91.875290Ha     -2500.0549eV
   n=4  L=0  occ= 2.00 e=     -25.764798Ha      -701.0961eV
   n=4  L=1  occ= 6.00 e=     -21.985690Ha      -598.2613eV
   n=4  L=2  occ=10.00 e=     -15.007279Ha      -408.3690eV
   n=4  L=3  occ=14.00 e=      -5.554004Ha      -151.1322eV
   n=5  L=0  occ= 2.00 e=      -4.180772Ha      -113.7646eV
   n=5  L=1  occ= 6.00 e=      -2.914053Ha       -79.2954eV
   n=5  L=2  occ=10.00 e=      -0.874176Ha       -23.7876eV
   n=6  L=0  occ= 2.00 e=      -0.331833Ha        -9.0296eV
   n=6  L=1  occ= 2.00 e=      -0.117000Ha        -3.1837eV
   n=6  L=0  occ= 0.00 e=      -0.882962Ha       -24.0266eV
   n=6  L=1  occ= 0.00 e=      -0.626853Ha       -17.0575eV
   n=6  L=2  occ= 0.00 e=      -0.303391Ha        -8.2557eV

Point group symmetry c4v  symmetry orbital prototypes generated (SYMDEC)

Symmetry orbitals c4v  ! nsym ihmi icax nfmt ipr
    n  norb    representation
    1    36         a1.1
    2     8         b1.1
    3     8         b2.1
    4    21          e.1
    5    21          e.2
  total number of valence orbitals:     94
PbCNN分子结构为直线型,属于Cv类型,但DMOL3不能处理某些特殊点群,因此对于这个分子结构DMOL3按照C4v处理的。上面信息可以看到。
我们机组采用的是all electrons,即所有原子轨道群等价处理,机组信息在DMOL3输出文件里面已经写的很清楚了,如给出了主量子数n,角动量子数l以及轨道本征能量,由于是采用DN机组,因此2s轨道有两个,即n=2,l=0出现两次,同理其他轨道,其次是还有极化机组如2p增加d成分,3d增加4f的成分以改善轨道的各向异性。
通过C4v的点群分析,得到PBCNN分子分子轨道的不可约表示类型和数目,如36个A1,8个B1和21个E类型。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w5student

金虫 (小有名气)

eigenvalue       -0.270      -0.004       0.108       0.157       0.201       0.317       0.366       0.396       0.625       0.975
occupation         1.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00


Pb   1 1s 0   -0.000215   -0.000469   -0.001576   -0.001648   -0.000736    0.000471    0.000195   -0.001518   -0.000123   -0.000007
Pb   1 2s 0   -0.001343   -0.002921   -0.009816   -0.010262   -0.004580    0.002936    0.001222   -0.009453   -0.000767   -0.000051
Pb   1 3s 0   -0.004603   -0.009983   -0.033422   -0.034952   -0.015579    0.010076    0.004257   -0.032192   -0.002588   -0.000260
Pb   1 4s 0   -0.014356   -0.030775   -0.101286   -0.106063   -0.047028    0.031604    0.014177   -0.097630   -0.007557   -0.001949
Pb   1 5s 0   -0.053607   -0.108098   -0.325695   -0.343326   -0.148219    0.119304    0.066930   -0.315171   -0.019664   -0.024605
Pb   1 6s 0   -0.806382   -0.509000   -0.869983   -0.977856   -0.395221    0.560995    0.507337   -0.830296    0.126602   -0.285567
Pb   1 6s 0    0.038823    0.038624    0.991745   -0.189978    0.297281   -0.300952   -0.555163    0.005648   -0.473471    0.299077
Pb   1 2p 0   -0.000071   -0.000135   -0.000350   -0.000375   -0.000151    0.000172    0.000122   -0.000340   -0.000001   -0.000084
Pb   1 3p 0   -0.000689   -0.001298   -0.003363   -0.003604   -0.001447    0.001663    0.001191   -0.003268   -0.000005   -0.000819
Pb   1 4p 0   -0.005124   -0.009512   -0.024082   -0.025863   -0.010279    0.012312    0.009034   -0.023471   -0.000018   -0.006256
Pb   1 5p 0   -0.048177   -0.083307   -0.183787   -0.199123   -0.075514    0.113068    0.092260   -0.181354    0.001865   -0.064170
Pb   1 6p 0    0.391035   -1.064457   -0.750253   -0.936443   -0.357132    0.828233    0.889180   -0.703783    0.348183   -0.532266
Pb   1 6p 0    0.053570    0.175959    0.351846    0.543916   -0.645261    0.106339   -0.424835   -0.404975   -0.605047    0.252786
Pb   1 3d 0   -0.000059   -0.000094   -0.000183   -0.000197   -0.000063    0.000144    0.000122   -0.000184   -0.000011   -0.000089
Pb   1 4d 0   -0.001466   -0.002321   -0.004303   -0.004633   -0.001456    0.003569    0.003067   -0.004354   -0.000304   -0.002234
Pb   1 5d 0   -0.095778   -0.103413   -0.119796   -0.138088   -0.031641    0.149072    0.142711   -0.128392   -0.004681   -0.091288
Pb   1 6d 0    0.045886    0.328729   -0.289155   -0.872217   -0.248767    0.873245    0.961330   -0.231146    0.381793   -0.421805
Pb   1 4f 0   -0.000907   -0.001134   -0.001537   -0.001624   -0.000225    0.001996    0.001848   -0.001737   -0.000653   -0.001218
C    2 1s 0    0.008591    0.048923   -0.058307   -0.034712   -0.073554   -0.352634   -0.242651   -0.236120   -0.032242   -0.025205
C    2 2s 0    0.446198    0.705086   -0.280494    0.064096   -0.064019   -2.089162   -1.453099   -1.252611   -0.514293    0.145096
C    2 2s 0   -0.027908   -0.101434    0.146324    0.064646    0.181109    0.583288    0.571529    0.319575    0.547921   -0.858142
C    2 2p 0   -0.308533   -0.358563   -1.243363   -1.104227   -0.333702    0.141496    0.017171   -1.855548   -0.730173   -0.217615
C    2 2p 0   -0.024444    0.093319    0.878143    0.890307    0.529816    0.105536    0.338579    0.703795    0.225262   -0.638990
C    2 3d 0   -0.007692   -0.022885    0.021864   -0.021971   -0.066244   -0.012955   -0.041213   -0.009210    0.158899    0.061964
N    3 1s 0   -0.008000   -0.017928    0.167258    0.074014   -0.083873   -0.186240    0.258968    0.188886    0.062183    0.017023
N    3 2s 0   -0.146461   -0.223740    1.062126    0.350673   -0.763468   -1.048249    1.400595    1.418059    0.328613    0.067169
N    3 2s 0    0.005407    0.011504   -0.323729   -0.130977    0.155112    0.418059   -0.304558   -0.290916   -0.033112   -0.079261
N    3 2p 0    0.113150   -0.032620   -0.786342   -0.964253   -0.707165   -1.368678    0.223497   -1.133403    0.045129   -1.138736
N    3 2p 0    0.048966    0.138684    0.483524    0.734151    0.624687    0.843271   -0.023952    1.044047   -0.952418    0.388803
N    3 3d 0    0.002201    0.016132    0.031883    0.062304    0.088235   -0.026607    0.124767   -0.142504    0.032375    0.027471
N    4 1s 0    0.002041    0.027746    0.085843    0.160534    0.174526    0.287620   -0.099363    0.176019   -0.074664    0.087975
N    4 2s 0   -0.008159    0.198331    0.532658    1.035563    1.188121    1.807736   -0.677800    0.861318   -0.226987    0.395122
N    4 2s 0   -0.003071   -0.052581   -0.171657   -0.281936   -0.271890   -0.541472    0.394684   -0.333170   -0.064618    0.450285
N    4 2p 0   -0.111070   -0.139437   -0.041759   -0.366807   -0.664352   -0.938490    0.693687    0.211572   -0.438938   -0.051119
N    4 2p 0   -0.004360    0.025276    0.050436    0.180698    0.297580    0.948081   -0.839838    0.455074    0.097901   -0.721704
N    4 3d 0    0.005728    0.004314    0.010720    0.019933    0.008659    0.027904    0.019500    0.116874   -0.169805   -0.036178

eigenvalue        1.157       1.535       1.829       2.198       2.546       4.028
occupation         0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00


Pb   1 1s 0   -0.006325    0.001014   -0.000776    0.002138   -0.000140   -0.001179
Pb   1 2s 0   -0.039382    0.006305   -0.004840    0.013316   -0.000866   -0.007331
Pb   1 3s 0   -0.134131    0.021294   -0.016587    0.045444   -0.002848   -0.024833
Pb   1 4s 0   -0.406974    0.062244   -0.051670    0.139126   -0.007294   -0.073544
Pb   1 5s 0   -1.311311    0.165372   -0.184570    0.467608   -0.003304   -0.209828
Pb   1 6s 0   -3.500289    0.073364   -0.556385    1.290089    0.077565   -0.373648
Pb   1 6s 0    1.064711    0.283568    0.109339   -0.314328   -0.011467    0.026767
Pb   1 2p 0   -0.001460    0.000067   -0.000274    0.000564    0.000055   -0.000157
Pb   1 3p 0   -0.014018    0.000624   -0.002643    0.005434    0.000541   -0.001486
Pb   1 4p 0   -0.100236    0.003762   -0.019213    0.039488    0.004405   -0.009947
Pb   1 5p 0   -0.751178    0.000583   -0.154202    0.317725    0.051694   -0.050188
Pb   1 6p 0   -3.052634   -0.388059   -0.576638    1.208182    0.197580   -0.086956
Pb   1 6p 0    0.362843    0.275750   -0.057555   -0.018507    0.037098   -0.014329
Pb   1 3d 0   -0.000748   -0.000058   -0.000218    0.000373    0.000104    0.000007
Pb   1 4d 0   -0.017360   -0.001583   -0.005166    0.008996    0.002699    0.000456
Pb   1 5d 0   -0.417660   -0.083415   -0.132382    0.249614    0.090683    0.044524
Pb   1 6d 0   -1.140056   -0.447036   -0.276269    0.497131    0.147950    0.109642
Pb   1 4f 0   -0.004627   -0.001130   -0.002012    0.004383    0.002130    0.001472
C    2 1s 0   -0.006326    0.791762    0.998959    0.076767   -0.273222   -0.808528
C    2 2s 0    0.614608    4.424625    5.237719   -0.121531   -1.636295   -3.795518
C    2 2s 0   -1.403464   -2.187276   -2.209993    0.509685    0.752262    0.839596
C    2 2p 0   -3.631828    2.187264    0.997602    1.097136   -0.831246   -2.667038
C    2 2p 0    3.068524   -1.423092   -0.057666   -0.892039    0.349331    0.773009
C    2 3d 0   -0.209194    0.135255    0.101068   -0.928796   -0.716920   -0.792000
N    3 1s 0    0.299066   -0.779692    0.368579    0.235064   -0.228415    0.996024
N    3 2s 0    1.810774   -4.851545    2.073946    0.799072   -0.983441    6.062178
N    3 2s 0   -1.106930    3.417787   -1.050156    0.409484    0.120782   -2.968144
N    3 2p 0   -1.611173    1.373277    5.310225    0.886721   -1.989026   -0.539507
N    3 2p 0    1.141438   -1.185296   -4.554766   -0.895830    0.436511    0.528195
N    3 3d 0   -0.097863    0.151386    0.107439   -0.320644   -0.024596    1.887728
N    4 1s 0    0.226233    0.087949   -1.085947   -0.160292    0.313070   -0.525249
N    4 2s 0    1.444794    0.616939   -6.325963   -1.204328    2.080677   -2.545967
N    4 2s 0   -1.179419   -0.554126    3.749126    0.973805   -1.250613    0.609137
N    4 2p 0   -0.503002   -0.659461    2.160974    0.615980   -1.392883    1.730846
N    4 2p 0    0.268474    0.708498   -1.077237   -0.511509    0.742518   -0.373331
N    4 3d 0   -0.129939    0.092432    0.024795   -0.615399    1.147032   -0.608347

由于PbCNN没有磁性,因此alfa和beta的eigenvectors完全一样,分析的时候只要看一个通道就可以了。
6楼2009-11-18 09:56:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答

w5student

金虫 (小有名气)

计算过程中只计算了PbCNN的前沿分子轨道,即LUMIO和HUMO附近的轨道,计算采用开层机组,即自旋不同去向的电子完全分开处理。这样子输出的eigenvectors总共有两组,在DMOL3里面按照alfa和beta称呼;如:
Alpha orbitals, symmetry block   1     a1.1
  Degeneracy:   1  Size:  36

eigenvalue    -2903.291    -489.148    -471.059    -116.594    -107.982     -91.903     -25.794     -22.013     -15.035     -14.115
occupation         1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00

Pb   1 1s 0    1.000001    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000
Pb   1 2s 0    0.000000    1.000000   -0.000026    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003
Pb   1 3s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -1.000000    0.000046    0.000034    0.000003    0.000003   -0.000004   -0.000010
Pb   1 4s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002   -0.000003   -0.000002   -0.999998    0.000575   -0.000198   -0.000031
Pb   1 5s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000001    0.000000   -0.000007   -0.000063    0.000073   -0.000097
Pb   1 6s 0    0.000000    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000020    0.000014    0.000012   -0.000232
Pb   1 6s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000008   -0.000016    0.000042
Pb   1 2p 0    0.000000    0.000026    1.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000
Pb   1 3p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000046   -1.000000    0.000001    0.000003    0.000000    0.000002   -0.000001
Pb   1 4p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003    0.000000    0.000002   -0.000574   -1.000000    0.000202   -0.000007
Pb   1 5p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000034    0.000006   -0.000091   -0.000049
Pb   1 6p 0    0.000000    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000022    0.000003    0.000035   -0.000169
Pb   1 6p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000010   -0.000004    0.000013   -0.000006
Pb   1 3d 0    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000034    0.000001    1.000000   -0.000002    0.000002    0.000001    0.000000
Pb   1 4d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000005   -0.000002    0.000001    0.000200   -0.000202   -1.000000   -0.000001
Pb   1 5d 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000012   -0.000031    0.000000   -0.000025
Pb   1 6d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000002    0.000012    0.000011   -0.000048
Pb   1 4f 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000002    0.000006    0.000002    0.000028    0.000106   -0.000170    0.000000
C    2 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002   -0.000001   -0.000004    0.000012
C    2 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000011   -0.000007   -0.000023    0.000001
C    2 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000006    0.000003    0.000013    0.000164
C    2 2p 0   -0.000001    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000019   -0.000001    0.000019   -0.000237
C    2 2p 0    0.000000   -0.000001    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000014    0.000001   -0.000014    0.000381
C    2 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003    0.000002   -0.000001    0.000043
N    3 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000001   -0.000001   -1.000004
N    3 2s 0    0.000000   -0.000001    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000012    0.000004   -0.000008   -0.000642
N    3 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000007   -0.000002    0.000004   -0.000447
N    3 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000004    0.000002   -0.000002   -0.000417
N    3 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000004   -0.000002    0.000002    0.000032
N    3 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000615
N    4 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001   -0.000001    0.000001   -0.004524
N    4 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000005   -0.000004    0.000003    0.000489
N    4 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000002   -0.000001   -0.000049
N    4 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000002   -0.000001   -0.000287
N    4 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001   -0.000001    0.000000    0.000016
N    4 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000085

eigenvalue      -14.049      -9.935      -5.582      -4.211      -2.941      -0.981      -0.909      -0.751      -0.443      -0.373
occupation         1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00

Pb   1 1s 0   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001   -0.000033   -0.000014   -0.000070   -0.000175    0.000065
Pb   1 2s 0   -0.000005   -0.000002    0.000001   -0.000001    0.000005   -0.000207   -0.000085   -0.000437   -0.001090    0.000402
Pb   1 3s 0   -0.000016   -0.000006    0.000005   -0.000003    0.000017   -0.000704   -0.000297   -0.001495   -0.003745    0.001371
Pb   1 4s 0   -0.000048   -0.000020    0.000036    0.000006    0.000008   -0.002138   -0.000956   -0.004613   -0.011813    0.004180
Pb   1 5s 0   -0.000150   -0.000074   -0.000056   -0.999991   -0.006868   -0.007073   -0.003108   -0.016648   -0.046660    0.013934
Pb   1 6s 0   -0.000313   -0.000166    0.000065   -0.000131    0.001004   -0.013979   -0.001240   -0.002760    0.556752   -0.176979
Pb   1 6s 0    0.000000   -0.000027    0.000014   -0.000028    0.000595    0.006438    0.002079    0.008658    0.047226   -0.016844
Pb   1 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000007   -0.000007   -0.000019   -0.000065    0.000016
2楼2009-11-18 09:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w5student

金虫 (小有名气)

Pb   1 3p 0   -0.000001   -0.000001    0.000007   -0.000001    0.000000   -0.000070   -0.000066   -0.000184   -0.000635    0.000152
Pb   1 4p 0   -0.000010   -0.000008    0.000108    0.000063    0.000006   -0.000506   -0.000540   -0.001356   -0.004753    0.001105
Pb   1 5p 0   -0.000070   -0.000065   -0.000313   -0.006959    0.999899   -0.004483   -0.010067   -0.012952   -0.048206    0.009334
Pb   1 6p 0   -0.000167   -0.000123    0.000051   -0.000089   -0.000015   -0.011888    0.002604   -0.005100    0.114560    0.013067
Pb   1 6p 0   -0.000079   -0.000095    0.000051   -0.000048    0.000096    0.004414    0.006003    0.004380    0.053163   -0.012463
Pb   1 3d 0    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000000    0.000000   -0.000004   -0.000007   -0.000013   -0.000060    0.000010
Pb   1 4d 0   -0.000002   -0.000003   -0.000169   -0.000064   -0.000101   -0.000089   -0.000199   -0.000339   -0.001522    0.000251
Pb   1 5d 0   -0.000025   -0.000052    0.000358    0.001275    0.004233    0.018240    0.987400   -0.062027   -0.119149    0.011756
Pb   1 6d 0    0.000001   -0.000010   -0.000072   -0.000200   -0.000449   -0.004661   -0.002852   -0.001816    0.004956    0.010180
Pb   1 4f 0    0.000000   -0.000001    1.000000   -0.000082    0.000317   -0.000046   -0.000506   -0.000176   -0.001011    0.000137
C    2 1s 0    0.000018    1.000604    0.000002    0.000070   -0.000370   -0.025865   -0.005991   -0.031694    0.002655    0.015746
C    2 2s 0    0.000170    0.003736    0.000051   -0.000350    0.001802    0.078289    0.067898    0.463982    0.492064    0.158145
C    2 2s 0   -0.000195   -0.000630   -0.000012   -0.000009    0.000059    0.020385    0.003234    0.014639   -0.028738   -0.023129
C    2 2p 0   -0.000740    0.002131    0.000096    0.000060   -0.000413    0.046109   -0.035041    0.195024   -0.316178    0.173721
C    2 2p 0    0.000420    0.000534   -0.000085    0.000198   -0.001202    0.042013   -0.012167    0.095339   -0.068414   -0.002376
C    2 3d 0   -0.000198    0.000877   -0.000002   -0.000216    0.000697    0.011237    0.008082    0.031459    0.002267    0.005989
N    3 1s 0    0.005386   -0.000568   -0.000019    0.000027   -0.000223   -0.042286    0.000538   -0.003266   -0.006373   -0.004531
N    3 2s 0    0.003421   -0.002180   -0.000116    0.000140   -0.001258    0.587172   -0.011543    0.332116   -0.247314   -0.254602
N    3 2s 0   -0.001346    0.000928    0.000061   -0.000048    0.000574    0.045681   -0.000714    0.002088    0.004379   -0.001417
N    3 2p 0    0.002045    0.002080   -0.000013   -0.000190    0.000016    0.108831   -0.010677   -0.382817    0.101251   -0.175834
N    3 2p 0   -0.001196   -0.001530    0.000018    0.000111    0.000133    0.073837   -0.007473   -0.182701    0.010477   -0.148599
N    3 3d 0    0.000743   -0.000441   -0.000004    0.000036   -0.000125    0.034496   -0.001339    0.005245   -0.000596    0.003109
N    4 1s 0   -1.000586   -0.000127    0.000008    0.000020    0.000078   -0.032842    0.000895    0.002727    0.003682    0.012667
N    4 2s 0   -0.003599   -0.000768    0.000041    0.000134    0.000383    0.441825   -0.023415   -0.427616    0.204500    0.663171
N    4 2s 0    0.001204    0.000473   -0.000014   -0.000094   -0.000112    0.026813    0.000336    0.011988   -0.006973   -0.027607
N    4 2p 0    0.002696   -0.000127   -0.000018   -0.000043   -0.000200   -0.215594    0.009983    0.134412    0.066942    0.587990
N    4 2p 0    0.000423    0.000074    0.000007    0.000043    0.000070   -0.065708    0.002292    0.029605    0.003938    0.042314
N    4 3d 0   -0.000677    0.000145    0.000002    0.000002    0.000040    0.028367   -0.001120   -0.014216   -0.004585   -0.037661

eigenvalue       -0.270      -0.004       0.108       0.157       0.201       0.317       0.366       0.396       0.625       0.975
occupation         1.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00

Pb   1 1s 0   -0.000215   -0.000469   -0.001576   -0.001648   -0.000736    0.000471    0.000195   -0.001518   -0.000123   -0.000007
Pb   1 2s 0   -0.001343   -0.002921   -0.009816   -0.010262   -0.004580    0.002936    0.001222   -0.009453   -0.000767   -0.000051
Pb   1 3s 0   -0.004603   -0.009983   -0.033422   -0.034952   -0.015579    0.010076    0.004257   -0.032192   -0.002588   -0.000260
Pb   1 4s 0   -0.014356   -0.030775   -0.101287   -0.106062   -0.047028    0.031604    0.014177   -0.097630   -0.007557   -0.001949
Pb   1 5s 0   -0.053607   -0.108098   -0.325695   -0.343325   -0.148218    0.119304    0.066931   -0.315171   -0.019664   -0.024605
Pb   1 6s 0   -0.806382   -0.509000   -0.869985   -0.977854   -0.395219    0.560994    0.507338   -0.830297    0.126602   -0.285567
Pb   1 6s 0    0.038823    0.038624    0.991744   -0.189980    0.297281   -0.300951   -0.555163    0.005647   -0.473471    0.299077
Pb   1 2p 0   -0.000071   -0.000135   -0.000350   -0.000375   -0.000151    0.000172    0.000122   -0.000340   -0.000001   -0.000084
Pb   1 3p 0   -0.000689   -0.001298   -0.003363   -0.003604   -0.001447    0.001663    0.001191   -0.003268   -0.000005   -0.000819
Pb   1 4p 0   -0.005124   -0.009512   -0.024082   -0.025862   -0.010279    0.012312    0.009034   -0.023471   -0.000018   -0.006256
Pb   1 5p 0   -0.048177   -0.083307   -0.183788   -0.199123   -0.075514    0.113068    0.092261   -0.181354    0.001865   -0.064170
Pb   1 6p 0    0.391035   -1.064457   -0.750256   -0.936441   -0.357130    0.828232    0.889182   -0.703783    0.348183   -0.532266
Pb   1 6p 0    0.053570    0.175959    0.351847    0.543914   -0.645262    0.106339   -0.424835   -0.404975   -0.605047    0.252786
Pb   1 3d 0   -0.000059   -0.000094   -0.000183   -0.000197   -0.000063    0.000144    0.000122   -0.000184   -0.000011   -0.000089
Pb   1 4d 0   -0.001466   -0.002321   -0.004303   -0.004633   -0.001456    0.003569    0.003067   -0.004354   -0.000304   -0.002234
Pb   1 5d 0   -0.095778   -0.103413   -0.119796   -0.138088   -0.031641    0.149072    0.142711   -0.128392   -0.004681   -0.091288
Pb   1 6d 0    0.045885    0.328729   -0.289157   -0.872216   -0.248766    0.873244    0.961331   -0.231146    0.381793   -0.421805
Pb   1 4f 0   -0.000907   -0.001134   -0.001537   -0.001624   -0.000225    0.001996    0.001849   -0.001737   -0.000653   -0.001218
C    2 1s 0    0.008591    0.048923   -0.058307   -0.034712   -0.073554   -0.352634   -0.242651   -0.236120   -0.032242   -0.025204
C    2 2s 0    0.446198    0.705086   -0.280494    0.064095   -0.064020   -2.089160   -1.453100   -1.252611   -0.514293    0.145097
C    2 2s 0   -0.027908   -0.101433    0.146324    0.064646    0.181109    0.583287    0.571529    0.319575    0.547921   -0.858142
C    2 2p 0   -0.308533   -0.358562   -1.243367   -1.104223   -0.333700    0.141495    0.017172   -1.855548   -0.730173   -0.217615
C    2 2p 0   -0.024444    0.093319    0.878145    0.890305    0.529815    0.105535    0.338578    0.703796    0.225262   -0.638990
C    2 3d 0   -0.007692   -0.022885    0.021864   -0.021971   -0.066244   -0.012955   -0.041213   -0.009210    0.158899    0.061965
N    3 1s 0   -0.008000   -0.017928    0.167259    0.074013   -0.083873   -0.186240    0.258968    0.188887    0.062183    0.017023
N    3 2s 0   -0.146461   -0.223741    1.062128    0.350670   -0.763469   -1.048249    1.400593    1.418060    0.328613    0.067170
N    3 2s 0    0.005407    0.011504   -0.323729   -0.130976    0.155113    0.418059   -0.304557   -0.290916   -0.033112   -0.079261
N    3 2p 0    0.113150   -0.032620   -0.786344   -0.964252   -0.707164   -1.368678    0.223496   -1.133403    0.045128   -1.138735
N    3 2p 0    0.048966    0.138684    0.483526    0.734150    0.624686    0.843271   -0.023952    1.044047   -0.952418    0.388802
N    3 3d 0    0.002201    0.016132    0.031883    0.062304    0.088235   -0.026608    0.124767   -0.142504    0.032375    0.027471
N    4 1s 0    0.002041    0.027746    0.085843    0.160534    0.174526    0.287620   -0.099363    0.176019   -0.074664    0.087975
N    4 2s 0   -0.008159    0.198331    0.532661    1.035563    1.188120    1.807735   -0.677799    0.861317   -0.226987    0.395121
N    4 2s 0   -0.003071   -0.052580   -0.171658   -0.281936   -0.271890   -0.541472    0.394683   -0.333169   -0.064618    0.450286
N    4 2p 0   -0.111070   -0.139437   -0.041760   -0.366808   -0.664352   -0.938490    0.693686    0.211573   -0.438938   -0.051118
N    4 2p 0   -0.004360    0.025276    0.050436    0.180699    0.297579    0.948081   -0.839837    0.455073    0.097901   -0.721704
N    4 3d 0    0.005728    0.004314    0.010720    0.019933    0.008659    0.027904    0.019500    0.116874   -0.169805   -0.036178
3楼2009-11-18 09:53:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w5student

金虫 (小有名气)

eigenvalue        1.157       1.535       1.829       2.198       2.546       4.028
occupation         0.00        0.00        0.00        0.00        0.00        0.00

Pb   1 1s 0   -0.006325    0.001014   -0.000776    0.002138   -0.000140   -0.001179
Pb   1 2s 0   -0.039382    0.006305   -0.004840    0.013316   -0.000866   -0.007331
Pb   1 3s 0   -0.134131    0.021294   -0.016587    0.045444   -0.002848   -0.024833
Pb   1 4s 0   -0.406974    0.062244   -0.051670    0.139126   -0.007294   -0.073544
Pb   1 5s 0   -1.311311    0.165373   -0.184570    0.467608   -0.003304   -0.209828
Pb   1 6s 0   -3.500289    0.073364   -0.556386    1.290089    0.077565   -0.373648
Pb   1 6s 0    1.064711    0.283568    0.109339   -0.314328   -0.011467    0.026767
Pb   1 2p 0   -0.001460    0.000067   -0.000274    0.000564    0.000055   -0.000157
Pb   1 3p 0   -0.014018    0.000624   -0.002643    0.005434    0.000541   -0.001486
Pb   1 4p 0   -0.100236    0.003763   -0.019213    0.039488    0.004405   -0.009947
Pb   1 5p 0   -0.751178    0.000583   -0.154202    0.317725    0.051694   -0.050188
Pb   1 6p 0   -3.052634   -0.388058   -0.576638    1.208182    0.197580   -0.086956
Pb   1 6p 0    0.362843    0.275750   -0.057555   -0.018507    0.037098   -0.014329
Pb   1 3d 0   -0.000748   -0.000058   -0.000218    0.000373    0.000104    0.000007
Pb   1 4d 0   -0.017360   -0.001583   -0.005166    0.008996    0.002699    0.000456
Pb   1 5d 0   -0.417660   -0.083415   -0.132382    0.249614    0.090683    0.044524
Pb   1 6d 0   -1.140056   -0.447036   -0.276269    0.497131    0.147950    0.109642
Pb   1 4f 0   -0.004627   -0.001130   -0.002012    0.004383    0.002130    0.001472
C    2 1s 0   -0.006326    0.791762    0.998959    0.076767   -0.273222   -0.808528
C    2 2s 0    0.614608    4.424624    5.237719   -0.121532   -1.636295   -3.795518
C    2 2s 0   -1.403464   -2.187275   -2.209993    0.509685    0.752262    0.839596
C    2 2p 0   -3.631827    2.187264    0.997602    1.097136   -0.831246   -2.667038
C    2 2p 0    3.068524   -1.423093   -0.057666   -0.892039    0.349331    0.773009
C    2 3d 0   -0.209194    0.135255    0.101068   -0.928796   -0.716920   -0.792000
N    3 1s 0    0.299065   -0.779693    0.368579    0.235064   -0.228414    0.996024
N    3 2s 0    1.810772   -4.851546    2.073946    0.799072   -0.983440    6.062178
N    3 2s 0   -1.106929    3.417787   -1.050156    0.409484    0.120782   -2.968144
N    3 2p 0   -1.611174    1.373277    5.310226    0.886720   -1.989025   -0.539507
N    3 2p 0    1.141439   -1.185296   -4.554767   -0.895829    0.436510    0.528195
N    3 3d 0   -0.097863    0.151386    0.107439   -0.320644   -0.024596    1.887728
N    4 1s 0    0.226233    0.087949   -1.085947   -0.160292    0.313070   -0.525249
N    4 2s 0    1.444795    0.616939   -6.325964   -1.204327    2.080676   -2.545967
N    4 2s 0   -1.179420   -0.554126    3.749126    0.973804   -1.250612    0.609137
N    4 2p 0   -0.503003   -0.659461    2.160975    0.615980   -1.392882    1.730846
N    4 2p 0    0.268475    0.708499   -1.077237   -0.511508    0.742517   -0.373331
N    4 3d 0   -0.129939    0.092432    0.024794   -0.615399    1.147032   -0.608347
这个是属于A1的36个分子轨道组成的36×36的矩阵,属于alfa自旋通道;
beta如下:
Beta orbitals, symmetry block   1     a1.1
  Degeneracy:   1  Size:  36

eigenvalue    -2903.291    -489.148    -471.059    -116.594    -107.982     -91.903     -25.794     -22.013     -15.035     -14.115
occupation         1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00        1.00


Pb   1 1s 0    1.000001    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000
Pb   1 2s 0    0.000000    1.000000   -0.000026    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003
Pb   1 3s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -1.000000    0.000046    0.000034    0.000003    0.000003   -0.000004   -0.000010
Pb   1 4s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002   -0.000003   -0.000002   -0.999998    0.000575   -0.000198   -0.000031
Pb   1 5s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000001    0.000000   -0.000007   -0.000063    0.000073   -0.000097
Pb   1 6s 0    0.000000    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000020    0.000014    0.000012   -0.000232
Pb   1 6s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000008   -0.000016    0.000042
Pb   1 2p 0    0.000000    0.000026    1.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000
Pb   1 3p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000046   -1.000000    0.000001    0.000003    0.000000    0.000002   -0.000001
Pb   1 4p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003    0.000000    0.000002   -0.000574   -1.000000    0.000202   -0.000007
Pb   1 5p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000034    0.000006   -0.000091   -0.000049
Pb   1 6p 0    0.000000    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000022    0.000003    0.000035   -0.000169
Pb   1 6p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000010   -0.000004    0.000013   -0.000006
Pb   1 3d 0    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000034    0.000001    1.000000   -0.000002    0.000002    0.000001    0.000000
Pb   1 4d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000005   -0.000002    0.000001    0.000200   -0.000202   -1.000000   -0.000001
Pb   1 5d 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000012   -0.000031    0.000000   -0.000025
Pb   1 6d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000002    0.000012    0.000011   -0.000048
Pb   1 4f 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000002    0.000006    0.000002    0.000028    0.000106   -0.000170    0.000000
C    2 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002   -0.000001   -0.000004    0.000012
C    2 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000011   -0.000007   -0.000023    0.000001
C    2 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000006    0.000003    0.000013    0.000164
C    2 2p 0   -0.000001    0.000001    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000    0.000019   -0.000001    0.000019   -0.000237
C    2 2p 0    0.000000   -0.000001    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000014    0.000001   -0.000014    0.000381
C    2 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000003    0.000002   -0.000001    0.000043
N    3 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000001   -0.000001   -1.000004
N    3 2s 0    0.000000   -0.000001    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000   -0.000012    0.000004   -0.000008   -0.000642
N    3 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000007   -0.000002    0.000004   -0.000447
N    3 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000004    0.000002   -0.000002   -0.000417
N    3 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000004   -0.000002    0.000002    0.000032
N    3 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000615
N    4 1s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001   -0.000001    0.000001   -0.004524
N    4 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000001    0.000000    0.000000    0.000005   -0.000004    0.000003    0.000489
N    4 2s 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000002   -0.000001   -0.000049
N    4 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000   -0.000002    0.000002   -0.000001   -0.000287
N    4 2p 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000001   -0.000001    0.000000    0.000016
N    4 3d 0    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000085
4楼2009-11-18 09:54:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见